羅非魚被譽為未來動物性蛋白質(zhì)的主要來源之一,是聯(lián)合國糧農(nóng)組織(FAO)向全世界推薦養(yǎng)殖的主要對象,羅非魚產(chǎn)業(yè)也成為我國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)的支柱產(chǎn)業(yè)之一。本研究采用奧利亞羅非魚為實驗材料,采用分子生物學(xué)的方法,對奧利亞羅非魚的遺傳多樣性進行了一系列的研究,希望對我國羅非魚產(chǎn)業(yè)的發(fā)展起到一定的促進作用。主要研究結(jié)果如下： 1.對兩個奧利亞羅非魚群體的70個個體的mtDNA D-loop區(qū)序列進行了研究,整段序列大小為1000bp左右。那馬群體的變異位點數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為24、0.795、0.00176、1.640,武鳴群體的變異位點數(shù)、單倍型多樣性指數(shù)、核苷酸多樣性指數(shù)、平均核苷酸差異數(shù)分別為25、0.822、0.00191、1.788。兩個群體70尾個體總共檢測出32種單倍型,共享單倍型為6個,分布最為廣泛的單倍型是Hap₂4。單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹結(jié)果顯示,兩個群體的奧利亞羅非魚先與尼羅羅非魚聚成一支,然后與薩羅羅非魚聚為一支,最后再分別與虹鱒、鱸魚、香魚、鯉魚和斑馬魚聚為一支。兩個群體的個體交錯在一起,沒有體現(xiàn)出地理差異性,表明群體...

【文章頁數(shù)】：65 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻綜述
    1 前言
        1.1 我國羅非魚產(chǎn)業(yè)現(xiàn)狀
        1.2 我國羅非魚養(yǎng)殖現(xiàn)狀
        1.3 我國羅非魚產(chǎn)業(yè)面臨的問題
    2 線粒體DNA(mtDNA)及其研究概況
        2.1 線粒體DNA的結(jié)構(gòu)組成
        2.2 mtDNA控制區(qū)、CoI、Cyt b基因的屬性
    3 微衛(wèi)星DNA及其研究概況
        3.1 微衛(wèi)星DNA
        3.2 微衛(wèi)星標(biāo)記在生物學(xué)研究的應(yīng)用
    4 本研究的目的與意義
第二章 基于線粒體DNA基因序列分析不同群體的奧利亞羅非魚遺傳多樣性
    2.1 實驗材料、試劑及儀器
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 實驗主要試劑
        2.1.3 實驗主要儀器
    2.2 實驗方法
        2.2.1 奧利亞羅非魚總DNA的提取
        2.2.2 引物合成
        2.2.3 PCR擴增
        2.2.4 PCR擴增產(chǎn)物回收、測序
        2.2.5 數(shù)據(jù)分析
    2.3 結(jié)果與分析
        2.3.1 線粒體DNA D-loop區(qū)基因序列分析結(jié)果
        2.3.2 線粒體DNACoI基因序列分析結(jié)果
        2.3.3 線粒體DNA Cytb基因序列分析結(jié)果
        2.3.4 序列單倍型分析
        2.3.5 mtDNA D-loop區(qū)基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹
        2.3.6 mtDNA COI基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹
        2.3.7 mtDNA Cytb基因的單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹
    2.4 討論
        2.4.1 兩個奧利亞羅非魚群體mtDNA基因序列的遺傳變異分析
        2.4.2 兩個奧利亞羅非魚群體mtDNA基因序列的遺傳多樣性
        2.4.3 系統(tǒng)發(fā)育建樹方法的選擇
        2.4.4 奧利亞羅非魚單倍型系統(tǒng)進化樹分析
    2.5. 結(jié)論
第三章 基于微衛(wèi)星分子標(biāo)記對奧利亞羅非魚遺傳多樣性的研究
    3.1 實驗材料、試劑及儀器
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 實驗主要試劑
        3.1.3 實驗主要儀器
    3.2 實驗方法
        3.2.1 奧利亞羅非魚總DNA的提取
        3.2.2 引物合成
        3.2.3 PCR擴增
        3.2.4 PCR擴增產(chǎn)物檢測
        3.2.5 聚丙烯酰胺凝膠板的制備
        3.2.6 聚丙烯酰胺凝膠電泳
        3.2.7 銀染顯色
        3.2.8 結(jié)果記錄及數(shù)據(jù)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 PAGE凝膠電泳結(jié)果
        3.3.2 奧利亞羅非魚群體位點多態(tài)性分析
        3.3.3 奧利亞羅非魚群體的遺傳分化與基因流
    3.4 討論
        3.4.1 尼羅羅非魚微衛(wèi)星引物在奧利亞羅非魚中的適用性
        3.4.2 奧利亞羅非魚群體的遺傳多樣性
        3.4.3 影響奧利亞羅非魚種群的因素
    3.5 結(jié)論
參考文獻
附錄
致謝
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的論文



本文編號：3815445