凡納濱對(duì)蝦的遺傳育種是推動(dòng)產(chǎn)業(yè)發(fā)展的重要基礎(chǔ)，傳統(tǒng)的選育方法在過(guò)去的二十多年中取得了豐碩的成果，但是傳統(tǒng)選育面臨的選育周期長(zhǎng)、效率低、復(fù)雜性狀選擇效果差等問(wèn)題制約著遺傳育種的進(jìn)展速度。隨著分子標(biāo)記技術(shù)的發(fā)展和成熟，分子標(biāo)記在遺傳選育中的應(yīng)用越來(lái)越廣泛，利用分子標(biāo)記輔助育種可以顯著地加快選育的進(jìn)程。本論文采用高通量方法批量開(kāi)發(fā)了凡納濱對(duì)蝦的SNP和微衛(wèi)星標(biāo)記，并使用分子標(biāo)記技術(shù)解決遺傳育種中的一些實(shí)際問(wèn)題；構(gòu)建了凡納濱對(duì)蝦的高密度遺傳連鎖圖譜并對(duì)重要經(jīng)濟(jì)性狀的分子標(biāo)記進(jìn)行了定位。該研究為凡納濱對(duì)蝦的標(biāo)記輔助選育和全基因組選擇育種提供了重要的基礎(chǔ)。 本論文的主要進(jìn)展如下： 1.建立了從高通量二代測(cè)序的凡納濱對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)中開(kāi)發(fā)SNP的方法，成功開(kāi)發(fā)凡納濱對(duì)蝦SNP標(biāo)記96,040個(gè)，并分析了SNP在對(duì)蝦中的分布特征。結(jié)果表明：凡納濱對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組SNP出現(xiàn)的頻率為0.21%，其中SNP發(fā)生轉(zhuǎn)換和顛換的比率為2.0:1；在所挖掘的SNPs中，5,242個(gè)為非同義SNP，29,129為同義SNP，23,422個(gè)位于UTR區(qū)域；實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證結(jié)果表明，此方法發(fā)掘的SNP位點(diǎn)具有較高的準(zhǔn)確率。這些SNPs的...

【文章頁(yè)數(shù)】：142 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：博士

【文章目錄】：
致謝
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 前言
    1.2 凡納濱對(duì)蝦遺傳育種研究現(xiàn)狀
        1.2.1 世界凡納濱遺傳選育研究
        1.2.2 我國(guó)凡納濱對(duì)蝦遺傳選育研究
        1.2.3 凡納濱對(duì)蝦遺傳選育中的問(wèn)題和解決方法
    1.3 分子標(biāo)記在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用
        1.3.1 遺傳多樣性分析
        1.3.2 家系鑒定
        1.3.3 親緣關(guān)系鑒定
        1.3.4 選育品種（系）的鑒定
        1.3.5 遺傳圖譜構(gòu)建
        1.3.6 QTL 定位
        1.3.7 分子標(biāo)記輔助選育（Marker Assisted Selection）
    1.4 全基因組選擇育種
        1.4.1 全基因組選擇育種概念
        1.4.2 全基因組選擇育種的優(yōu)勢(shì)
        1.4.4 全基因組選擇在水產(chǎn)動(dòng)物育種中的應(yīng)用
第二章 凡納濱對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組 SNP 標(biāo)記高通量開(kāi)發(fā)
    2.1 材料和方法
    2.2 結(jié)果與分析
    2.3 討論
第三章 凡納濱對(duì)蝦 SSR 標(biāo)記開(kāi)發(fā)
    3.1 實(shí)驗(yàn)方法
    3.2 結(jié)果與分析
    3.3 討論
第四章 微衛(wèi)星多重 PCR 體系在凡納濱對(duì)蝦家系鑒定中的應(yīng)用
    4.1 材料和方法
    4.2 結(jié)果和分析
    4.3 討論
第五章 分子標(biāo)記在凡納濱對(duì)蝦選育新品種鑒定中的應(yīng)用
    5.1 材料和方法
    5.2 結(jié)果和分析
    5.3 討論
第六章 凡納濱對(duì)蝦高密度遺傳連鎖圖譜的構(gòu)建
    6.1 材料和方法
    6.2 結(jié)果和分析
    6.3 討論
第七章 ：凡納濱對(duì)蝦重要經(jīng)濟(jì)性狀的 QTL 定位
    7.1 生長(zhǎng)性狀的 QTL 定位
        7.1.1 材料方法
        7.1.2 結(jié)果與討論
    7.2 對(duì)蝦性別相關(guān)標(biāo)記的定位
        7.2.1 材料方法
        7.2.2 結(jié)果與討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
個(gè)人簡(jiǎn)歷
博士期間發(fā)表和完成的文章和專利



本文編號(hào)：3835387