桃拉綜合征病毒的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條(LAMP-LFD)檢測方法的建立
發(fā)布時間:2022-10-15 21:03
桃拉綜合征病毒(Taura syndrome virus, TSV)是威脅蝦類養(yǎng)殖業(yè)的主要病毒之一。本試驗(yàn)建立了一種快速檢測TSV的環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條(LAMP-LFD)方法,并與熒光定量PCR(qPCR)進(jìn)行了對比;赥SV的衣殼蛋白VP2核酸序列,設(shè)計(jì)3對特異性引物(外引物:FIP/BIP,內(nèi)引物:F3/B3,環(huán)引物:LF/LB),進(jìn)行LAMP反應(yīng)體系的優(yōu)化。其中引物L(fēng)F以BIO標(biāo)記,LB以FAM標(biāo)記,用于橫向流動試紙條(LFD)的檢測。結(jié)果表明:LAMP最佳反應(yīng)可在63℃恒溫條件下40 min內(nèi)完成。整個擴(kuò)增反應(yīng)到LFD結(jié)果判定可在45 min內(nèi)完成。LAMP-LFD可特異性檢出TSV特異性片段,未與其它病毒和細(xì)菌發(fā)生交叉反應(yīng),且其檢測限為22.9 fg。與qPCR相比,本研究所建立的LAMP-LFD檢測體系雖然檢測限高于qPCR 10倍,但比qPCR檢測時間縮短近1 h,且LAMP-LFD特異性強(qiáng)、操作簡單,無需特殊儀器設(shè)備,可快捷、方便地檢測出TSV,滿足TSV基層快速檢測的需要。
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試劑
1.2 引物的設(shè)計(jì)
1.3 LAMP反應(yīng)體系和條件
1.4 LAMP反應(yīng)參數(shù)的優(yōu)化
1.5 熒光定量PCR(qPCR)反應(yīng)
1.6 LAMP產(chǎn)物的LFD檢測
1.7 特異性評價
1.8 靈敏度評價
1.9 臨床實(shí)際樣品檢測
2 結(jié)果與分析
2.1 LAMP體系的優(yōu)化
2.2 LAMP-LFD特異性分析
2.3 LAMP-LFD靈敏度分析
2.4 實(shí)際樣品檢測
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條檢測草魚呼腸孤病毒方法的建立[J]. 劉露,李偉哲,肖勤. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[2]應(yīng)用LAMP-LFD技術(shù)可視化檢測河流弧菌(Vibrio fluvialis)的研究[J]. 楊夢香,柴方超,周前進(jìn),苗亮,黃光亮,陳炯. 海洋與湖沼. 2017(02)
[3]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條可視化檢測哈維氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前進(jìn),陳炯. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(06)
[4]變形桿菌環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測法的可視化方法的比較[J]. 申培立,王羽,李志輝,郭夢冉,馬曉燕,張偉,馬雯,李英軍,檀建新. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]凡納濱對蝦不同生長階段的蛋白質(zhì)需要量[J]. 黃文文,鄭昌區(qū),霍雅文,黎明,周歧存. 動物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2014(09)
[6]液相芯片技術(shù)同時檢測對蝦桃拉病毒和蝦黃頭病毒的研究[J]. 尹偉力,張四化,岳志芹,鄭小龍,劉葒. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(01)
[7]快速熒光定量RT-PCR檢測對蝦Taura綜合征病毒(TSV)的方法建立與應(yīng)用[J]. 顧松葉,王忠發(fā),施慧,沈飚. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(09)
[8]對蝦白斑綜合征病毒LAMP檢測方法的建立[J]. 馮華,張改平,郭軍慶,王愛萍,趙麗娜,杜曉明,王林林. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2011(07)
[9]桃拉綜合征病毒中國株ZHZC3全基因測序及分子結(jié)構(gòu)預(yù)測[J]. 黃新新,陸承平. Virologica Sinica. 2006(03)
[10]RT-PCR法檢測我國東南沿海凡納濱對蝦的桃拉綜合征病毒[J]. 黃新新,莫勝蘭,陸承平. 中國病毒學(xué). 2005(05)
本文編號:3692035
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 試劑
1.2 引物的設(shè)計(jì)
1.3 LAMP反應(yīng)體系和條件
1.4 LAMP反應(yīng)參數(shù)的優(yōu)化
1.5 熒光定量PCR(qPCR)反應(yīng)
1.6 LAMP產(chǎn)物的LFD檢測
1.7 特異性評價
1.8 靈敏度評價
1.9 臨床實(shí)際樣品檢測
2 結(jié)果與分析
2.1 LAMP體系的優(yōu)化
2.2 LAMP-LFD特異性分析
2.3 LAMP-LFD靈敏度分析
2.4 實(shí)際樣品檢測
3 結(jié)論與討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條檢測草魚呼腸孤病毒方法的建立[J]. 劉露,李偉哲,肖勤. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2018(02)
[2]應(yīng)用LAMP-LFD技術(shù)可視化檢測河流弧菌(Vibrio fluvialis)的研究[J]. 楊夢香,柴方超,周前進(jìn),苗亮,黃光亮,陳炯. 海洋與湖沼. 2017(02)
[3]環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增聯(lián)合橫向流動試紙條可視化檢測哈維氏弧菌的研究[J]. 程蝶,柴方超,蔡怡,周前進(jìn),陳炯. 生物技術(shù)通報(bào). 2016(06)
[4]變形桿菌環(huán)介導(dǎo)等溫?cái)U(kuò)增檢測法的可視化方法的比較[J]. 申培立,王羽,李志輝,郭夢冉,馬曉燕,張偉,馬雯,李英軍,檀建新. 河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2016(03)
[5]凡納濱對蝦不同生長階段的蛋白質(zhì)需要量[J]. 黃文文,鄭昌區(qū),霍雅文,黎明,周歧存. 動物營養(yǎng)學(xué)報(bào). 2014(09)
[6]液相芯片技術(shù)同時檢測對蝦桃拉病毒和蝦黃頭病毒的研究[J]. 尹偉力,張四化,岳志芹,鄭小龍,劉葒. 水產(chǎn)科學(xué). 2014(01)
[7]快速熒光定量RT-PCR檢測對蝦Taura綜合征病毒(TSV)的方法建立與應(yīng)用[J]. 顧松葉,王忠發(fā),施慧,沈飚. 中國衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(09)
[8]對蝦白斑綜合征病毒LAMP檢測方法的建立[J]. 馮華,張改平,郭軍慶,王愛萍,趙麗娜,杜曉明,王林林. 中國獸醫(yī)科學(xué). 2011(07)
[9]桃拉綜合征病毒中國株ZHZC3全基因測序及分子結(jié)構(gòu)預(yù)測[J]. 黃新新,陸承平. Virologica Sinica. 2006(03)
[10]RT-PCR法檢測我國東南沿海凡納濱對蝦的桃拉綜合征病毒[J]. 黃新新,莫勝蘭,陸承平. 中國病毒學(xué). 2005(05)
本文編號:3692035
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3692035.html
最近更新
教材專著