采用AFLP和SSR分析鯉生長不同階段的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳差異
發(fā)布時間:2023-04-05 15:42
在對鯉進(jìn)行遺傳多樣性分析時,發(fā)現(xiàn)很多標(biāo)記不平衡的現(xiàn)象;在對鯉進(jìn)行QTL分析中和基于單家系的遺傳作圖中,發(fā)現(xiàn)了很多偏離平衡的位點,這說明某一種基因型嚴(yán)重偏離孟德爾平衡比例,對于這種現(xiàn)象出現(xiàn)的原因還不清楚。本研究利用高效的AFLP和SSR分子標(biāo)記技術(shù),掃描一個單家系鯉不同生長階段(出膜前、出膜后平游前、平游時、秋天成魚)的全基因組DNA,分析了鯉出膜前后部分基因型差異;利用偏離平衡的標(biāo)記對不同發(fā)育階段進(jìn)行分析,獲得了該單家系鯉的遺傳多樣性數(shù)據(jù),比較在生長發(fā)育四個階段的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳差異,以期揭示在哪個階段開始出現(xiàn)不平衡現(xiàn)象以及遺傳多樣性變化規(guī)律。對鯉分子生物學(xué)基礎(chǔ)研究具有重要理論和現(xiàn)實意義,同時,也為評估鯉種質(zhì)資源,建立其遺傳多樣性數(shù)據(jù)庫提供依據(jù)。主要結(jié)果如下: 本研究利用AFLP標(biāo)記技術(shù),對出膜前和平游前兩個階段正常及狀態(tài)不佳群體(畸形群體)進(jìn)行分析。主要結(jié)果和結(jié)論如下 1.出膜前多態(tài)位點平均比例為23.48%,略高于出膜后多態(tài)位點平均比例22.05%。就多態(tài)性位點比例來說正常個體與死亡或狀態(tài)不佳群體差異不大。 2.通過篩選,64對AFLP引物中,共35對引物存在多態(tài)性位點;8對引物存在...
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 我國鏡鯉研究現(xiàn)狀
1.2 DNA 分子標(biāo)記
1.2.1 AFLP 分子標(biāo)記
1.2.2 SSR 分子標(biāo)記
1.2.3 其他 DNA 分子標(biāo)記
1.3 研究背景
1.3.1 偏分離現(xiàn)象
1.3.2 隱性致死突變研究現(xiàn)狀
1.3.3 鯉生長發(fā)育階段
1.4 研究目的及技術(shù)路線
1.4.1 AFLP 研究目的及技術(shù)路線
1.4.2 微衛(wèi)星研究目的與技術(shù)路線
第2章 采用 AFLP 分析鯉出膜前及平游前階段的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳差異
2.1 材料與方法
2.1.1 主要的試劑與儀器
2.1.2 群體的來源
2.1.3 基因組 DNA 的提取
2.1.4 AFLP 分析
2.1.5 差異片段克隆測序
2.2 結(jié)果
2.2.1 DNA 完整性
2.2.2 預(yù)擴(kuò)增效果
2.2.3 選擇性擴(kuò)增效果
2.2.4 遺傳多樣性分析
2.2.5 驗證分析結(jié)果
2.2.6 目標(biāo)片段的測序結(jié)果及序列比對分析
2.3 討論
2.3.1 高質(zhì)量 DNA 的提取
2.3.2 AFLP 技術(shù)體系的注意事項
2.3.3 AFLP 分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用價值
第3章 利用 SSR 標(biāo)記分析鏡鯉生長不同階段遺傳差異及遺傳結(jié)構(gòu)
3.1 材料與方法
3.1.1 試劑與器材
3.1.2 群體來源
3.1.3 總 DNA 提取
3.1.4 SSR 分析
3.1.5 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)處理
3.2 實驗結(jié)果
3.2.1 總 DNA 提取結(jié)果
3.2.2 微衛(wèi)星擴(kuò)增結(jié)果及條帶統(tǒng)計
3.2.3 偏分離標(biāo)記統(tǒng)計
3.2.4 鏡鯉種群不同發(fā)育階段的遺傳多樣性
3.2.5 四階段哈德溫伯格平衡分析
3.2.6 鏡鯉種群發(fā)育階段間的遺傳一致度和遺傳距離
3.2.7 四階段連鎖群構(gòu)建比較
3.3 討論
3.3.1 偏分離標(biāo)記的分析
3.3.2 鏡鯉的遺傳多樣性
3.3.3 鏡鯉種群不同發(fā)育階段間的遺傳一致度、遺傳距離及聚類分析
3.3.4 幼魚各階段圖譜差異性
3.5 小結(jié)
第4章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3783679
【文章頁數(shù)】:77 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
縮略語表
第1章 文獻(xiàn)綜述
1.1 我國鏡鯉研究現(xiàn)狀
1.2 DNA 分子標(biāo)記
1.2.1 AFLP 分子標(biāo)記
1.2.2 SSR 分子標(biāo)記
1.2.3 其他 DNA 分子標(biāo)記
1.3 研究背景
1.3.1 偏分離現(xiàn)象
1.3.2 隱性致死突變研究現(xiàn)狀
1.3.3 鯉生長發(fā)育階段
1.4 研究目的及技術(shù)路線
1.4.1 AFLP 研究目的及技術(shù)路線
1.4.2 微衛(wèi)星研究目的與技術(shù)路線
第2章 采用 AFLP 分析鯉出膜前及平游前階段的遺傳結(jié)構(gòu)及遺傳差異
2.1 材料與方法
2.1.1 主要的試劑與儀器
2.1.2 群體的來源
2.1.3 基因組 DNA 的提取
2.1.4 AFLP 分析
2.1.5 差異片段克隆測序
2.2 結(jié)果
2.2.1 DNA 完整性
2.2.2 預(yù)擴(kuò)增效果
2.2.3 選擇性擴(kuò)增效果
2.2.4 遺傳多樣性分析
2.2.5 驗證分析結(jié)果
2.2.6 目標(biāo)片段的測序結(jié)果及序列比對分析
2.3 討論
2.3.1 高質(zhì)量 DNA 的提取
2.3.2 AFLP 技術(shù)體系的注意事項
2.3.3 AFLP 分子標(biāo)記技術(shù)的應(yīng)用價值
第3章 利用 SSR 標(biāo)記分析鏡鯉生長不同階段遺傳差異及遺傳結(jié)構(gòu)
3.1 材料與方法
3.1.1 試劑與器材
3.1.2 群體來源
3.1.3 總 DNA 提取
3.1.4 SSR 分析
3.1.5 微衛(wèi)星數(shù)據(jù)處理
3.2 實驗結(jié)果
3.2.1 總 DNA 提取結(jié)果
3.2.2 微衛(wèi)星擴(kuò)增結(jié)果及條帶統(tǒng)計
3.2.3 偏分離標(biāo)記統(tǒng)計
3.2.4 鏡鯉種群不同發(fā)育階段的遺傳多樣性
3.2.5 四階段哈德溫伯格平衡分析
3.2.6 鏡鯉種群發(fā)育階段間的遺傳一致度和遺傳距離
3.2.7 四階段連鎖群構(gòu)建比較
3.3 討論
3.3.1 偏分離標(biāo)記的分析
3.3.2 鏡鯉的遺傳多樣性
3.3.3 鏡鯉種群不同發(fā)育階段間的遺傳一致度、遺傳距離及聚類分析
3.3.4 幼魚各階段圖譜差異性
3.5 小結(jié)
第4章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文
致謝
本文編號:3783679
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