飄魚微衛(wèi)星位點的篩選及珠江流域5個地理群體的遺傳多樣性分析
發(fā)布時間:2022-12-07 01:17
為了解珠江流域飄魚(Pseudolaubuca sinensis)群體間的遺傳多樣性及其分化程度,利用RAD-Seq技術(shù)開發(fā)出微衛(wèi)星位點,并設(shè)計了100對微衛(wèi)星引物,篩選出66個可穩(wěn)定擴(kuò)增出目的條帶的位點,其中16個具有較高的多態(tài)性(PIC>0.5),以2堿基重復(fù)居多。利用其中10對多態(tài)性位點對珠江流域的郁江(YuJ)、左江(ZJ)、右江(YJ)、融江(RJ)和桂江(GJ)飄魚群體進(jìn)行遺傳多樣性研究,得到有效等位基因數(shù)、觀測雜合度、期望雜合度范圍分別為5.2028—6.3800、0.6773—0.7667和0.7975—0.8425,表明珠江流域5個飄魚群體具有較高的遺傳多樣性,以YuJ群體遺傳多樣性最高, RJ群體遺傳多樣性為最低。且群體間各個遺傳參數(shù)相差較小,說明他們的遺傳多樣性水平相近。AMOVA分析顯示,遺傳變異主要來自于群體內(nèi)(98.45%),僅一小部分的變異來自于群體間(1.55%),總?cè)后w的遺傳分化系數(shù)Fst為0.015,兩兩群體間的Fst在–0.0033—0.0295波動,屬于低等程度的分化。群體間基因交流值(Nm)在8.2246—76.0075,表明群體間基因交流頻繁...
【文章頁數(shù)】:8 頁
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大口黑鱸3個養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 孫成飛,謝汶峰,胡婕,董浚鍵,田園園,吳灶和,葉星. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(02)
[2]基于RAD-seq技術(shù)開發(fā)靈寶杜鵑多態(tài)性SSR標(biāo)記[J]. 周曉君,王海亮,李方玲,張凱,王俞娜,押輝遠(yuǎn). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2019(01)
[3]江蘇省6個翹嘴鱖群體的遺傳多樣性分析[J]. 顏元杰,曹哲明,丁煒東,邴旭文. 海洋漁業(yè). 2019(01)
[4]RAD-seq技術(shù)在魚類基因組學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 劉濤,李蓉,肖蘅,陳善元. 云南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(06)
[5]A genome-wide association study on growth traits in orangespotted grouper(Epinephelus coioides) with RAD-seq genotyping[J]. Hui Yu,Xinxin You,Jia Li,Xinhui Zhang,Shuai Zhang,Shoujia Jiang,Xueqiang Lin,Hao-Ran Lin,Zining Meng,Qiong Shi. Science China(Life Sciences). 2018(08)
[6]基于微衛(wèi)星標(biāo)記的擬鯉遺傳多樣性及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 李可,馬徐發(fā),謝鵬,高萌,郭焱,謝從新,侯杰. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(04)
[7]實驗用狨猴微衛(wèi)星引物篩選及遺傳多樣性分析[J]. 滕永康,劉先菊,張旭,向志光,阮研碩,肖沖,劉云波. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(06)
[8]郁江中游金陵江段魚類早期資源現(xiàn)狀[J]. 徐田振,李新輝,李躍飛,楊計平,武智,朱書禮,李捷. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2018(02)
[9]基于RAD-seq數(shù)據(jù)開發(fā)煙草多態(tài)性SSR標(biāo)記[J]. 李海洋,李榮華,夏巖石,袁清華,張振臣,趙偉才,郭培國. 中國煙草科學(xué). 2018(01)
[10]RAD測序技術(shù)及其在水生生物研究中的應(yīng)用[J]. 胡景杰,任紅艷. 水產(chǎn)科學(xué). 2018(01)
本文編號:3711971
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【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]大口黑鱸3個養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 孫成飛,謝汶峰,胡婕,董浚鍵,田園園,吳灶和,葉星. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(02)
[2]基于RAD-seq技術(shù)開發(fā)靈寶杜鵑多態(tài)性SSR標(biāo)記[J]. 周曉君,王海亮,李方玲,張凱,王俞娜,押輝遠(yuǎn). 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報. 2019(01)
[3]江蘇省6個翹嘴鱖群體的遺傳多樣性分析[J]. 顏元杰,曹哲明,丁煒東,邴旭文. 海洋漁業(yè). 2019(01)
[4]RAD-seq技術(shù)在魚類基因組學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 劉濤,李蓉,肖蘅,陳善元. 云南大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2018(06)
[5]A genome-wide association study on growth traits in orangespotted grouper(Epinephelus coioides) with RAD-seq genotyping[J]. Hui Yu,Xinxin You,Jia Li,Xinhui Zhang,Shuai Zhang,Shoujia Jiang,Xueqiang Lin,Hao-Ran Lin,Zining Meng,Qiong Shi. Science China(Life Sciences). 2018(08)
[6]基于微衛(wèi)星標(biāo)記的擬鯉遺傳多樣性及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 李可,馬徐發(fā),謝鵬,高萌,郭焱,謝從新,侯杰. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報. 2018(04)
[7]實驗用狨猴微衛(wèi)星引物篩選及遺傳多樣性分析[J]. 滕永康,劉先菊,張旭,向志光,阮研碩,肖沖,劉云波. 中國比較醫(yī)學(xué)雜志. 2018(06)
[8]郁江中游金陵江段魚類早期資源現(xiàn)狀[J]. 徐田振,李新輝,李躍飛,楊計平,武智,朱書禮,李捷. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2018(02)
[9]基于RAD-seq數(shù)據(jù)開發(fā)煙草多態(tài)性SSR標(biāo)記[J]. 李海洋,李榮華,夏巖石,袁清華,張振臣,趙偉才,郭培國. 中國煙草科學(xué). 2018(01)
[10]RAD測序技術(shù)及其在水生生物研究中的應(yīng)用[J]. 胡景杰,任紅艷. 水產(chǎn)科學(xué). 2018(01)
本文編號:3711971
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