鱖類的物種界定、系統(tǒng)發(fā)育和生物地理以及少鱗鱖屬群體遺傳現(xiàn)狀和演化過程的研究
發(fā)布時間:2023-01-06 09:30
鱖類為東亞特有淡水魚類,其分布受水系范圍嚴格限制,群體間的交流通常被水系阻隔,促進了不同群體間或群體內的遺傳分化,是研究中國淡水魚類區(qū)系的良好材料。界定物種和解決鱖類系統(tǒng)發(fā)育關系是了解鱖類物種起源,地理歷史事件對其進化過程的影響和中國淡水魚類區(qū)系的理論基礎。不同水系和不同群體在時間和空間上的遺傳結構和遺傳多樣性可反映其所在水系的地理變化歷史。鱖類大部分物種僅分布于中國,部分物種是中國重要的淡水經濟魚類,如翹嘴鱖。在我國早期鱖類的野生資源較豐富,但是從上世紀70年代以后鱖類的野生資源急劇下降,長江以北的大部分地區(qū)面臨絕跡。為了鱖類資源更好的保護開展和措施制定,鱖類的遺傳結構和遺傳多樣性的分析顯得越發(fā)緊迫。鱖類作為研究東亞魚類起源進化和地理分布格局的理想種類,有關其物種鑒定、分類學研究已有相當長的歷史,積累了豐富的資料,但對部分物種的有效性、群體的遺傳現(xiàn)狀、屬的分類劃分以及鱖類的系統(tǒng)發(fā)育關系和進化歷史尚存爭議,F(xiàn)階段,對于鱖類的研究主要在形態(tài)學、線粒體DNA和少數(shù)核基因位點等方面,不同學者基于不同的方法和實驗數(shù)據得到的分析結果存在較大差異。少鱗鱖屬作為鱖類主要的群體,在中國,日本和朝鮮均有...
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.系統(tǒng)發(fā)育學
2.物種界定
3.系統(tǒng)發(fā)生生物地理學
4.鱖類的地理分布和生理習性
5.鱖類的研究現(xiàn)狀
5.1 鱖類的物種界定
5.2 鱖類的遺傳多樣性
5.3 鱖類分類地位
6.研究意義和目的
第二章 鱖類的物種界定,系統(tǒng)發(fā)育和生物地理的研究
1.實驗材料與方法
1.1 實驗樣本和DNA提取
1.2 目標序列的選擇、探針的設計和合成
1.3 文庫制備、基因富集和測序
1.4 數(shù)據組裝
2.數(shù)據分析
2.1 鱖類物種界定分析
2.2 鱖類系統(tǒng)演化關系的分析
2.3 化石校正
2.4 重建鱖類祖先分布地理
3.實驗結果
3.1 數(shù)據結果和比對
3.2 系統(tǒng)發(fā)育關系結果
3.3 物種界定結果
3.4 鱖類進化時間分析
3.5 祖先分布地理重建結果
4.討論和分析
4.1 物種界定結果分析
4.2 鱖類系統(tǒng)演化關系結果
4.3 鱖類分化時間和歷史生物地理結果
第三章 少鱗鱖屬群體遺傳現(xiàn)狀和演化過程的分析
1.實驗材料和方法及數(shù)據的初步組裝
1.1 實驗樣本和DNA提取
1.2 基因富集和樣本測序及數(shù)據的初步組裝
2.數(shù)據分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育關系
2.2 種群遺傳結構分析
2.3 群體間基因交流分析
2.4 化石校正和祖先分布地理分析
3.實驗結果
3.1 數(shù)據的結果
3.2 系統(tǒng)發(fā)育關系結果
3.3 種群遺傳結構和基因交流分析結果
3.4 物種分化時間和祖先分布地理結果
4 結果討論
4.1 少鱗鱖屬系統(tǒng)發(fā)育關系
4.2 少鱗鱖屬群體遺傳結構分析
4.3 少鱗鱖屬系統(tǒng)發(fā)育和地理格局演化過程
總結
參考文獻
在校期間科研情況
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱖魚[J]. 丁德明. 湖南農業(yè). 2013(12)
[2]中國浙江少鱗鱖屬一新種(鱸形目,鮨科,鱖亞科)[J]. 曹亮,梁旭方. 動物分類學報. 2013(04)
[3]長白山區(qū)地質地貌演化歷史[J]. 萬飛. 吉林地質. 2012(03)
[4]中國少鱗鱖不同地理群體遺傳變異的AFLP分析[J]. 趙麗麗,趙金良. 農業(yè)生物技術學報. 2008(05)
[5]中國少鱗鱖不同群體mtDNA控制區(qū)序列的遺傳變異分析[J]. 趙麗麗,趙金良. 上海水產大學學報. 2007(05)
[6]閩江和漓江暗鱖mtDNA控制區(qū)序列差異分析[J]. 趙麗麗,趙金良,曹陽. 動物學雜志. 2007(01)
[7]我國斑鱖不同群體mtDNA控制區(qū)序列的遺傳變異[J]. 王偉偉,趙金良,李思發(fā). 上海水產大學學報. 2006(04)
[8]鱖類系統(tǒng)發(fā)育的線粒體Cytb基因全序列分析[J]. 章群,任崗,錢開誠,陳泉梅. 生態(tài)科學. 2006(05)
[9]鱖類魚類的線粒體DNA控制區(qū)結構及其系統(tǒng)發(fā)育分析(英文)[J]. 趙金良,王偉偉,李思發(fā),蔡完其. 遺傳學報. 2006(09)
[10]基于細胞色素b基因序列的東亞鱖類系統(tǒng)發(fā)育關系[J]. 趙金良,李思發(fā),蔡完其,王偉偉. 動物學報. 2006(04)
本文編號:3728091
【文章頁數(shù)】:69 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
abstract
第一章 引言
1.系統(tǒng)發(fā)育學
2.物種界定
3.系統(tǒng)發(fā)生生物地理學
4.鱖類的地理分布和生理習性
5.鱖類的研究現(xiàn)狀
5.1 鱖類的物種界定
5.2 鱖類的遺傳多樣性
5.3 鱖類分類地位
6.研究意義和目的
第二章 鱖類的物種界定,系統(tǒng)發(fā)育和生物地理的研究
1.實驗材料與方法
1.1 實驗樣本和DNA提取
1.2 目標序列的選擇、探針的設計和合成
1.3 文庫制備、基因富集和測序
1.4 數(shù)據組裝
2.數(shù)據分析
2.1 鱖類物種界定分析
2.2 鱖類系統(tǒng)演化關系的分析
2.3 化石校正
2.4 重建鱖類祖先分布地理
3.實驗結果
3.1 數(shù)據結果和比對
3.2 系統(tǒng)發(fā)育關系結果
3.3 物種界定結果
3.4 鱖類進化時間分析
3.5 祖先分布地理重建結果
4.討論和分析
4.1 物種界定結果分析
4.2 鱖類系統(tǒng)演化關系結果
4.3 鱖類分化時間和歷史生物地理結果
第三章 少鱗鱖屬群體遺傳現(xiàn)狀和演化過程的分析
1.實驗材料和方法及數(shù)據的初步組裝
1.1 實驗樣本和DNA提取
1.2 基因富集和樣本測序及數(shù)據的初步組裝
2.數(shù)據分析
2.1 系統(tǒng)發(fā)育關系
2.2 種群遺傳結構分析
2.3 群體間基因交流分析
2.4 化石校正和祖先分布地理分析
3.實驗結果
3.1 數(shù)據的結果
3.2 系統(tǒng)發(fā)育關系結果
3.3 種群遺傳結構和基因交流分析結果
3.4 物種分化時間和祖先分布地理結果
4 結果討論
4.1 少鱗鱖屬系統(tǒng)發(fā)育關系
4.2 少鱗鱖屬群體遺傳結構分析
4.3 少鱗鱖屬系統(tǒng)發(fā)育和地理格局演化過程
總結
參考文獻
在校期間科研情況
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]鱖魚[J]. 丁德明. 湖南農業(yè). 2013(12)
[2]中國浙江少鱗鱖屬一新種(鱸形目,鮨科,鱖亞科)[J]. 曹亮,梁旭方. 動物分類學報. 2013(04)
[3]長白山區(qū)地質地貌演化歷史[J]. 萬飛. 吉林地質. 2012(03)
[4]中國少鱗鱖不同地理群體遺傳變異的AFLP分析[J]. 趙麗麗,趙金良. 農業(yè)生物技術學報. 2008(05)
[5]中國少鱗鱖不同群體mtDNA控制區(qū)序列的遺傳變異分析[J]. 趙麗麗,趙金良. 上海水產大學學報. 2007(05)
[6]閩江和漓江暗鱖mtDNA控制區(qū)序列差異分析[J]. 趙麗麗,趙金良,曹陽. 動物學雜志. 2007(01)
[7]我國斑鱖不同群體mtDNA控制區(qū)序列的遺傳變異[J]. 王偉偉,趙金良,李思發(fā). 上海水產大學學報. 2006(04)
[8]鱖類系統(tǒng)發(fā)育的線粒體Cytb基因全序列分析[J]. 章群,任崗,錢開誠,陳泉梅. 生態(tài)科學. 2006(05)
[9]鱖類魚類的線粒體DNA控制區(qū)結構及其系統(tǒng)發(fā)育分析(英文)[J]. 趙金良,王偉偉,李思發(fā),蔡完其. 遺傳學報. 2006(09)
[10]基于細胞色素b基因序列的東亞鱖類系統(tǒng)發(fā)育關系[J]. 趙金良,李思發(fā),蔡完其,王偉偉. 動物學報. 2006(04)
本文編號:3728091
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