凡納濱對蝦的遺傳育種是推動產業(yè)發(fā)展的重要基礎，傳統(tǒng)的選育方法在過去的二十多年中取得了豐碩的成果，但是傳統(tǒng)選育面臨的選育周期長、效率低、復雜性狀選擇效果差等問題制約著遺傳育種的進展速度。隨著分子標記技術的發(fā)展和成熟，分子標記在遺傳選育中的應用越來越廣泛，利用分子標記輔助育種可以顯著地加快選育的進程。本論文采用高通量方法批量開發(fā)了凡納濱對蝦的SNP和微衛(wèi)星標記，并使用分子標記技術解決遺傳育種中的一些實際問題；構建了凡納濱對蝦的高密度遺傳連鎖圖譜并對重要經濟性狀的分子標記進行了定位。該研究為凡納濱對蝦的標記輔助選育和全基因組選擇育種提供了重要的基礎。 本論文的主要進展如下： 1.建立了從高通量二代測序的凡納濱對蝦轉錄組數(shù)據(jù)中開發(fā)SNP的方法，成功開發(fā)凡納濱對蝦SNP標記96,040個，并分析了SNP在對蝦中的分布特征。結果表明：凡納濱對蝦轉錄組SNP出現(xiàn)的頻率為0.21%，其中SNP發(fā)生轉換和顛換的比率為2.0:1；在所挖掘的SNPs中，5,242個為非同義SNP，29,129為同義SNP，23,422個位于UTR區(qū)域；實驗驗證結果表明，此方法發(fā)掘的SNP位點具有較高的準確率。這些SNPs的...

【文章頁數(shù)】：142 頁

【學位級別】：博士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1.1 前言
    1.2 凡納濱對蝦遺傳育種研究現(xiàn)狀
        1.2.1 世界凡納濱遺傳選育研究
        1.2.2 我國凡納濱對蝦遺傳選育研究
        1.2.3 凡納濱對蝦遺傳選育中的問題和解決方法
    1.3 分子標記在水產動物遺傳育種中的應用
        1.3.1 遺傳多樣性分析
        1.3.2 家系鑒定
        1.3.3 親緣關系鑒定
        1.3.4 選育品種（系）的鑒定
        1.3.5 遺傳圖譜構建
        1.3.6 QTL 定位
        1.3.7 分子標記輔助選育（Marker Assisted Selection）
    1.4 全基因組選擇育種
        1.4.1 全基因組選擇育種概念
        1.4.2 全基因組選擇育種的優(yōu)勢
        1.4.4 全基因組選擇在水產動物育種中的應用
第二章 凡納濱對蝦轉錄組 SNP 標記高通量開發(fā)
    2.1 材料和方法
    2.2 結果與分析
    2.3 討論
第三章 凡納濱對蝦 SSR 標記開發(fā)
    3.1 實驗方法
    3.2 結果與分析
    3.3 討論
第四章 微衛(wèi)星多重 PCR 體系在凡納濱對蝦家系鑒定中的應用
    4.1 材料和方法
    4.2 結果和分析
    4.3 討論
第五章 分子標記在凡納濱對蝦選育新品種鑒定中的應用
    5.1 材料和方法
    5.2 結果和分析
    5.3 討論
第六章 凡納濱對蝦高密度遺傳連鎖圖譜的構建
    6.1 材料和方法
    6.2 結果和分析
    6.3 討論
第七章 ：凡納濱對蝦重要經濟性狀的 QTL 定位
    7.1 生長性狀的 QTL 定位
        7.1.1 材料方法
        7.1.2 結果與討論
    7.2 對蝦性別相關標記的定位
        7.2.1 材料方法
        7.2.2 結果與討論
結論
參考文獻
個人簡歷
博士期間發(fā)表和完成的文章和專利



本文編號：3835387