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基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達(dá)

發(fā)布時(shí)間:2022-07-19 14:43
  翹嘴鱖(Siniperca chuatsi)隸屬于鱸形目(Perciformes)、鱖亞科(Sinipercinae)、鱖屬(Siniperca),俗稱(chēng)桂魚(yú)、桂花魚(yú)、胖鱖、季花魚(yú)等,是淡水底棲的肉食性魚(yú)類(lèi)。它具有體型大、生長(zhǎng)快、味道鮮美等特點(diǎn),是我國(guó)重要的名貴經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)和養(yǎng)殖對(duì)象。但是,近年來(lái)由于江河過(guò)度捕撈、水域生態(tài)環(huán)境惡化及養(yǎng)殖生產(chǎn)中近親繁殖等原因,導(dǎo)致自然種質(zhì)資源衰退、養(yǎng)殖種質(zhì)性狀退化、魚(yú)類(lèi)疾病不斷爆發(fā)等現(xiàn)狀,已影響到翹嘴鱖種質(zhì)延續(xù)及其養(yǎng)殖業(yè)的正常發(fā)展。迫切需要運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)手段開(kāi)展翹嘴鱖種質(zhì)資源保護(hù)及良種選育等方面的研究。為此,本研究采用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)開(kāi)發(fā)了與翹嘴鱖生長(zhǎng)相關(guān)EST-SSR分子標(biāo)記,分析了部分與經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)的基因位點(diǎn),檢測(cè)了翹嘴鱖4個(gè)養(yǎng)殖群體(鄱陽(yáng)湖、洞庭湖、太湖和長(zhǎng)江口群體)的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性;克隆了翹嘴鱖MHC class I基因并進(jìn)行了不同組織的表達(dá)分析,旨在為翹嘴鱖種質(zhì)資源保護(hù)及良種選育提供理論基礎(chǔ),主要研究結(jié)果如下:1基于翹嘴鱖轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的EST-SSR標(biāo)記開(kāi)發(fā)、驗(yàn)證1通過(guò)Illumina高通量測(cè)序平臺(tái)對(duì)翹嘴鱖進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。組裝和轉(zhuǎn)錄組拼接后共... 

【文章頁(yè)數(shù)】:75 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達(dá)


組裝后的序列長(zhǎng)度分布圖

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達(dá)


翹嘴鱖基因的GO功能分類(lèi)Fig.1-2GeneOntology(GO)classificationofputativefunctionsofunigenesfrom

基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標(biāo)記的開(kāi)發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達(dá)


C15209位點(diǎn)在翹嘴鱖中的擴(kuò)增結(jié)果


本文編號(hào):3663604

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