運(yùn)用Miseq高通量測序技術(shù),分析高、中、低3種養(yǎng)殖密度(700、300、100尾/m3)下墨吉明對蝦腸道和其養(yǎng)殖系統(tǒng)中生物絮團(tuán)的菌群結(jié)構(gòu)。結(jié)果顯示:對蝦腸道菌群中,高密度組的豐富度和多樣性均最高,豐富度隨放養(yǎng)密度的增大而增加,而在生物絮團(tuán)菌群中,高密度組的豐富度最低;在門水平上,腸道和絮團(tuán)樣本菌群均以變形菌門(相對豐度49.25%～80.33%)、放線菌門、擬桿菌門、綠彎菌門為主,但豐度差異較大;在屬水平上,優(yōu)勢菌屬的組成和所占比例明顯不同,梭菌屬、Spongiibacter、Faecalibacterium、Rhodovulum、Blautia僅在腸道樣本中存在,Coccinimonas僅在絮團(tuán)樣本中存在;腸道樣本中,中密度組弧菌屬的相對豐度最小,為5.23%,高密度組弧菌屬的相對豐度最大,為23.39%,絮團(tuán)樣本中,低密度組弧菌屬的相對豐度最大,為16.15%,中、高密度弧菌屬的相對豐度均較小,分別為5.51%和4.20%;隨養(yǎng)殖密度增大,腸道樣本中擬桿菌屬的相對豐度減小,分別為1.36%、0.41%、0.02%,而不同密度絮團(tuán)樣本擬桿菌屬的相對豐度差異不明顯。可見,生物絮團(tuán)養(yǎng)殖...

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 材料
    1.2 養(yǎng)殖試驗(yàn)
    1.3 樣品采集
    1.4 DNA提取
    1.5 PCR擴(kuò)增和高通量測序
    1.6 生物信息分析
    1.7 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 供試樣品的物種分類
    2.2 供試樣品的細(xì)菌豐富度和多樣性指數(shù)
    2.3 供試樣品的微生物菌群結(jié)構(gòu)組成
3 結(jié)論與討論



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