烏鱧性別相關(guān)的Dmrt基因的克隆及其組織表達(dá)特征
發(fā)布時(shí)間:2022-07-29 18:08
近年來隨著養(yǎng)殖業(yè)的需要,烏鱧(Channa argu)逐漸成為國內(nèi)的特種養(yǎng)殖品種。為提高烏鱧子代雄性率及開展烏鱧的單性養(yǎng)殖,本研究采用RT-PCR和RACE的方法克隆出了烏鱧的Dmrt1基因和Dmrt4的部分基因,并對(duì)Dmrt1的表達(dá)特性進(jìn)行了具體的分析,這將有助于了解烏鱧的性別決定機(jī)制。Dmrt基因是涉及到性別決定和分化的保守基因家族,它廣泛存在于不同物種中。本研究通過使用簡(jiǎn)并引物從烏鱧的基因組DNA中獲得了Dmrt1的保守域DM1及Dmrt4的保守域DM4,對(duì)DM結(jié)構(gòu)域進(jìn)行測(cè)序,通過比對(duì)確定為Dmrt基因的保守域。根據(jù)獲得的保守域序列,設(shè)計(jì)3’RACE和5’RACE的引物,采用RACE的方法擴(kuò)增Dmrt的全長(zhǎng)cDNA。在烏鱧的精巢組織克隆得到烏鱧Dmrt1基因的cDNA序列,并采用半定量和定量的手段對(duì)Dmrt1mRNA在烏鱧成魚中不同組織的表達(dá)差異進(jìn)行分析。研究獲得的烏鱧Dmrt1基因cDNA全長(zhǎng)為1573bp,5’端非翻譯區(qū)25bp,編碼266個(gè)氨基酸的800bp的開放閱讀框,747bp含有脊椎動(dòng)物典型的多腺苷酸化加尾信號(hào)AATAAA的3’端非翻譯區(qū)。通過對(duì)氨基酸序列的同源性進(jìn)行...
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1 烏鱧的養(yǎng)殖情況和其研究意義
2 魚類的性別決定
2.1 魚類的性別及性染色體
2.2 魚類性別決定相關(guān)因素
3 Dmrt 基因的研究現(xiàn)狀
3.1 Dmrt 基因的發(fā)現(xiàn)
3.2 魚類 Dmrt 基因的研究現(xiàn)狀
4 本論文的研究意義
4.1 理論意義
4.2 生產(chǎn)意義
第2章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用魚
1.2 實(shí)驗(yàn)藥品與儀器
1.2.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
1.2.2 主要實(shí)驗(yàn)藥品和配制方法
1.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.3.1 DM 區(qū)的引物
1.3.2 3′RACE 引物
1.3.3 5′RACE 引物
1.3.4 驗(yàn)證 Dmrt1 全長(zhǎng)的引物
1.3.5 用于定量分析的引物
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 烏鱧基因組 DNA 的提取
2.2 烏鱧精巢總 RNA 的提取
2.3 瓊脂糖凝膠電泳
2.4 瓊脂糖凝膠中回收 DNA
2.5 PCR 擴(kuò)增 DM 結(jié)構(gòu)域
2.6 烏鱧總 RNA 的反轉(zhuǎn)錄
2.7 3′RACE 擴(kuò)增 Dmrt 的 3′端
2.8 5′RACE 擴(kuò)增 Dmrt 的 5′端
2.9 PCR 產(chǎn)物的連接反應(yīng)
2.10 重組質(zhì)粒的篩選
2.11 菌種的保存
第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1 烏鱧基因組 DNA 的提取
2 烏鱧精巢總 RNA 的提取
3 DM-domain 區(qū)的擴(kuò)增
4 Dmrt1 基因的序列分析
4.1 Dmrt1 保守域的比對(duì)
4.2 烏鱧Dmrt1基因的3′RACE和5′RACE
4.3 烏鱧 Dmrt1 氨基酸的同源性分析
4.4 烏鱧 Dmrt1 系統(tǒng)樹的分析
4.5 Dmrt1 基因在成體烏鱧不同組織的表達(dá)
5 Dmrt4 基因的序列分析
5.1 Dmrt4 保守域的對(duì)比
5.2 烏鱧 Dmrt4 基因的 5′RACE
第4章 討論
1 烏鱧 Dmrt1 基因結(jié)構(gòu)、表達(dá)
2 烏鱧 Dmrt4 基因結(jié)構(gòu)
3 Dmrt 家族的特點(diǎn)
4 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
結(jié)語
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]團(tuán)頭魴Dmrt4基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 蘇利娜,丁祝進(jìn),李鴻,周鳳娟,王衛(wèi)民,劉紅. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]魚類DMRT基因的研究進(jìn)展[J]. 曹謹(jǐn)玲,陳劍杰,甘西,羅永巨. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
[3]共同祖先原則和系統(tǒng)發(fā)育樹的解讀[J]. 韓鳳俠. 生物學(xué)通報(bào). 2008(09)
[4]尼羅羅非魚Dmrt1基因克隆及在不同組織中的表達(dá)[J]. 楊東,余來寧. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(07)
[5]半滑舌鰨DMRT 1基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 孫業(yè)盈,張全啟,齊潔,王志剛,陳妍婕,李春梅,鐘其旺. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2008(02)
[6]Dmrt基因家族的研究近況[J]. 吳寶林,葛熹凱,何榮華. 內(nèi)陸水產(chǎn). 2007(06)
[7]Expression Detection of DMRTs and Two sox9 Genes in Takifugu rubripes (Tetraodontidae, Vertebrata)[J]. SHEN Xueyan, CUI Jianzhou, YANG Guanpin, GONG Qingli, and GU Qianqun Division of Life Science and Technology, Ocean University of China, Qingdao 266003, P. R. China. Journal of Ocean University of China. 2007(02)
[8]奧利亞羅非魚DMRT1,DMO基因片段的克隆及序列分析[J]. 唐永凱,王光花,吳婷婷. 生物技術(shù). 2006(02)
[9]Dmrt基因的功能和特點(diǎn)[J]. 程子華. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(05)
[10]SOX、DMRT性別決定基因家族及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 李楠,王秀利,仇雪梅. 生物技術(shù)通報(bào). 2005(03)
本文編號(hào):3666929
【文章頁數(shù)】:50 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第1章 緒論
1 烏鱧的養(yǎng)殖情況和其研究意義
2 魚類的性別決定
2.1 魚類的性別及性染色體
2.2 魚類性別決定相關(guān)因素
3 Dmrt 基因的研究現(xiàn)狀
3.1 Dmrt 基因的發(fā)現(xiàn)
3.2 魚類 Dmrt 基因的研究現(xiàn)狀
4 本論文的研究意義
4.1 理論意義
4.2 生產(chǎn)意義
第2章 實(shí)驗(yàn)材料與方法
1 實(shí)驗(yàn)材料
1.1 實(shí)驗(yàn)用魚
1.2 實(shí)驗(yàn)藥品與儀器
1.2.1 主要實(shí)驗(yàn)儀器
1.2.2 主要實(shí)驗(yàn)藥品和配制方法
1.3 引物設(shè)計(jì)與合成
1.3.1 DM 區(qū)的引物
1.3.2 3′RACE 引物
1.3.3 5′RACE 引物
1.3.4 驗(yàn)證 Dmrt1 全長(zhǎng)的引物
1.3.5 用于定量分析的引物
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 烏鱧基因組 DNA 的提取
2.2 烏鱧精巢總 RNA 的提取
2.3 瓊脂糖凝膠電泳
2.4 瓊脂糖凝膠中回收 DNA
2.5 PCR 擴(kuò)增 DM 結(jié)構(gòu)域
2.6 烏鱧總 RNA 的反轉(zhuǎn)錄
2.7 3′RACE 擴(kuò)增 Dmrt 的 3′端
2.8 5′RACE 擴(kuò)增 Dmrt 的 5′端
2.9 PCR 產(chǎn)物的連接反應(yīng)
2.10 重組質(zhì)粒的篩選
2.11 菌種的保存
第3章 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
1 烏鱧基因組 DNA 的提取
2 烏鱧精巢總 RNA 的提取
3 DM-domain 區(qū)的擴(kuò)增
4 Dmrt1 基因的序列分析
4.1 Dmrt1 保守域的比對(duì)
4.2 烏鱧Dmrt1基因的3′RACE和5′RACE
4.3 烏鱧 Dmrt1 氨基酸的同源性分析
4.4 烏鱧 Dmrt1 系統(tǒng)樹的分析
4.5 Dmrt1 基因在成體烏鱧不同組織的表達(dá)
5 Dmrt4 基因的序列分析
5.1 Dmrt4 保守域的對(duì)比
5.2 烏鱧 Dmrt4 基因的 5′RACE
第4章 討論
1 烏鱧 Dmrt1 基因結(jié)構(gòu)、表達(dá)
2 烏鱧 Dmrt4 基因結(jié)構(gòu)
3 Dmrt 家族的特點(diǎn)
4 系統(tǒng)發(fā)育樹的構(gòu)建
結(jié)語
參考文獻(xiàn)
致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]團(tuán)頭魴Dmrt4基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 蘇利娜,丁祝進(jìn),李鴻,周鳳娟,王衛(wèi)民,劉紅. 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(06)
[2]魚類DMRT基因的研究進(jìn)展[J]. 曹謹(jǐn)玲,陳劍杰,甘西,羅永巨. 廣東海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2011(01)
[3]共同祖先原則和系統(tǒng)發(fā)育樹的解讀[J]. 韓鳳俠. 生物學(xué)通報(bào). 2008(09)
[4]尼羅羅非魚Dmrt1基因克隆及在不同組織中的表達(dá)[J]. 楊東,余來寧. 湖北農(nóng)業(yè)科學(xué). 2008(07)
[5]半滑舌鰨DMRT 1基因的克隆與表達(dá)分析[J]. 孫業(yè)盈,張全啟,齊潔,王志剛,陳妍婕,李春梅,鐘其旺. 武漢大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2008(02)
[6]Dmrt基因家族的研究近況[J]. 吳寶林,葛熹凱,何榮華. 內(nèi)陸水產(chǎn). 2007(06)
[7]Expression Detection of DMRTs and Two sox9 Genes in Takifugu rubripes (Tetraodontidae, Vertebrata)[J]. SHEN Xueyan, CUI Jianzhou, YANG Guanpin, GONG Qingli, and GU Qianqun Division of Life Science and Technology, Ocean University of China, Qingdao 266003, P. R. China. Journal of Ocean University of China. 2007(02)
[8]奧利亞羅非魚DMRT1,DMO基因片段的克隆及序列分析[J]. 唐永凱,王光花,吳婷婷. 生物技術(shù). 2006(02)
[9]Dmrt基因的功能和特點(diǎn)[J]. 程子華. 安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2006(05)
[10]SOX、DMRT性別決定基因家族及其應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 李楠,王秀利,仇雪梅. 生物技術(shù)通報(bào). 2005(03)
本文編號(hào):3666929
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