本研究旨在為克氏原螯蝦（Procambarus clarkii）微生態(tài)制劑研制和病害防治提供試驗(yàn)依據(jù),利用基于Ion S5^TM XL技術(shù)測(cè)序平臺(tái)對(duì)克氏原螯蝦腸道、養(yǎng)殖水體、池塘底泥及飼料進(jìn)行基因序列測(cè)序,分析腸道與外界養(yǎng)殖環(huán)境之間的相關(guān)性。試驗(yàn)結(jié)果表明:克氏原螯蝦腸道菌群多樣性在較大程度上受到外界環(huán)境細(xì)菌的影響,特別是底泥中的細(xì)菌,這可能與克氏原螯蝦有掘洞的生活習(xí)性有關(guān)。但同時(shí),試驗(yàn)檢測(cè)表明克氏原螯蝦腸道中有31.42%的未分類優(yōu)勢(shì)細(xì)菌,在水體、底泥及飼料中所占比例都較小,這說(shuō)明克氏原螯蝦腸道菌群盡管受到養(yǎng)殖環(huán)境的影響,但同時(shí)也有一定的保守性,這可能是受腸道原著細(xì)菌影響。 

【文章來(lái)源】：青島農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,37(02)

【文章頁(yè)數(shù)】：6 頁(yè)

【部分圖文】：

測(cè)序結(jié)果的稀釋性曲線

根據(jù)OTUs聚類分析結(jié)果，構(gòu)建韋恩圖（圖2）。克氏原螯蝦腸道菌群中分別有77.9%、45.6%、49.6%的OTUs在底泥、餌料、水體中出現(xiàn)，只有7.1%的腸道菌群與環(huán)境中的菌群無(wú)關(guān)。據(jù)此分析，克氏原螯蝦腸道菌群多樣性在較大程度上受到外界環(huán)境細(xì)菌的影響，特別是底泥中的細(xì)菌，因此，可以從克氏原螯蝦養(yǎng)殖環(huán)境中篩選具備抑制致病菌群體感應(yīng)等功能的菌株，作為潛在益生菌株。2.4 基于門分類水平上的物種注釋及分析

在門分類水平上，克氏原螯蝦腸道主要細(xì)菌為厚壁菌門（Firmicutes）、無(wú)壁菌門（Tenericutes）、變形菌門（Proteobacteria），以上三門微生物占菌群總量的56.71%；水體中主要細(xì)菌為擬桿菌門（Bacteroidetes）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actinobacteria），占菌群總量的88.12%；底泥中主要細(xì)菌與養(yǎng)殖水體中相似，主要為擬桿菌門（Bacteroidetes）、變形菌門（Proteobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes），占到菌群總量的72.35%；而飼料中主要細(xì)菌為生氧光細(xì)菌門（Oxyphotobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）、變形菌門（Proteobacteria），占到96.48%。厚壁菌門細(xì)菌是腸道樣品中最大優(yōu)勢(shì)種類，同時(shí)也是底泥和飼料樣品中第三、第二的優(yōu)勢(shì)種類；腸道中的豐度第四的變形菌門細(xì)菌，同時(shí)也是水體及底泥中豐度排第二的優(yōu)勢(shì)種類。說(shuō)明克氏原螯蝦腸道菌群結(jié)構(gòu)與養(yǎng)殖環(huán)境有密切聯(lián)系。但另一方面，檢測(cè)到腸道中有31.42%的未分類細(xì)菌，在水體、底泥及飼料中所占比例都較小，這說(shuō)明克氏原螯蝦腸道菌群盡管受到養(yǎng)殖環(huán)境的影響，但同時(shí)也有一定的保守性，說(shuō)明其腸道結(jié)構(gòu)受原著細(xì)菌影響。據(jù)此分析，可以針對(duì)這些原著細(xì)菌，從健康的克氏原螯蝦腸道中分離篩選潛在益生菌株。2.5 樣本菌群組成分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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本文編號(hào)：3599548