發(fā)布時(shí)間：2023-05-18 22:56

　　蝦夷扇貝（Patinopecten yessoensis）是中國(guó)北方重要的經(jīng)濟(jì)型養(yǎng)殖貝類，屬于雙殼綱。現(xiàn)在關(guān)于蝦夷扇貝全基因組序列的分析還未見報(bào)道，為了研究蝦夷扇貝基因組的結(jié)構(gòu)組成，本研究通過(guò)TRF軟件對(duì)蝦夷扇貝全基因組序列中的串聯(lián)重復(fù)序列進(jìn)行查找，并將其按照微衛(wèi)星、小衛(wèi)星、衛(wèi)星序列三種序列進(jìn)行分類，分析它們的組成結(jié)構(gòu)和分布特征。主要結(jié)果如下： 1.分析了全部串聯(lián)重復(fù)序列的整體結(jié)構(gòu)組成，共得到了956，255條重復(fù)單位長(zhǎng)度在0-500bp的串聯(lián)重復(fù)序列，串聯(lián)重復(fù)序列總長(zhǎng)為413,646,025bp，結(jié)果顯示，蝦夷扇貝中串聯(lián)重復(fù)序列總長(zhǎng)占全基因組總長(zhǎng)的39.25%，在全基因組中所占的比例很高。然后分析其中三個(gè)重復(fù)種類所占的數(shù)量，其中微衛(wèi)星重復(fù)序列有21,398條，小衛(wèi)星重復(fù)序列有921,154條，衛(wèi)星重復(fù)序列有13,703條,小衛(wèi)星序列分布范圍廣泛，占串聯(lián)重復(fù)序列的主要部分。對(duì)每種重復(fù)單位長(zhǎng)度的重復(fù)數(shù)目進(jìn)行作圖顯示，從40bp到500bp的區(qū)域中，隨著重復(fù)單位長(zhǎng)度的增加，重復(fù)序列所對(duì)應(yīng)的重復(fù)序列數(shù)目是逐漸減少的趨勢(shì)，但是在遞減過(guò)程中在145bp和156bp處出現(xiàn)了兩次高峰。 2.將1-6...

【文章頁(yè)數(shù)】：60 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 基因組中的重復(fù)序列
        1.1 散布重復(fù)序列
        1.2 串聯(lián)重復(fù)序列
    2 雙殼類 genome 重復(fù)序列研究進(jìn)展
        2.1 雙殼貝類中散布重復(fù)序列研究進(jìn)展
        2.2 衛(wèi)星序列研究進(jìn)展
        2.3 微衛(wèi)星和小衛(wèi)星研究進(jìn)展
    3 本文研究目的和意義
第二章 蝦夷扇貝基因組中串聯(lián)重復(fù)序列的分布特征
    0 引言
    1 材料與方法
    2 結(jié)果與討論
第三章 蝦夷扇貝基因組中微衛(wèi)星序列的分布特征
    0 引言
    1 材料方法
    2 結(jié)果
        2.1 微衛(wèi)星序列的分布特征
    3 討論
第四章 蝦夷扇貝基因組中小衛(wèi)星序列和衛(wèi)星序列分布特征
    0 引言
    1 材料與方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 小衛(wèi)星序列的分布特征
        2.2 衛(wèi)星序列的分布特征
    3 討論
        3.1 蝦夷扇貝基因組中小衛(wèi)星序列的分布特征
        3.2 小衛(wèi)星重復(fù)序列的堿基組成特征及其分類
        3.3 蝦夷扇貝基因組中衛(wèi)星序列的分布特征
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄



本文編號(hào)：3819159