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奧利亞羅非魚(yú)遺傳多樣性相關(guān)研究

發(fā)布時(shí)間:2023-05-13 05:57
  羅非魚(yú)被譽(yù)為未來(lái)動(dòng)物性蛋白質(zhì)的主要來(lái)源之一,是聯(lián)合國(guó)糧農(nóng)組織(FAO)向全世界推薦養(yǎng)殖的主要對(duì)象,羅非魚(yú)產(chǎn)業(yè)也成為我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)之一。本研究采用奧利亞羅非魚(yú)為實(shí)驗(yàn)材料,采用分子生物學(xué)的方法,對(duì)奧利亞羅非魚(yú)的遺傳多樣性進(jìn)行了一系列的研究,希望對(duì)我國(guó)羅非魚(yú)產(chǎn)業(yè)的發(fā)展起到一定的促進(jìn)作用。主要研究結(jié)果如下: 1.對(duì)兩個(gè)奧利亞羅非魚(yú)群體的70個(gè)個(gè)體的mtDNA D-loop區(qū)序列進(jìn)行了研究,整段序列大小為1000bp左右。那馬群體的變異位點(diǎn)數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為24、0.795、0.00176、1.640,武鳴群體的變異位點(diǎn)數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為25、0.822、0.00191、1.788。兩個(gè)群體70尾個(gè)體總共檢測(cè)出32種單倍型,共享單倍型為6個(gè),分布最為廣泛的單倍型是Hap24。單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)結(jié)果顯示,兩個(gè)群體的奧利亞羅非魚(yú)先與尼羅羅非魚(yú)聚成一支,然后與薩羅羅非魚(yú)聚為一支,最后再分別與虹鱒、鱸魚(yú)、香魚(yú)、鯉魚(yú)和斑馬魚(yú)聚為一支。兩個(gè)群體的個(gè)體交錯(cuò)在一起,沒(méi)有體現(xiàn)出地理差異性,表明群體...

【文章頁(yè)數(shù)】:65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 前言
        1.1 我國(guó)羅非魚(yú)產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀
        1.2 我國(guó)羅非魚(yú)養(yǎng)殖現(xiàn)狀
        1.3 我國(guó)羅非魚(yú)產(chǎn)業(yè)面臨的問(wèn)題
    2 線粒體DNA(mtDNA)及其研究概況
        2.1 線粒體DNA的結(jié)構(gòu)組成
        2.2 mtDNA控制區(qū)、CoI、Cyt b基因的屬性
    3 微衛(wèi)星DNA及其研究概況
        3.1 微衛(wèi)星DNA
        3.2 微衛(wèi)星標(biāo)記在生物學(xué)研究的應(yīng)用
    4 本研究的目的與意義
第二章 基于線粒體DNA基因序列分析不同群體的奧利亞羅非魚(yú)遺傳多樣性
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑及儀器
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)主要試劑
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)主要儀器
    2.2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.2.1 奧利亞羅非魚(yú)總DNA的提取
        2.2.2 引物合成
        2.2.3 PCR擴(kuò)增
        2.2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物回收、測(cè)序
        2.2.5 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 線粒體DNA D-loop區(qū)基因序列分析結(jié)果
        2.3.2 線粒體DNACoI基因序列分析結(jié)果
        2.3.3 線粒體DNA Cytb基因序列分析結(jié)果
        2.3.4 序列單倍型分析
        2.3.5 mtDNA D-loop區(qū)基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
        2.3.6 mtDNA COI基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
        2.3.7 mtDNA Cytb基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)
    2.4 討論
        2.4.1 兩個(gè)奧利亞羅非魚(yú)群體mtDNA基因序列的遺傳變異分析
        2.4.2 兩個(gè)奧利亞羅非魚(yú)群體mtDNA基因序列的遺傳多樣性
        2.4.3 系統(tǒng)發(fā)育建樹(shù)方法的選擇
        2.4.4 奧利亞羅非魚(yú)單倍型系統(tǒng)進(jìn)化樹(shù)分析
    2.5. 結(jié)論
第三章 基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記對(duì)奧利亞羅非魚(yú)遺傳多樣性的研究
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料、試劑及儀器
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)主要試劑
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)主要儀器
    3.2 實(shí)驗(yàn)方法
        3.2.1 奧利亞羅非魚(yú)總DNA的提取
        3.2.2 引物合成
        3.2.3 PCR擴(kuò)增
        3.2.4 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物檢測(cè)
        3.2.5 聚丙烯酰胺凝膠板的制備
        3.2.6 聚丙烯酰胺凝膠電泳
        3.2.7 銀染顯色
        3.2.8 結(jié)果記錄及數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 PAGE凝膠電泳結(jié)果
        3.3.2 奧利亞羅非魚(yú)群體位點(diǎn)多態(tài)性分析
        3.3.3 奧利亞羅非魚(yú)群體的遺傳分化與基因流
    3.4 討論
        3.4.1 尼羅羅非魚(yú)微衛(wèi)星引物在奧利亞羅非魚(yú)中的適用性
        3.4.2 奧利亞羅非魚(yú)群體的遺傳多樣性
        3.4.3 影響奧利亞羅非魚(yú)種群的因素
    3.5 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文



本文編號(hào):3815445

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