為了解清水江斑鱖(Siniperca scherzeri)種質(zhì)資源現(xiàn)狀,本研究基于線粒體DNA D-loop區(qū)基因和Cytb基因標(biāo)記技術(shù)并結(jié)合微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù),對清水江的凱里、劍河、錦屏、遠(yuǎn)口、臺盤、南哨、三江鎮(zhèn)和大同等8個(gè)站點(diǎn)的斑鱖種群(185尾)遺傳結(jié)構(gòu)及其遺傳多樣性進(jìn)行研究,得到如下結(jié)果:1.基于線粒體DNA D-loop區(qū)基因遺傳分析結(jié)果:清水江斑鱖種群堿基A、T、C、G的平均含量分別為33.9%、29.9%、20.3%和15.8%;終止序列區(qū)是D-loop區(qū)3個(gè)區(qū)段中位點(diǎn)突變最活躍區(qū)域,變異位點(diǎn)數(shù)多達(dá)31個(gè)(占70.45%);185條基因序列共定義了35個(gè)單倍型,檢測出44個(gè)堿基替換位點(diǎn),無堿基插入/缺失,轉(zhuǎn)換/顛換比為4.5。單倍型分布上,干流種群的單倍型數(shù)比支流多,中游比上游和下游的多;Hap 1、Hap 7和Hap 16代表83個(gè)個(gè)體(占總個(gè)體數(shù)的44.9%),是清水江斑鱖單倍型分布最廣的優(yōu)勢種群,雖也有少數(shù)個(gè)體已分化成獨(dú)特的單倍型類型,但整個(gè)流域斑鱖種群無嚴(yán)格的單倍型地理分布格局。遺傳距離、遺傳分化系數(shù)和核苷酸多樣性指數(shù)結(jié)果顯示,上游凱里種群擁有最高的遺傳變異和遺傳多樣...

【文章頁數(shù)】：75 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 清水江及其魚類資源
        1.1 清水江
        1.2 清水江魚類資源
    2 斑鱖的研究概況
        2.1 分類地位及地理分布
        2.2 形態(tài)特征
        2.3 食性
        2.4 繁殖與生長
        2.5 斑鱖人工養(yǎng)殖現(xiàn)狀
        2.6 遺傳學(xué)研究
    3 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)研究方法
        3.1 線粒體DNA控制區(qū)基因多態(tài)技術(shù)
        3.2 線粒體DNA細(xì)胞色素b基因多態(tài)技術(shù)
        3.3 微衛(wèi)星標(biāo)記技術(shù)
    4 目的意義
第二章 基于線粒體DNAD-loop區(qū)基因的清水江斑鱖種群的遺傳結(jié)構(gòu)的研究
    1 材料與方法
        1.1 樣品采集
        1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
        1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑、藥品
        1.4 實(shí)驗(yàn)方法
            1.4.1 DNA提取及檢測
            1.4.2 PCR擴(kuò)增及測序
        1.5 數(shù)據(jù)處理
    2 結(jié)果與分析
        2.1 D-Loop區(qū)序列堿基組成和單倍型分布
            2.1.1 D-loop區(qū)序列堿基組成
            2.1.2 D-loop區(qū)序單倍型組成及分布
        2.2 遺傳結(jié)構(gòu)
            2.2.1 D-loop區(qū)結(jié)構(gòu)及序列變異
            2.2.2 遺傳距離及其變異
            2.2.3 斑鱖mtDNAD-loop區(qū)基因的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系
            2.2.4 遺傳多樣性
        2.3 遺傳分化及種群歷史動態(tài)
    3 討論
        3.1 線粒體DNAD-loop區(qū)結(jié)構(gòu)及遺傳變異
        3.2 遺傳結(jié)構(gòu)及種群動態(tài)
第三章 基于線粒體DNACytb基因的清水江斑鱖種群的遺傳結(jié)構(gòu)的研究
    1 材料與方法
        1.1 樣品采集
        1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
        1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑、藥品
        1.4 實(shí)驗(yàn)方法
            1.4.1 DNA提取及檢測
            1.4.2 PCR擴(kuò)增及測序
        1.5 數(shù)據(jù)處理
    2 結(jié)果與分析
        2.1 斑鱖mtDNAcytb基因堿基組成和單倍型分布
            2.1.1 Cytb基因序列堿基組成
            2.1.2 單倍型組成
        2.2 遺傳距離及遺傳結(jié)構(gòu)
            2.2.1 遺傳距離
            2.2.2 序列變異
            2.2.3 單倍型NJ系統(tǒng)樹構(gòu)建
            2.2.4 遺傳多樣性
        2.3 遺傳分化及種群歷史動態(tài)
    3 討論
        3.1 序列變異
        3.2 遺傳結(jié)構(gòu)及種群動態(tài)
第四章 基于SSR標(biāo)記的清水江斑鱖種群的遺傳多樣性研究
    1 材料與方法
        1.1 樣品采集
        1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器及設(shè)備
        1.3 主要實(shí)驗(yàn)試劑、藥品
        1.4 主要試劑的配置
        1.5 實(shí)驗(yàn)方法
            1.5.1 DNA提取及檢測
            1.5.2 SSR引物篩選
            1.5.3 多態(tài)性SSR標(biāo)記的檢測
        1.6 數(shù)據(jù)處理
    2 結(jié)果與分析
        2.1 微衛(wèi)星位點(diǎn)檢測結(jié)果
        2.2 Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)
        2.3 12對引物對斑鱖種群的多態(tài)性分析
            2.3.1 多態(tài)信息含量(PIC)
            2.3.2 雜合度和香農(nóng)指數(shù)
            2.3.3 觀測等位基因與有效等位基因
    3 討論
        3.1 樣本量對微衛(wèi)星位點(diǎn)遺傳多樣性指標(biāo)的影響
        3.2 遺傳多樣性分析
        3.3 保護(hù)對策
全文結(jié)論
致謝
參考文獻(xiàn)
附錄 攻讀研究生期間發(fā)表文章
附錄
附表1
附表2



本文編號：3782490