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海水養(yǎng)殖魚哈維弧菌分離株多位點序列分析及耐藥譜型研究

發(fā)布時間:2022-07-01 09:57
  哈維弧菌(Vibrio harveyi)是一種革蘭氏陰性菌,廣泛分布于海水養(yǎng)殖環(huán)境,能夠在有利條件下感染水產動物,引起宿主復雜多樣的臨床致病癥狀,造成非常高的死亡率,給水產養(yǎng)殖經濟產業(yè)帶來巨大打擊。然而,此菌與其類似菌種如坎氏弧菌、副溶血弧菌等具有極其高的表型和基因型相似度,對其進行準確的鑒定分型存在諸多困難。此外,對該菌的耐藥譜型特點進行研究可為流行病學調查和合理用藥提供指導,是許多研究者目前關注的重點。本研究利用多位點序列分析法對采集自2007-2012年我國南方沿海地區(qū)患病海水魚的哈維弧菌分離株進行鑒定分型,探究多基因位點序列對哈維弧菌類似群的區(qū)分力及哈維弧菌分離株多基因位點分型情況。采用K-B法對鑒定的哈維弧菌分離株進行12種抗生素的敏感性實驗,研究其耐藥譜型特點,運用耐藥性情況SPSS聚類分析進一步對哈維弧菌分離株進行分型,探究分型的菌株的耐藥性特征。結果如下:1.利用6個保守基因位點16S rRNA、mreB、rctB、rpoD、topA、toxR分別對210株采樣分離株進行測序鑒定。通過PCR、測序比對得到95株哈維弧菌類似群菌株,7株創(chuàng)傷弧菌菌株;基因序列的進化分析和系... 

【文章頁數(shù)】:84 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1. 哈維弧菌概況
        1.1 哈維弧菌分類地位及命名
        1.2 哈維弧菌生物學特性及分布
        1.3 哈維弧菌流行病學及致病性
        1.4 哈維弧菌防治及耐藥譜
    2. 哈維類似群(V. harveyi clades)的分子鑒定及分型研究進展
        2.1 哈維類似群
        2.2 哈維弧菌類似群的分子鑒定方法
        2.3 哈維弧菌類似群的分子分型方法
    3. 本論文研究目的和意義
第二章 哈維弧菌單基因位點序列分析
    2.1 材料與方法
        2.1.1 實驗材料
        2.1.2 實驗方法
    2.2 結果與分析
        2.2.1 受試菌株的活化及純化
        2.2.2 PCR 擴增及電泳檢測
        2.2.3 測序及 BLAST 結果
        2.2.4 系統(tǒng)進化樹構建
        2.2.5 基因序列進化分析
    2.3 討論
第三章 哈維弧菌串聯(lián)基因位點序列分析
    3.1 材料與方法
        3.1.1 實驗材料
        3.1.2 實驗方法
    3.2 結果與分析
        3.2.1 串聯(lián)基因的多態(tài)性情況
        3.2.2 串聯(lián)基因序列的遺傳距離情況
        3.2.3 基因區(qū)分力情況
        3.2.4 串聯(lián)基因構建的系統(tǒng)進化樹
        3.2.5 基于 5 基因串聯(lián)分析的哈維弧菌分離株分型情況
    3.3 討論
第四章 哈維弧菌分離株耐藥譜型研究
    4.1 材料及方法
        4.1.1 菌株來源
        4.1.2 藥物敏感性實驗
        4.1.3 哈維弧菌耐藥譜分析
        4.1.4 基于耐藥譜的哈維弧菌分型
        4.1.5 相關名詞解釋
    4.2 結果
        4.2.1 哈維弧菌的耐藥譜
        4.2.2 基于耐藥譜的哈維弧菌分型
    4.3 討論
        4.3.1 哈維弧菌耐藥情況
        4.3.2 哈維弧菌耐藥性與來源相關性分析
        4.3.3 基于耐藥譜的哈維弧菌的分型分析
        4.3.4 菌株耐藥譜分型與基因分型的相關性分析
總結
參考文獻
附錄
致謝



本文編號:3654026

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