鱘形目魚類(簡稱:鱘類;Acipenseriformes)隸屬于硬骨魚綱(Osteichthyes)輻鰭亞綱(Actinopterygii),是軟骨硬鱗下綱(Chondrostei)魚類現(xiàn)生類群中唯一一目,在魚類乃至脊椎動物演化史中有著十分重要的位置。鱘類現(xiàn)存種包含2科6屬27個物種,全部分布于北半球,是目前公認的魚類“活化石”。盡管在約2億年前的侏羅紀時期就存在鱘類的化石,然而在形態(tài)上鱘類的變化卻很小,加上其獨特的底棲生活特性、咸淡水兩棲生活史特征以及瀕�；驗l臨滅絕的處境,使得鱘類成為系統(tǒng)學、生態(tài)學以及保護生物學研究的熱點。盡管鱘類的系統(tǒng)發(fā)育研究中取得了一定的進展,但目前研究所采用的分子標記主要集中在少數(shù)幾個線粒體基因,近年來,部分線粒體基因乃至全線粒體基因組在更多的鱘類中得以測定,這使得從線粒體分子標記的角度較完整的重建該類群的系統(tǒng)發(fā)育關系成為可能。然而,由于線粒體DNA具有母系遺傳且進化速率快等特點,使得核基因分子標記成為解決古老類群系統(tǒng)發(fā)育關系研究的首選,特別是核蛋白編碼基因(NPC)因其外顯子區(qū)域較高的保守性,使其成為研究諸多古老類群系統(tǒng)發(fā)育關系的首選分子標記。另外,由于鱘類...

【文章頁數(shù)】：104 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 文獻綜述
    1.1 鱘形目魚類研究進展
        1.1.1 鱘形目物種組成、分布和分類地位
        1.1.2 鱘形目魚類系統(tǒng)分類研究現(xiàn)狀
    1.2 系統(tǒng)發(fā)育學概述
        1.2.1 系統(tǒng)發(fā)育學簡介
        1.2.2 系統(tǒng)發(fā)育學常用分析方法
        1.2.3 分子標記及其應用
    1.3 本研究的目的和意義
第2章 基于線粒體基因組的鱘類系統(tǒng)發(fā)育研究
    2.1 引言
    2.2 材料與方法
        2.2.1 數(shù)據(jù)獲取
        2.2.2 序列處理
        2.2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
    2.3 結果
        2.3.1 序列分析
        2.3.2 分子系統(tǒng)發(fā)育結果
            2.3.2.1 貝葉斯推斷(BI)與最大似然法(ML)結果
            2.3.2.2 分子鐘估算結果
    2.4 討論
        2.4.1 鱘形目魚類系統(tǒng)發(fā)育關系
        2.4.2 分化時間
    2.5 小結
第3章 基于核基因分子標記的鱘類系統(tǒng)發(fā)育研究
    3.1 引言
    3.2 材料與方法
        3.2.1 利用轉錄組數(shù)據(jù)開發(fā)核基因分子標記
        3.2.2 數(shù)據(jù)分析
        3.2.3 系統(tǒng)發(fā)育分析
    3.3 結果
        3.3.1 分子標記開發(fā)
        3.3.2 分子系統(tǒng)發(fā)育分析結果
    3.4 討論
        3.4.1 核基因分子標記開發(fā)
        3.4.2 鱘形目魚類系統(tǒng)發(fā)育關系
        3.4.3 鱘形目魚類分化時間研究
    3.5 小結
參考文獻
致謝
發(fā)表論文及參加科研項目



本文編號：3751373