基于線粒體ND2基因序列的華南地區(qū)斑鱧遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-08-04 20:16
斑鱧(Channa maculata)主要分布于我國(guó)長(zhǎng)江以南,包括海南島及臺(tái)灣島等。斑鱧的生長(zhǎng)速度快,并具有獨(dú)特的藥用價(jià)值和營(yíng)養(yǎng)價(jià)值,已經(jīng)越來(lái)越受到人們的青睞,是人們餐桌上常見(jiàn)的佳肴。但近些年來(lái),由于水利工程建設(shè)、過(guò)度捕撈、水域環(huán)境污染和不合理的人工養(yǎng)殖等影響,導(dǎo)致野生斑鱧的數(shù)量越來(lái)越少,種質(zhì)資源嚴(yán)重退化。 本研究測(cè)定了珠江、漠陽(yáng)江、南流江、南渡江、昌化江和萬(wàn)泉河6個(gè)水系14個(gè)地點(diǎn)132尾斑鱧的線粒體ND2基因序列,分析不同地理群體的遺傳多樣性、遺傳分化水平及種群歷史動(dòng)態(tài)等,客觀評(píng)價(jià)中國(guó)野生斑鱧的遺傳背景,為種質(zhì)資源的開(kāi)發(fā)、保護(hù)和利用提供科學(xué)依據(jù),具體實(shí)驗(yàn)結(jié)果如下: 1、線粒體ND2序列特征。斑鱧ND2基因全序列1044bp中,其中保守位點(diǎn)975個(gè),變異位點(diǎn)66個(gè),單堿基變異位點(diǎn)44個(gè),簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)22個(gè)。A、T、G、C四種堿基組成分別是27.1%、23.8%、12.2%、36.9%。A+T的含量為50.9%,G+C的含量為49.1%,A+T的含量明顯高于G+C的含量,與大多數(shù)魚(yú)類堿基組成相似。 2、遺傳多樣性和遺傳分化。132個(gè)ND2序列中共檢測(cè)到36個(gè)單倍型,其中共享單倍型有15個(gè)...
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
1.1 斑鱧的研究概述
1.1.1 斑鱧的形態(tài)特征
1.1.2 斑鱧的習(xí)性和食性
1.1.3 斑鱧的應(yīng)用價(jià)值
1.1.4 斑鱧的人工養(yǎng)殖及疾病防治
1.1.5 斑鱧的研究現(xiàn)狀
1.2 魚(yú)類遺傳多樣性的研究
1.2.1 遺傳多樣性的介紹
1.2.2 遺傳多樣性的研究方法
1.3 線粒體 DNA 分子標(biāo)記
1.3.1 線粒體 DNA 標(biāo)記的遺傳特征
1.3.2 線粒體分子標(biāo)記在遺傳學(xué)中的應(yīng)用
1.4 所涉及的水系概況
1.5 本研究的目的和意義
第二章 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料來(lái)源與處理
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料來(lái)源
2.1.2 樣品處理
2.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
2.2.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 實(shí)驗(yàn)試劑的配制
2.3.2 DNA 的提取
2.3.3 DNA 的檢測(cè)
2.3.4 PCR 擴(kuò)增
2.3.5 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)與測(cè)序
2.4 數(shù)據(jù)處理
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 斑鱧線粒體 ND2 基因的序列特征
3.2 斑鱧的系統(tǒng)發(fā)育
3.2.1 斑鱧單倍型的分布
3.2.2 斑鱧的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.2.3 斑鱧單倍型間的 TCS 網(wǎng)絡(luò)圖
3.3 斑鱧群體遺傳多樣性分析
3.3.1 6 個(gè)水系斑鱧遺傳多樣性分析
3.3.2 珠江水系斑鱧遺傳多樣性分析
3.3.3 海南島斑鱧遺傳多樣性分析
3.4 斑鱧的遺傳分化
3.4.1 6 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化
3.4.2 珠江水系的斑鱧群體間遺傳分化及分子變異
3.4.3 海南島 3 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化及遺傳變異
3.4.4 珠江與南渡江水系的斑鱧群體間遺傳分化及遺傳變異
3.5 種群動(dòng)態(tài)
3.5.1 中性檢驗(yàn)
3.5.2 斑鱧群體岐點(diǎn)分析
第四章 討論
4.1 斑鱧遺傳多樣性分析
4.1.1 6 個(gè)水系斑鱧群體的遺傳多樣性
4.1.2 珠江水系各群體間的遺傳多樣性
4.1.3 海南島 3 個(gè)水系群體的遺傳多樣性
4.1.4 南渡江水系群體的遺傳多樣性
4.2 斑鱧的遺傳變異
4.2.1 6 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化
4.2.2 珠江水系各群體間的遺傳分化
4.2.3 海南島 3 個(gè)水系各群體間的遺傳分化
4.2.4 珠江水系與南渡江水系之間的遺傳分化
4.3 斑鱧的種群動(dòng)態(tài)分析
4.4 斑鱧的保護(hù)
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞
在校期間發(fā)表論文
致謝
本文編號(hào):3838930
【文章頁(yè)數(shù)】:72 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
目錄
第一章 前言
1.1 斑鱧的研究概述
1.1.1 斑鱧的形態(tài)特征
1.1.2 斑鱧的習(xí)性和食性
1.1.3 斑鱧的應(yīng)用價(jià)值
1.1.4 斑鱧的人工養(yǎng)殖及疾病防治
1.1.5 斑鱧的研究現(xiàn)狀
1.2 魚(yú)類遺傳多樣性的研究
1.2.1 遺傳多樣性的介紹
1.2.2 遺傳多樣性的研究方法
1.3 線粒體 DNA 分子標(biāo)記
1.3.1 線粒體 DNA 標(biāo)記的遺傳特征
1.3.2 線粒體分子標(biāo)記在遺傳學(xué)中的應(yīng)用
1.4 所涉及的水系概況
1.5 本研究的目的和意義
第二章 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料來(lái)源與處理
2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料來(lái)源
2.1.2 樣品處理
2.2 實(shí)驗(yàn)儀器與試劑
2.2.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
2.3 實(shí)驗(yàn)方法
2.3.1 實(shí)驗(yàn)試劑的配制
2.3.2 DNA 的提取
2.3.3 DNA 的檢測(cè)
2.3.4 PCR 擴(kuò)增
2.3.5 PCR 產(chǎn)物檢測(cè)與測(cè)序
2.4 數(shù)據(jù)處理
第三章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
3.1 斑鱧線粒體 ND2 基因的序列特征
3.2 斑鱧的系統(tǒng)發(fā)育
3.2.1 斑鱧單倍型的分布
3.2.2 斑鱧的系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
3.2.3 斑鱧單倍型間的 TCS 網(wǎng)絡(luò)圖
3.3 斑鱧群體遺傳多樣性分析
3.3.1 6 個(gè)水系斑鱧遺傳多樣性分析
3.3.2 珠江水系斑鱧遺傳多樣性分析
3.3.3 海南島斑鱧遺傳多樣性分析
3.4 斑鱧的遺傳分化
3.4.1 6 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化
3.4.2 珠江水系的斑鱧群體間遺傳分化及分子變異
3.4.3 海南島 3 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化及遺傳變異
3.4.4 珠江與南渡江水系的斑鱧群體間遺傳分化及遺傳變異
3.5 種群動(dòng)態(tài)
3.5.1 中性檢驗(yàn)
3.5.2 斑鱧群體岐點(diǎn)分析
第四章 討論
4.1 斑鱧遺傳多樣性分析
4.1.1 6 個(gè)水系斑鱧群體的遺傳多樣性
4.1.2 珠江水系各群體間的遺傳多樣性
4.1.3 海南島 3 個(gè)水系群體的遺傳多樣性
4.1.4 南渡江水系群體的遺傳多樣性
4.2 斑鱧的遺傳變異
4.2.1 6 個(gè)水系的斑鱧群體間遺傳分化
4.2.2 珠江水系各群體間的遺傳分化
4.2.3 海南島 3 個(gè)水系各群體間的遺傳分化
4.2.4 珠江水系與南渡江水系之間的遺傳分化
4.3 斑鱧的種群動(dòng)態(tài)分析
4.4 斑鱧的保護(hù)
第五章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
縮略詞
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