七種枝角類分子系統(tǒng)分類的初步研究
發(fā)布時間:2023-04-30 01:32
溞屬和裸腹溞屬都是節(jié)肢動物門(Arthropoda)、甲殼綱(Crustacea)、腮足亞綱(Branchiopoda=Phyllopoda)、雙甲目(Diplostraca)、枝角亞目(Cladocera)、盤腸溞總科(Chydoroidea Brooks)的動物,分別隸屬于溞科(Daphniidae)和裸腹溞科(Moinidae)。溞屬、裸腹溞屬動物是我國多數(shù)湖泊中枝角類的優(yōu)勢種,由于它們的近源物種形態(tài)相似度較高,存在分類鑒定模糊、甚至錯誤的現(xiàn)象。本研究通過直接測序的方法對獲得的分子標(biāo)記基因進(jìn)行序列分析,并分別檢驗了兩屬7個種類的系統(tǒng)分類,校正了部分種類的分類錯誤。 為了檢驗已記錄的4個溞屬種類(隆線溞Daphnia carinata、透明溞D. hyalina、蚤狀溞D. pulex、大型溞D. magna)的系統(tǒng)分類,用試劑盒法分別提取4種溞類的基因組DNA。利用特異性引物,通過PCR擴(kuò)增了4種溞屬種類的16S rDNA、CO I基因部分序列和ITS2序列,并與來自GenBank中每個種類相似度較高的同種序列進(jìn)行分析。結(jié)果表明,基于16S rDNA、CO I基因和ITS2序列,...
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 枝角類概述
1.2 傳統(tǒng)的分類方法及缺陷
第二章 分子系統(tǒng)學(xué)
2.1 分子系統(tǒng)學(xué)常用方法介紹
2.2 系統(tǒng)分析方法簡介
2.3 枝角類分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
第三章 溞屬枝角類 DNA 序列分析及分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 材料與試劑
3.1.1 實驗材料
3.1.2 主要儀器設(shè)備與試劑
3.2 實驗方法
3.2.1 基因組 DNA 提取
3.2.2 溞屬基因組 DNA 的檢測
3.2.3 溞屬動物所用的分子標(biāo)記
3.2.4 PCR 擴(kuò)增引物及條件
3.2.5 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測與序列測定
3.2.6 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 基于 16S rDNA 序列的系統(tǒng)發(fā)生分析
3.3.2 基于 CO I 基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.3.3 基于 ITS 2 基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 討論
3.4.1 有關(guān)幾種爭議溞類的命名和分類地位的探討
3.4.2 四種溞類的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
第四章 裸腹溞屬枝角類 DNA 序列分析及分子系統(tǒng)學(xué)研究
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 基因組 DNA 提取
4.1.3 PCR 擴(kuò)增及序列測定
4.1.4. 系統(tǒng)發(fā)生分析
4.2 結(jié)果
4.3 討論
4.3.1 三種裸腹溞的 16S rDNA 序列分析
4.3.2 三種裸腹溞的系統(tǒng)分類探討
第五章 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間出版或發(fā)表的論著、論文
致謝
本文編號:3806146
【文章頁數(shù)】:54 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 引言
1.1 枝角類概述
1.2 傳統(tǒng)的分類方法及缺陷
第二章 分子系統(tǒng)學(xué)
2.1 分子系統(tǒng)學(xué)常用方法介紹
2.2 系統(tǒng)分析方法簡介
2.3 枝角類分子系統(tǒng)學(xué)研究進(jìn)展
第三章 溞屬枝角類 DNA 序列分析及分子系統(tǒng)學(xué)研究
3.1 材料與試劑
3.1.1 實驗材料
3.1.2 主要儀器設(shè)備與試劑
3.2 實驗方法
3.2.1 基因組 DNA 提取
3.2.2 溞屬基因組 DNA 的檢測
3.2.3 溞屬動物所用的分子標(biāo)記
3.2.4 PCR 擴(kuò)增引物及條件
3.2.5 PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物的檢測與序列測定
3.2.6 系統(tǒng)發(fā)生分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 基于 16S rDNA 序列的系統(tǒng)發(fā)生分析
3.3.2 基于 CO I 基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.3.3 基于 ITS 2 基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析
3.4 討論
3.4.1 有關(guān)幾種爭議溞類的命名和分類地位的探討
3.4.2 四種溞類的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系分析
第四章 裸腹溞屬枝角類 DNA 序列分析及分子系統(tǒng)學(xué)研究
4.1 材料與方法
4.1.1 實驗材料
4.1.2 基因組 DNA 提取
4.1.3 PCR 擴(kuò)增及序列測定
4.1.4. 系統(tǒng)發(fā)生分析
4.2 結(jié)果
4.3 討論
4.3.1 三種裸腹溞的 16S rDNA 序列分析
4.3.2 三種裸腹溞的系統(tǒng)分類探討
第五章 小結(jié)
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間出版或發(fā)表的論著、論文
致謝
本文編號:3806146
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