石磺科貝類屬于軟體動(dòng)物門(mén),肺螺亞綱,縮眼目,石磺超科。在我國(guó)主要有5屬6種,目前研究比較多的主要有4種:紫色疣石磺(Peronia verruculata)、里氏擬石磺(Paraoncidium reevesii)、瘤背石磺(Onchidium struma)和平疣桑椹石磺(Platevindex mortoni)。石磺科貝類的幼蟲(chóng)生活在水中,成體的生活區(qū)域分別從淺海到潮間帶直到潮上帶,呈現(xiàn)出從海洋向陸地?cái)U(kuò)展的梯度分布狀態(tài),其成體的呼吸方式,肌肉組成,角質(zhì)層形成等的適應(yīng)性變化逐漸呈現(xiàn)出與兩棲類相似的生活習(xí)性,可作為研究海洋無(wú)脊椎動(dòng)物向陸地進(jìn)化的良好材料。開(kāi)發(fā)SSR和SNP分子標(biāo)記將為研究石磺科貝類的進(jìn)化關(guān)系以及種質(zhì)資源保護(hù)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。本文通過(guò)Illumina HiseqTM 2000高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)分別對(duì)里氏擬石磺(P.reevesii)和平疣桑椹石磺(P.mortoni)的微衛(wèi)星分子標(biāo)記進(jìn)行開(kāi)發(fā),對(duì)兩棲特性明顯的瘤背石磺(O.struma)進(jìn)行了兩棲性狀特征通路相關(guān)基因的SNP分子標(biāo)記開(kāi)發(fā),具體方案和結(jié)果如下:1,基于Illumina HiseqTM 2000高通量轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的...

【文章頁(yè)數(shù)】：65 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
引言
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 石磺科貝類研究進(jìn)展
        1.1 石磺科貝類簡(jiǎn)介
        1.2 石磺科貝類的研究現(xiàn)狀
    2 微衛(wèi)星分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)與應(yīng)用
        2.1 微衛(wèi)星標(biāo)記簡(jiǎn)介
        2.2 微衛(wèi)星篩選方法
    3 SNP標(biāo)記的研究進(jìn)展
        3.1 SNP標(biāo)記簡(jiǎn)介
        3.2 SNP篩選分型方法
        3.3 SNP分子標(biāo)記在群體進(jìn)化研究中的應(yīng)用
    4 本研究的目的和意義
第二章 里氏擬石磺SSR分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
    1 材料與方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑
            1.2.1 實(shí)驗(yàn)儀器
            1.2.2 實(shí)驗(yàn)試劑
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
            1.3.1 微衛(wèi)星序列的來(lái)源及篩選
            1.3.2 EST-SSR位點(diǎn)的引物設(shè)計(jì)
            1.3.3 DNA的提取與檢測(cè)
            1.3.4 SSR引物的初步篩選
            1.3.5 PCR擴(kuò)增
            1.3.6 產(chǎn)物檢測(cè)
            1.3.7 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)與分析
    2 結(jié)果與分析
        2.1 里氏擬石磺轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果
        2.2 EST—SSR的類型和頻率統(tǒng)計(jì)
        2.3 引物篩選結(jié)果統(tǒng)計(jì)
        2.4 里氏擬石磺湛江群體遺傳多樣性分析
    3 討論
第三章 平疣桑椹石磺SSR分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
    1 材料與方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 實(shí)驗(yàn)儀器及試劑
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2 結(jié)果與分析
        2.1 平疣桑椹石磺轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果
        2.2 EST—SSR的類型和頻率統(tǒng)計(jì)
        2.3 引物篩選結(jié)果統(tǒng)計(jì)
        2.4 平疣桑椹石磺湛江群體遺傳多樣性分析
    3 討論
第四章 瘤背石磺SNP分子標(biāo)記的開(kāi)發(fā)
    1 材料及方法
        1.1 樣品采集
        1.2 實(shí)驗(yàn)材料
        1.3 實(shí)驗(yàn)方法
    2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果及分析
        2.1 測(cè)序及分析結(jié)果
        2.2 引物篩選結(jié)果
        2.3 SNP位點(diǎn)多態(tài)性統(tǒng)計(jì)分析
        2.4 SNP位點(diǎn)基因功能預(yù)測(cè)
    3 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝



本文編號(hào)：3777474