發(fā)布時間：2023-04-21 04:10

　　魚類是脊椎動物中最原始且種屬數(shù)量最多的類群,分布極為廣泛,它的起源復雜,多樣性程度高、且遺傳多樣性十分豐富,因此其系統(tǒng)進化和遺傳多樣性研究是長期熱點。青鳉屬具有體型小、易繁殖等特點,研究深入的日本青鳉等物種已被開發(fā)為重要模式生物。然而,該屬魚類屬于非食用魚類,分布于東南亞和中國的多個物種研究滯后。其中,西里伯斯青鳉尚缺少線粒體全序列數(shù)據(jù),而中華青鳉尚缺少群體遺傳學研究。本研究利用轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)測定并注釋了親本源自新加坡的西里伯斯青鳉的線粒體基因組全序列,結(jié)果表明:西里伯斯青鳉線粒體基因組序列全長為16493bp(Genbank登錄號為MN064715),堿基組成和基因結(jié)構(gòu)與其他硬骨魚類基本相似,包含37個基因和1個控制區(qū)。13個蛋白質(zhì)編碼基因中,除了COⅠ基因的起始密碼子為GTG外,其余均為ATG。22個t RNA基因,均能形成完整的三葉草型二級結(jié)構(gòu)(除t RNA-ser)�；趍t DNA構(gòu)建的青鳉屬進化樹顯示,其與薩拉青鳉和花斑青鳉的親緣關(guān)系較近,在系統(tǒng)發(fā)育上屬于較晚分化出來的物種。本研究獲取了云南保山青華海、吉林莫莫格、云南大理劍湖、云南昆明花紅園、云南麗江拉市海、云南香格里拉納帕海...

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
1 緒論
    1.1 魚類線粒體基因組研究進展
        1.1.1 魚類mtDNA的結(jié)構(gòu)及特征
        1.1.2 魚類線粒體在系統(tǒng)進化及遺傳多樣分析中的應用
    1.2 青鳉屬魚類研究進展
        1.2.1 國外對青鳉魚研究現(xiàn)狀
        1.2.2 國內(nèi)對青鳉魚研究現(xiàn)狀
        1.2.3 青鳉屬魚類系統(tǒng)發(fā)育分析
    1.3 研究目的及意義
2 西里伯斯青鳉(Oryzias celebensis)線粒體基因組全序列測定
    2.1 實驗材料與方法
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 RNA的提取
        2.1.3 序列注釋及分析
    2.2 結(jié)果與分析
        2.2.1 西里伯斯青鳉線粒體基因組組成與排列
        2.2.2 堿基組成
        2.2.3 蛋白質(zhì)編碼基因
        2.2.4 轉(zhuǎn)運RNA(tRNA)基因和核糖體RNA(rRNA)基因
        2.2.5 非編碼區(qū)
        2.2.6 以mtDNA基因組為基礎(chǔ)的分子系統(tǒng)進化樹的構(gòu)建
    2.3 討論
3 基于COⅠ基因分析比較不同地理群體中華青鳉(Oryzias sinensis)遺傳多樣性
    3.1 實驗材料與方法
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 樣本DNA提取
        3.1.3 COⅠ序列擴增
        3.1.4 實驗數(shù)據(jù)分析
    3.2 實驗結(jié)果
        3.2.1 堿基組成
        3.2.2 遺傳距離及中性進化分析
    3.3 討論
4 結(jié)論
參考文獻
致謝
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本文編號：3795810