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基于轉(zhuǎn)錄組測序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達

發(fā)布時間:2022-07-19 14:43
  翹嘴鱖(Siniperca chuatsi)隸屬于鱸形目(Perciformes)、鱖亞科(Sinipercinae)、鱖屬(Siniperca),俗稱桂魚、桂花魚、胖鱖、季花魚等,是淡水底棲的肉食性魚類。它具有體型大、生長快、味道鮮美等特點,是我國重要的名貴經(jīng)濟魚類和養(yǎng)殖對象。但是,近年來由于江河過度捕撈、水域生態(tài)環(huán)境惡化及養(yǎng)殖生產(chǎn)中近親繁殖等原因,導致自然種質(zhì)資源衰退、養(yǎng)殖種質(zhì)性狀退化、魚類疾病不斷爆發(fā)等現(xiàn)狀,已影響到翹嘴鱖種質(zhì)延續(xù)及其養(yǎng)殖業(yè)的正常發(fā)展。迫切需要運用現(xiàn)代分子生物學手段開展翹嘴鱖種質(zhì)資源保護及良種選育等方面的研究。為此,本研究采用轉(zhuǎn)錄組測序技術開發(fā)了與翹嘴鱖生長相關EST-SSR分子標記,分析了部分與經(jīng)濟性狀相關的基因位點,檢測了翹嘴鱖4個養(yǎng)殖群體(鄱陽湖、洞庭湖、太湖和長江口群體)的遺傳結(jié)構(gòu)和遺傳多樣性;克隆了翹嘴鱖MHC class I基因并進行了不同組織的表達分析,旨在為翹嘴鱖種質(zhì)資源保護及良種選育提供理論基礎,主要研究結(jié)果如下:1基于翹嘴鱖轉(zhuǎn)錄組測序的EST-SSR標記開發(fā)、驗證1通過Illumina高通量測序平臺對翹嘴鱖進行了轉(zhuǎn)錄組測序。組裝和轉(zhuǎn)錄組拼接后共... 

【文章頁數(shù)】:75 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于轉(zhuǎn)錄組測序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達


組裝后的序列長度分布圖

基于轉(zhuǎn)錄組測序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達


翹嘴鱖基因的GO功能分類Fig.1-2GeneOntology(GO)classificationofputativefunctionsofunigenesfrom

基于轉(zhuǎn)錄組測序的翹嘴鱖微衛(wèi)星標記的開發(fā)及MCH class Ⅰ基因的克隆表達


C15209位點在翹嘴鱖中的擴增結(jié)果


本文編號:3663604

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