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嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉cDNA文庫(kù)構(gòu)建及CCL20分析和表達(dá)研究

發(fā)布時(shí)間:2022-02-10 12:38
  首先在同一濕度不同溫度下對(duì)同一規(guī)格的中華鱉卵進(jìn)行了孵化,研究了其胚胎發(fā)育和初生幼體的形態(tài)特征,以及活動(dòng)能力的影響。然后以致病性嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染的中華鱉(Trionyx sinensis)心肝、脾、腎組織為材料,應(yīng)用SMART (switching mechanism at 5’end of RNA transcript)技術(shù),構(gòu)建了中華鱉全長(zhǎng)的cDNA文庫(kù)。首先用SMARTTM PCR cDNA systhesis kit合成全長(zhǎng)的雙鏈cDNA,通過瓊脂糖凝膠分級(jí)分離技術(shù)切除小片段的cDNA,將大于500bp的cDNA連接到pGEM-T載體中,電轉(zhuǎn)化到JM109感受態(tài)細(xì)胞中。在構(gòu)建好的文庫(kù)中,經(jīng)測(cè)定,文庫(kù)約含有4.3×105個(gè)重組子,重組效率92%,插入片段多在0.5-2kb之間。對(duì)庫(kù)中長(zhǎng)度大于1000bp的164個(gè)基因進(jìn)行了測(cè)序,結(jié)果顯示39個(gè)序列在中華鱉中首次發(fā)現(xiàn),測(cè)序鑒定的基因包括免疫基因11個(gè);信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因6個(gè):催化類基因15個(gè);轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因3個(gè);結(jié)構(gòu)基因7個(gè);未知基因9個(gè)。本論文構(gòu)建成的嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉SMART全長(zhǎng)cD... 

【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省211工程院校教育部直屬院校

【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 引言
    2 中華鱉養(yǎng)殖現(xiàn)狀
    3 中華鱉病原研究現(xiàn)狀
        3.1 傳染性病
            3.1.1 細(xì)菌病
            3.1.2 病毒病
            3.1.3 真菌病
            3.1.4 寄生蟲病
            3.1.5 支原體病和霉形體病
        3.2 非傳染性病
        3.3 診斷
        3.4 預(yù)防
            3.4.1 環(huán)境
            3.4.2 機(jī)體
            3.4.3 病原
    4 爬行動(dòng)物免疫的研究進(jìn)展
        4.1 爬行動(dòng)物的淋巴組織
        4.2 爬行動(dòng)物的天然免疫
        4.3 爬行動(dòng)物的獲得性免疫
        4.4 影響爬行動(dòng)物免疫應(yīng)答的因素
    5 嗜水氣單胞菌
    6 CCL20研究進(jìn)展
        6.1 CCL20的由來
        6.2 趨化因子的分類和CCL20的結(jié)構(gòu)
        6.3 CCL20的功能
        6.4 展望
    7 技術(shù)路線
        7.1 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉cDNA文庫(kù)構(gòu)建
        7.2 CCL20的部分序列克隆和驗(yàn)證
        7.3 CCL20 mRNA組織表達(dá)分析(A)和應(yīng)激實(shí)驗(yàn)(B)
    8 研究目的和意義
第二章 溫度對(duì)中華鱉胚胎發(fā)育和初生幼體形態(tài)特征及活動(dòng)能力的影響
    1 材料
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 孵化
        2.2 指標(biāo)測(cè)定
        2.3 數(shù)據(jù)處理
    3 結(jié)果與分析
        3.1 溫度對(duì)胚胎發(fā)育和孵化成活率的影響
        3.2 孵化溫度對(duì)孵出稚鱉形態(tài)特征的影響
        3.3 溫度對(duì)新生幼體運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)的影響
    4 討論
        4.1 孵化溫度對(duì)鱉卵孵化率的影響
        4.2 溫度對(duì)新生體大小及運(yùn)動(dòng)能力的影響
第三章 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉SMART cDNA文庫(kù)構(gòu)建及相關(guān)基因的鑒定
    1 材料
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 細(xì)菌復(fù)壯及人工感染
        2.2 總RNA的提取
        2.3 單、雙鏈cDNA的合成
        2.4 cDNA的連接
        2.5 連接產(chǎn)物電轉(zhuǎn)化
        2.6 cDNA文庫(kù)的容量和重組率測(cè)定
        2.7 DNA測(cè)序和序列分析
    3 結(jié)果與分析
        3.1 中華鱉總RNA的質(zhì)量檢測(cè)
        3.2 cDNA的合成
        3.3 cDNA文庫(kù)的庫(kù)容及重組率
        3.4 插入片段長(zhǎng)度分析
        3.5 測(cè)序結(jié)果和分析
    4 討論
第四章 中華鱉CCL20序列的特征分析
    1 材料與試劑
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
        1.2 試劑
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 cDNA的ORF區(qū)序列驗(yàn)證
        2.2 cDNA的ORF區(qū)序列分析
    3 結(jié)果與分析
        3.1 CCL20的cDNA的ORF區(qū)序列分析
        3.2 CCL20結(jié)構(gòu)分析
    4 討論
第五章 中華鱉CCL20基因組織表達(dá)分析
    1 材料與試劑
        1.1 材料
        1.2 主要試劑
    2 實(shí)驗(yàn)方法
        2.1 RNA提取及cDNA的合成
        2.2 CCL20基因組織表達(dá)分析
        2.3 CCL20基因在嗜水氣單胞菌刺激下的表達(dá)特征分析
        2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
    3 結(jié)果
        3.1 目的基因和內(nèi)參基因的擴(kuò)增曲線
        3.2 目的基因和內(nèi)參基因的溶解曲線
        3.3 正常組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
        3.4 嗜水氣單胞菌刺激組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
    4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α基因的序列特征與組織表達(dá)[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙密,劉陽(yáng).  華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[2]尋常性銀屑病患者血清CCL20及其受體CCR6水平的變化及阿維A的干預(yù)作用[J]. 隆嵐,李振,錢振云,譚飛.  中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2013(06)
[3]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α重組表達(dá)及抗菌活性分析[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙建,洪孝友.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(04)
[4]趨化因子受體CCR6及其配體CCL20的表達(dá)與結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移關(guān)系的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 蔡昕怡,楊之斌,李云峰.  中國(guó)癌癥雜志. 2012(07)
[5]嗜水氣單胞菌內(nèi)源性感染菌株的分離與藥敏分析[J]. 陳蘇芳,王鳳平,趙靜.  抗感染藥學(xué). 2012(02)
[6]江西省中華鱉種質(zhì)狀況及養(yǎng)殖方式調(diào)查[J]. 張世水,胡火庚,王軍花,盧中進(jìn),盛軍慶,洪一江.  南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(理科版). 2012(01)
[7]CCR6-CCL20對(duì)食管鱗癌患者體內(nèi)Th17細(xì)胞分布的影響[J]. 蔣日月,陳德玉,毛朝明,焦志軍.  山東醫(yī)藥. 2012(01)
[8]黃喉擬水龜轉(zhuǎn)鐵蛋白基因的克隆以及表達(dá)特征分析[J]. 高明英,朱新平,趙密,史燕,趙建.  水生生物學(xué)報(bào). 2011(04)
[9]浦東新區(qū)腹瀉樣本中氣單胞菌的分離鑒定及耐藥性分析[J]. 王聞卿,趙冰,詹銘.  中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(06)
[10]CCL20及DCs在慢性阻塞性肺疾病患者誘導(dǎo)痰中的變化及意義[J]. 符丹丹,歐陽(yáng)瑤,薛令合.  貴州醫(yī)藥. 2011(05)

博士論文
[1]中華絨螯蟹精巢組織cDNA文庫(kù)構(gòu)建和Dmcl基因的克隆與序列分析[D]. 張偉.華東師范大學(xué) 2012
[2]中華鱉部分免疫相關(guān)基因克隆及其功能研究[D]. 李肖梁.浙江大學(xué) 2012

碩士論文
[1]血清CC亞族趨化因子配體20與2型糖尿病的相關(guān)性[D]. 徐文超.蘇州大學(xué) 2012



本文編號(hào):3618906

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