合浦珠母貝（Pinctada fucata）是養(yǎng)殖海水珍珠的主要貝類之一。近年來，合浦珠母貝頻頻出現(xiàn)大量死亡、個(gè)體小型化等現(xiàn)象。因此，近年來相繼開展了合浦珠母貝的遺傳改良計(jì)劃。為了保障遺傳改良的可持續(xù)性，必須充分了解選育種群或家系的遺傳結(jié)構(gòu)與遺傳多樣性。微衛(wèi)星標(biāo)記是種群遺傳分析的重要手段，為此，本論文開展了微衛(wèi)星標(biāo)記篩選與合浦珠母貝選育種群的遺傳分析，以期為合浦珠母貝的良種選育提供理論指導(dǎo)。主要結(jié)果如下：1.合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記篩選�；诤掀种槟肛愞D(zhuǎn)錄組部分測(cè)序結(jié)果設(shè)計(jì)引物，用合浦珠母貝野生群體篩選了微衛(wèi)星分子標(biāo)記，結(jié)果獲得20對(duì)有多態(tài)位點(diǎn)的微衛(wèi)星標(biāo)記。每個(gè)位點(diǎn)等位基因數(shù)目為2-6個(gè)，觀測(cè)雜合度為0.0263-1.0000，期望雜合度為0.0506-0.7424，有10個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)極顯著地偏離了哈迪-溫伯格平衡（P<0.01）�；诤掀种槟肛惢虿輬D結(jié)果設(shè)計(jì)微衛(wèi)星引物，用合浦珠母貝野生群體篩選微衛(wèi)星分子標(biāo)記，結(jié)果獲得15對(duì)有多態(tài)位點(diǎn)的微衛(wèi)星標(biāo)記。每個(gè)位點(diǎn)等位基因數(shù)目為3-8個(gè)，觀測(cè)雜合度為0.1154-0.6216，期望雜合度為0.490-0.8491，有14個(gè)微衛(wèi)星位點(diǎn)極顯著的... 

【文章頁數(shù)】：84 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
上海海洋大學(xué) 碩士學(xué)位論文答辯委員會(huì)成員名單
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1. 合浦珠母貝簡介及研究進(jìn)展
        1.1. 合浦珠母貝簡介
        1.2. 合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記研究進(jìn)展
    2. 微衛(wèi)星分子標(biāo)記技術(shù)及其在貝類研究中的應(yīng)用
        2.1 微衛(wèi)星分子標(biāo)記簡介
        2.2 微衛(wèi)星標(biāo)記在貝類動(dòng)物中的應(yīng)用
            2.2.1 種群遺傳多樣性分析
            2.2.2 種群遺傳結(jié)構(gòu)分析
            2.2.3 雜種優(yōu)勢(shì)分析
            2.2.4 親緣關(guān)系鑒定
            2.2.5 遺傳圖譜的構(gòu)建
    3 遺傳多樣性研究與應(yīng)用
        3.1 遺傳多樣性的定義及研究意義
        3.2 遺傳多樣性的檢測(cè)指標(biāo)
            3.2.1 等位基因數(shù)
            3.2.2 雜合度
            3.2.3 多態(tài)信息含量
        3.3 貝類遺傳多樣性研究與應(yīng)用
    4 本研究的目的和意義
第二章 合浦珠母貝微衛(wèi)星引物的篩選
    第一節(jié) 合浦珠母貝轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果中的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選
        1. 材料
            1.1 樣本材料
            1.2 序列來源
        2. 方法
            2.1 樣本 DNA 的提取
            2.2 引物篩選、設(shè)計(jì)與 PCR 擴(kuò)增
            2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
        3. 結(jié)果
        4. 討論
    第二節(jié) 合浦珠母貝基因組測(cè)序結(jié)果中的微衛(wèi)星標(biāo)記篩選
        1. 材料
            1.1 樣本材料
            1.2 序列來源
        2. 方法
            2.1 樣本 DNA 的提取
            2.2 引物篩選、設(shè)計(jì)與 PCR 擴(kuò)增
            2.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析
        3. 結(jié)果
        4. 討論
第三章 合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記與生長相關(guān)性的初步分析
    1. 材料
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 微衛(wèi)星引物
    2. 方法
        2.1 表型性狀測(cè)量
        2.2 DNA 樣本的采集和基因組 DNA 的提取
        2.3 PCR 反應(yīng)及電泳
        2.4 性狀相關(guān)微衛(wèi)星位點(diǎn)的篩選
        2.5 數(shù)據(jù)分析
    3. 結(jié)果
        3.1 生長性狀分布結(jié)果
        3.2 與合浦珠母貝生長性狀相關(guān)位點(diǎn)的初步篩選
        3.3 與合浦珠母貝體重、殼長、殼高、殼寬、閉殼肌重的關(guān)聯(lián)分析
    4. 討論
第四章 合浦珠母貝選育群體的遺傳多樣性分析
    1. 實(shí)驗(yàn)材料
        1.1 親貝來源
        1.2 樣品制備
    2. 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 樣本 DNA 的提取
        2.2 引物篩選與 PCR 擴(kuò)增
        2.3 擴(kuò)增產(chǎn)物電泳分析
        2.4 數(shù)據(jù)分析
    3. 結(jié)果
        3.1 群體遺傳多樣性分析
    4. 討論
第五章 合浦珠母貝選育群體遺傳結(jié)構(gòu)與性狀表現(xiàn)的相關(guān)性研究
    1. 材料與方法
        1.1 試驗(yàn)材料
        1.2 性狀表現(xiàn)值的測(cè)定
        1.3 遺傳多樣性參數(shù)與性狀表現(xiàn)相關(guān)性分析
    2. 結(jié)果
        2.1 群體雜合度結(jié)果
        2.2 個(gè)體雜合度結(jié)果
    3. 討論
第六章 結(jié)論
參考文獻(xiàn)
附錄1 縮略詞表
附錄2 碩士期間發(fā)表的論文和參加的會(huì)議
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]水產(chǎn)動(dòng)物重要經(jīng)濟(jì)性狀相關(guān)功能基因的研究進(jìn)展[J]. 劉月星,馬洪雨,馬春艷,蔣偉,李淑娟,馬凌波.  生物技術(shù)通報(bào). 2014(02)
[2]馬氏珠母貝家系遺傳結(jié)構(gòu)的微衛(wèi)星分析[J]. 湯健,管云雁,劉文廣,何毛賢.  海洋科學(xué). 2013(08)
[3]合浦珠母貝家系遺傳多樣性與性狀相關(guān)性[J]. 許成帥,范嗣剛,黃桂菊,郭奕慧,劉寶鎖,薛桂英,李璐,龍敏明,喻達(dá)輝.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2013(12)
[4]皺紋盤鮑微衛(wèi)星多重PCR體系構(gòu)建及其在家系鑒定中的應(yīng)用[J]. 聶鴻濤,李琪,孔令鋒.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(02)
[5]馬氏珠母貝生長性狀與EST-SSR標(biāo)記的關(guān)聯(lián)分析[J]. 鄧岳文,高遠(yuǎn)鎮(zhèn),王學(xué)穎,杜曉東.  農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2013(01)
[6]海灣扇貝雜交、近交和自交家系的微衛(wèi)星標(biāo)記偏分離分析[J]. 王宇,李莉,張守都,鄭懷平,張國范.  海洋科學(xué). 2012(08)
[7]三疣梭子蟹微衛(wèi)星標(biāo)記與生長相關(guān)性狀的相關(guān)性分析[J]. 劉磊,李健,劉萍,趙法箴,高保全,杜盈,馬春艷.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(07)
[8]合浦珠母貝微衛(wèi)星標(biāo)記的家系篩選[J]. 油九菊,黃桂菊,范嗣剛,陳飛飛,郝博飛,曲妮妮,喻達(dá)輝.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(13)
[9]合浦珠母貝三亞養(yǎng)殖群體生長性狀的相關(guān)與通徑分析[J]. 陳飛飛,黃桂菊,陳明強(qiáng),油九菊,李有寧,吳開暢,邢孔武,喻達(dá)輝.  廣東農(nóng)業(yè)科學(xué). 2012(09)
[10]利用微衛(wèi)星標(biāo)記對(duì)文蛤4個(gè)殼色花紋品系的遺傳分析[J]. 朱東麗,董迎輝,林志華,姚韓韓.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(02)

博士論文
[1]合浦珠母貝貝殼珍珠層形成機(jī)理的研究[D]. 閆振廣.清華大學(xué) 2008

碩士論文
[1]馬氏珠母貝EST-SSR和SNP標(biāo)記開發(fā)及其與生長及珍珠層性狀的關(guān)聯(lián)分析[D]. 邱櫻.海南大學(xué) 2013
[2]合浦珠母貝選育群體與家系的遺傳多樣性及其與生長表現(xiàn)的相關(guān)性分析[D]. 許成帥.上海海洋大學(xué) 2013



本文編號(hào)：3649378