嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉cDNA文庫(kù)構(gòu)建及CCL20分析和表達(dá)研究
發(fā)布時(shí)間:2022-02-10 12:38
首先在同一濕度不同溫度下對(duì)同一規(guī)格的中華鱉卵進(jìn)行了孵化,研究了其胚胎發(fā)育和初生幼體的形態(tài)特征,以及活動(dòng)能力的影響。然后以致病性嗜水氣單胞菌(Aeromonas hydrophila)人工感染的中華鱉(Trionyx sinensis)心肝、脾、腎組織為材料,應(yīng)用SMART (switching mechanism at 5’end of RNA transcript)技術(shù),構(gòu)建了中華鱉全長(zhǎng)的cDNA文庫(kù)。首先用SMARTTM PCR cDNA systhesis kit合成全長(zhǎng)的雙鏈cDNA,通過瓊脂糖凝膠分級(jí)分離技術(shù)切除小片段的cDNA,將大于500bp的cDNA連接到pGEM-T載體中,電轉(zhuǎn)化到JM109感受態(tài)細(xì)胞中。在構(gòu)建好的文庫(kù)中,經(jīng)測(cè)定,文庫(kù)約含有4.3×105個(gè)重組子,重組效率92%,插入片段多在0.5-2kb之間。對(duì)庫(kù)中長(zhǎng)度大于1000bp的164個(gè)基因進(jìn)行了測(cè)序,結(jié)果顯示39個(gè)序列在中華鱉中首次發(fā)現(xiàn),測(cè)序鑒定的基因包括免疫基因11個(gè);信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)基因6個(gè):催化類基因15個(gè);轉(zhuǎn)運(yùn)相關(guān)基因3個(gè);結(jié)構(gòu)基因7個(gè);未知基因9個(gè)。本論文構(gòu)建成的嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉SMART全長(zhǎng)cD...
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 引言
2 中華鱉養(yǎng)殖現(xiàn)狀
3 中華鱉病原研究現(xiàn)狀
3.1 傳染性病
3.1.1 細(xì)菌病
3.1.2 病毒病
3.1.3 真菌病
3.1.4 寄生蟲病
3.1.5 支原體病和霉形體病
3.2 非傳染性病
3.3 診斷
3.4 預(yù)防
3.4.1 環(huán)境
3.4.2 機(jī)體
3.4.3 病原
4 爬行動(dòng)物免疫的研究進(jìn)展
4.1 爬行動(dòng)物的淋巴組織
4.2 爬行動(dòng)物的天然免疫
4.3 爬行動(dòng)物的獲得性免疫
4.4 影響爬行動(dòng)物免疫應(yīng)答的因素
5 嗜水氣單胞菌
6 CCL20研究進(jìn)展
6.1 CCL20的由來
6.2 趨化因子的分類和CCL20的結(jié)構(gòu)
6.3 CCL20的功能
6.4 展望
7 技術(shù)路線
7.1 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉cDNA文庫(kù)構(gòu)建
7.2 CCL20的部分序列克隆和驗(yàn)證
7.3 CCL20 mRNA組織表達(dá)分析(A)和應(yīng)激實(shí)驗(yàn)(B)
8 研究目的和意義
第二章 溫度對(duì)中華鱉胚胎發(fā)育和初生幼體形態(tài)特征及活動(dòng)能力的影響
1 材料
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 孵化
2.2 指標(biāo)測(cè)定
2.3 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 溫度對(duì)胚胎發(fā)育和孵化成活率的影響
3.2 孵化溫度對(duì)孵出稚鱉形態(tài)特征的影響
3.3 溫度對(duì)新生幼體運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)的影響
4 討論
4.1 孵化溫度對(duì)鱉卵孵化率的影響
4.2 溫度對(duì)新生體大小及運(yùn)動(dòng)能力的影響
第三章 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉SMART cDNA文庫(kù)構(gòu)建及相關(guān)基因的鑒定
1 材料
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)菌復(fù)壯及人工感染
2.2 總RNA的提取
2.3 單、雙鏈cDNA的合成
2.4 cDNA的連接
2.5 連接產(chǎn)物電轉(zhuǎn)化
2.6 cDNA文庫(kù)的容量和重組率測(cè)定
2.7 DNA測(cè)序和序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 中華鱉總RNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2 cDNA的合成
3.3 cDNA文庫(kù)的庫(kù)容及重組率
3.4 插入片段長(zhǎng)度分析
3.5 測(cè)序結(jié)果和分析
4 討論
第四章 中華鱉CCL20序列的特征分析
1 材料與試劑
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 cDNA的ORF區(qū)序列驗(yàn)證
2.2 cDNA的ORF區(qū)序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 CCL20的cDNA的ORF區(qū)序列分析
3.2 CCL20結(jié)構(gòu)分析
4 討論
第五章 中華鱉CCL20基因組織表達(dá)分析
1 材料與試劑
1.1 材料
1.2 主要試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 RNA提取及cDNA的合成
2.2 CCL20基因組織表達(dá)分析
2.3 CCL20基因在嗜水氣單胞菌刺激下的表達(dá)特征分析
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 目的基因和內(nèi)參基因的擴(kuò)增曲線
3.2 目的基因和內(nèi)參基因的溶解曲線
3.3 正常組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
3.4 嗜水氣單胞菌刺激組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α基因的序列特征與組織表達(dá)[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙密,劉陽(yáng). 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[2]尋常性銀屑病患者血清CCL20及其受體CCR6水平的變化及阿維A的干預(yù)作用[J]. 隆嵐,李振,錢振云,譚飛. 中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2013(06)
[3]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α重組表達(dá)及抗菌活性分析[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙建,洪孝友. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(04)
[4]趨化因子受體CCR6及其配體CCL20的表達(dá)與結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移關(guān)系的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 蔡昕怡,楊之斌,李云峰. 中國(guó)癌癥雜志. 2012(07)
[5]嗜水氣單胞菌內(nèi)源性感染菌株的分離與藥敏分析[J]. 陳蘇芳,王鳳平,趙靜. 抗感染藥學(xué). 2012(02)
[6]江西省中華鱉種質(zhì)狀況及養(yǎng)殖方式調(diào)查[J]. 張世水,胡火庚,王軍花,盧中進(jìn),盛軍慶,洪一江. 南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(理科版). 2012(01)
[7]CCR6-CCL20對(duì)食管鱗癌患者體內(nèi)Th17細(xì)胞分布的影響[J]. 蔣日月,陳德玉,毛朝明,焦志軍. 山東醫(yī)藥. 2012(01)
[8]黃喉擬水龜轉(zhuǎn)鐵蛋白基因的克隆以及表達(dá)特征分析[J]. 高明英,朱新平,趙密,史燕,趙建. 水生生物學(xué)報(bào). 2011(04)
[9]浦東新區(qū)腹瀉樣本中氣單胞菌的分離鑒定及耐藥性分析[J]. 王聞卿,趙冰,詹銘. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(06)
[10]CCL20及DCs在慢性阻塞性肺疾病患者誘導(dǎo)痰中的變化及意義[J]. 符丹丹,歐陽(yáng)瑤,薛令合. 貴州醫(yī)藥. 2011(05)
博士論文
[1]中華絨螯蟹精巢組織cDNA文庫(kù)構(gòu)建和Dmcl基因的克隆與序列分析[D]. 張偉.華東師范大學(xué) 2012
[2]中華鱉部分免疫相關(guān)基因克隆及其功能研究[D]. 李肖梁.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]血清CC亞族趨化因子配體20與2型糖尿病的相關(guān)性[D]. 徐文超.蘇州大學(xué) 2012
本文編號(hào):3618906
【文章來源】:南京農(nóng)業(yè)大學(xué)江蘇省211工程院校教育部直屬院校
【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 引言
2 中華鱉養(yǎng)殖現(xiàn)狀
3 中華鱉病原研究現(xiàn)狀
3.1 傳染性病
3.1.1 細(xì)菌病
3.1.2 病毒病
3.1.3 真菌病
3.1.4 寄生蟲病
3.1.5 支原體病和霉形體病
3.2 非傳染性病
3.3 診斷
3.4 預(yù)防
3.4.1 環(huán)境
3.4.2 機(jī)體
3.4.3 病原
4 爬行動(dòng)物免疫的研究進(jìn)展
4.1 爬行動(dòng)物的淋巴組織
4.2 爬行動(dòng)物的天然免疫
4.3 爬行動(dòng)物的獲得性免疫
4.4 影響爬行動(dòng)物免疫應(yīng)答的因素
5 嗜水氣單胞菌
6 CCL20研究進(jìn)展
6.1 CCL20的由來
6.2 趨化因子的分類和CCL20的結(jié)構(gòu)
6.3 CCL20的功能
6.4 展望
7 技術(shù)路線
7.1 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉cDNA文庫(kù)構(gòu)建
7.2 CCL20的部分序列克隆和驗(yàn)證
7.3 CCL20 mRNA組織表達(dá)分析(A)和應(yīng)激實(shí)驗(yàn)(B)
8 研究目的和意義
第二章 溫度對(duì)中華鱉胚胎發(fā)育和初生幼體形態(tài)特征及活動(dòng)能力的影響
1 材料
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 孵化
2.2 指標(biāo)測(cè)定
2.3 數(shù)據(jù)處理
3 結(jié)果與分析
3.1 溫度對(duì)胚胎發(fā)育和孵化成活率的影響
3.2 孵化溫度對(duì)孵出稚鱉形態(tài)特征的影響
3.3 溫度對(duì)新生幼體運(yùn)動(dòng)表現(xiàn)的影響
4 討論
4.1 孵化溫度對(duì)鱉卵孵化率的影響
4.2 溫度對(duì)新生體大小及運(yùn)動(dòng)能力的影響
第三章 嗜水氣單胞菌誘導(dǎo)的中華鱉SMART cDNA文庫(kù)構(gòu)建及相關(guān)基因的鑒定
1 材料
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 細(xì)菌復(fù)壯及人工感染
2.2 總RNA的提取
2.3 單、雙鏈cDNA的合成
2.4 cDNA的連接
2.5 連接產(chǎn)物電轉(zhuǎn)化
2.6 cDNA文庫(kù)的容量和重組率測(cè)定
2.7 DNA測(cè)序和序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 中華鱉總RNA的質(zhì)量檢測(cè)
3.2 cDNA的合成
3.3 cDNA文庫(kù)的庫(kù)容及重組率
3.4 插入片段長(zhǎng)度分析
3.5 測(cè)序結(jié)果和分析
4 討論
第四章 中華鱉CCL20序列的特征分析
1 材料與試劑
1.1 實(shí)驗(yàn)材料
1.2 試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 cDNA的ORF區(qū)序列驗(yàn)證
2.2 cDNA的ORF區(qū)序列分析
3 結(jié)果與分析
3.1 CCL20的cDNA的ORF區(qū)序列分析
3.2 CCL20結(jié)構(gòu)分析
4 討論
第五章 中華鱉CCL20基因組織表達(dá)分析
1 材料與試劑
1.1 材料
1.2 主要試劑
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 RNA提取及cDNA的合成
2.2 CCL20基因組織表達(dá)分析
2.3 CCL20基因在嗜水氣單胞菌刺激下的表達(dá)特征分析
2.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
3 結(jié)果
3.1 目的基因和內(nèi)參基因的擴(kuò)增曲線
3.2 目的基因和內(nèi)參基因的溶解曲線
3.3 正常組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
3.4 嗜水氣單胞菌刺激組中華鱉CCL20基因組織表達(dá)特征
4 討論
全文總結(jié)
參考文獻(xiàn)
致謝
學(xué)術(shù)論文發(fā)表情況
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α基因的序列特征與組織表達(dá)[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙密,劉陽(yáng). 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2013(05)
[2]尋常性銀屑病患者血清CCL20及其受體CCR6水平的變化及阿維A的干預(yù)作用[J]. 隆嵐,李振,錢振云,譚飛. 中國(guó)皮膚性病學(xué)雜志. 2013(06)
[3]黃喉擬水龜巨噬細(xì)胞炎癥蛋白-3α重組表達(dá)及抗菌活性分析[J]. 龍建杰,朱新平,史燕,趙建,洪孝友. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(04)
[4]趨化因子受體CCR6及其配體CCL20的表達(dá)與結(jié)直腸癌肝轉(zhuǎn)移關(guān)系的實(shí)驗(yàn)研究[J]. 蔡昕怡,楊之斌,李云峰. 中國(guó)癌癥雜志. 2012(07)
[5]嗜水氣單胞菌內(nèi)源性感染菌株的分離與藥敏分析[J]. 陳蘇芳,王鳳平,趙靜. 抗感染藥學(xué). 2012(02)
[6]江西省中華鱉種質(zhì)狀況及養(yǎng)殖方式調(diào)查[J]. 張世水,胡火庚,王軍花,盧中進(jìn),盛軍慶,洪一江. 南昌大學(xué)學(xué)報(bào)(理科版). 2012(01)
[7]CCR6-CCL20對(duì)食管鱗癌患者體內(nèi)Th17細(xì)胞分布的影響[J]. 蔣日月,陳德玉,毛朝明,焦志軍. 山東醫(yī)藥. 2012(01)
[8]黃喉擬水龜轉(zhuǎn)鐵蛋白基因的克隆以及表達(dá)特征分析[J]. 高明英,朱新平,趙密,史燕,趙建. 水生生物學(xué)報(bào). 2011(04)
[9]浦東新區(qū)腹瀉樣本中氣單胞菌的分離鑒定及耐藥性分析[J]. 王聞卿,趙冰,詹銘. 中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志. 2011(06)
[10]CCL20及DCs在慢性阻塞性肺疾病患者誘導(dǎo)痰中的變化及意義[J]. 符丹丹,歐陽(yáng)瑤,薛令合. 貴州醫(yī)藥. 2011(05)
博士論文
[1]中華絨螯蟹精巢組織cDNA文庫(kù)構(gòu)建和Dmcl基因的克隆與序列分析[D]. 張偉.華東師范大學(xué) 2012
[2]中華鱉部分免疫相關(guān)基因克隆及其功能研究[D]. 李肖梁.浙江大學(xué) 2012
碩士論文
[1]血清CC亞族趨化因子配體20與2型糖尿病的相關(guān)性[D]. 徐文超.蘇州大學(xué) 2012
本文編號(hào):3618906
本文鏈接:http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3618906.html
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