2018年8月至2019年3月,在浙江舟山、福建福州、福建廈門、廣西北海和廣東湛江5個近海水域,各采集約20尾日本囊對蝦,取其腹部第六腹節(jié)肌肉,利用線粒體細胞色素b基因和DNA控制區(qū)分析方法,研究日本囊對蝦這5個地理群體的種群遺傳結(jié)構(gòu)及變異情況,探明我國日本囊對蝦種質(zhì)資源現(xiàn)狀。Cytb和D-Loop序列分析發(fā)現(xiàn),5個群體中A+T含量分別為60.65%和82.54%,明顯高于C+G含量（39.35%和17.46%）。在Cytb和D-Loop序列中分別檢測到了76和75個簡約信息位點,55和78個單倍型。Cytb和D-Loop單倍型多態(tài)性分別為0.969和0.995,核苷酸多態(tài)性分別為0.033和0.036,群體內(nèi)遺傳距離分別為0.004～0.022和0.005～0.017,群體間遺傳距離分別為0.007～0.068和0.012～0.075。分子方差分析顯示,群體間變異是變異的主要來源,占總變異的70.01%和74.39%。單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹顯示,北海和湛江群體聚為一支,其他3個群體聚為另外一支,同一單系間又有不同程度的分化。種群歷史動態(tài)顯示種群相對穩(wěn)定,近期未曾經(jīng)歷過瓶頸效應(yīng)和明顯擴張。綜... 

【文章來源】：水產(chǎn)科學(xué). 2020,39(04)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：8 頁

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗材料
    1.2 基因組DNA的提取
    1.3 PCR擴增
    1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結(jié) 果
    2.1 堿基組成
    2.2 遺傳多樣性和遺傳結(jié)構(gòu)
    2.3 單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹
    2.4 種群歷史動態(tài)
3 討 論
    3.1 序列堿基組成分析
    3.2 群體遺傳多樣性與遺傳分化分析


【參考文獻】：
期刊論文
[1]5種類型鯉魚線粒體DNA D-loop及鄰近區(qū)段的遺傳多樣性分析[J]. 白云,王妍,胡瑩,張興華,金萬昆,高永平,楊建新,董仕.  水產(chǎn)科學(xué). 2019(04)
[2]新疆塔什庫爾干牦牛mtDNA Cytb基因和D-Loop區(qū)遺傳多樣性及系統(tǒng)進化分析[J]. 胡丹,鐘金城,柴志欣.  家畜生態(tài)學(xué)報. 2018(11)
[3]大鱗副泥鰍群體線粒體DNA D-loop序列遺傳變異分析[J]. 白曉慧,楊華,孟一耕,王娜,姜巨峰,吳會民,馮守明.  水產(chǎn)科學(xué). 2018(05)
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[5]基于線粒體DNA控制區(qū)序列的6個凡納濱對蝦（Litopenaeus vannamei）養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性分析[J]. 劉紅,張海強,蔡生力,戴習(xí)林.  漁業(yè)科學(xué)進展. 2016(01)
[6]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列對南中國海不同海域波紋唇魚群體遺傳多樣性的研究[J]. 胡靜,侯新遠,尹紹武,祝斐,賈一何,王小軍.  水生生物學(xué)報. 2014(06)
[7]不同地理群體日本囊對蝦遺傳多樣性微衛(wèi)星DNA分析[J]. 孔沛球,申玉春,劉堃.  水產(chǎn)科學(xué). 2011(07)
[8]三個野生群體日本囊對蝦遺傳多樣性的SSR分析[J]. 郭慧,申玉春.  生物技術(shù)通報. 2011(03)
[9]南海海區(qū)鯔魚（Mugil cephalus）COⅠ基因序列的遺傳多樣性分析[J]. 孫鵬,彭士明,尹飛,施兆鴻.  海洋與湖沼. 2011(01)
[10]基于線粒體Cytb基因探討我國日本囊對蝦4個地理群體的遺傳結(jié)構(gòu)及種群分化[J]. 曾凡榮,王軍,周孔霖,游欣欣,毛勇.  廈門大學(xué)學(xué)報(自然科學(xué)版). 2010(05)



本文編號：3632491