凡納濱對(duì)蝦腸道菌群分析及其利用
發(fā)布時(shí)間:2022-01-20 13:15
近年來,水環(huán)境惡化和種質(zhì)退化導(dǎo)致凡納濱對(duì)蝦病害頻發(fā)、大量抗生素引起的抗藥性及藥物殘留等問題,給養(yǎng)殖戶造成巨大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響了對(duì)蝦養(yǎng)殖業(yè)的健康穩(wěn)定發(fā)展。為了解決養(yǎng)殖病害和食品安全等諸多矛盾,尋找新的綠色環(huán)保的抗生素替代品成為目前研究的熱點(diǎn)。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù),分析對(duì)蝦腸道和養(yǎng)殖水體中主要菌群組成,篩選優(yōu)勢(shì)微生物制備益生菌,飼養(yǎng)凡納濱對(duì)蝦,研究其對(duì)凡納濱對(duì)蝦免疫功能及腸道菌群的影響,主要結(jié)果與結(jié)論如下:1.采用高通量測(cè)序技術(shù),分析了凡納濱對(duì)蝦腸道和養(yǎng)殖水體的菌群組成,確定對(duì)蝦腸道和養(yǎng)殖水體的主要菌群是變形菌門(Proteobacteria)、擬桿菌門(Bacteroidetes)、放線菌門(Actinobacteria)、后壁菌門(Firmicutes),次要菌群為衣原體門(Chlamydiae)、浮霉菌門(Planctomycetes)。各類群所占的比例不同,凡納濱對(duì)蝦腸道中各菌群所占比例:變形菌門42.44%、擬桿菌門46.57%、放線菌門2.21%、厚壁菌門4.57%、衣原體門0.23%、浮霉菌門0.03%;養(yǎng)殖水體各菌群所占比例:變形菌門57.74%、擬桿菌門18.27...
【文章來源】:天津科技大學(xué)天津市
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 微生物和有益微生物
1.1.1 微生物概念
1.1.2 微生物多樣性
1.1.3 有益微生物
1.2 變性梯度凝膠電泳(DGGE)
1.2.1 變性梯度凝膠電泳原理
1.2.2 變性梯度凝膠電泳特點(diǎn)
1.2.3 變性梯度凝膠電泳的應(yīng)用
1.3 高通量測(cè)序
1.3.1 高通量測(cè)序發(fā)展歷史
1.3.2 Illumina MiSeq測(cè)序原理
1.3.3 高通量測(cè)序相關(guān)分析
1.3.4 高通量測(cè)序的優(yōu)缺點(diǎn)及發(fā)展前景
1.3.5 高通量測(cè)序的應(yīng)用
1.4 微生態(tài)制劑
1.4.1 微生態(tài)制劑定義
1.4.2 微生態(tài)制劑的種類和作用機(jī)理
1.4.3 微生態(tài)制劑的應(yīng)用
1.4.4 微生態(tài)制劑的前景展望與當(dāng)前存在的問題
1.5 研究目的意義和技術(shù)路線
1.5.1 目的意義
1.5.2 技術(shù)路線
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物選取
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 高通量測(cè)序與菌群多樣性分析
2.2.2 微生態(tài)制劑在對(duì)蝦養(yǎng)殖中的應(yīng)用
3. 結(jié)果與討論
3.1 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群多樣性分析
3.1.1 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群DNA提取
3.1.2 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群DNA的PCR擴(kuò)增
3.1.3 凡納濱對(duì)蝦腸道高通量測(cè)序結(jié)果
3.2 養(yǎng)殖水體總菌群多樣性分析
3.2.1 養(yǎng)殖水體總菌群DNA提取
3.2.2 養(yǎng)殖水體總菌群DNA的PCR擴(kuò)增
3.2.3 養(yǎng)殖水體高通量測(cè)序結(jié)果
3.3 對(duì)蝦腸道和養(yǎng)殖水體菌群間的差異性結(jié)果
3.4 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦的影響
3.4.1 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)情況的結(jié)果
3.4.2 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦抗氧化系統(tǒng)的結(jié)果
3.4.3 微生態(tài)制劑飼養(yǎng)后DGGE檢測(cè)結(jié)果
4. 結(jié)論
5. 展望
6. 參考文獻(xiàn)
7. 論文發(fā)表情況
8. 致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]DGGE技術(shù)對(duì)南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖水體中微生物多樣性的研究[J]. 王亭芳,金風(fēng)杰,馬士禹,常忠義,趙云龍,高紅亮. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(10)
[2]復(fù)合微生態(tài)制劑AQ在南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖中應(yīng)用效果[J]. 吉遠(yuǎn)軍,李家勝,陸峰,馮俊. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2012(05)
[3]微生態(tài)制劑研究進(jìn)展[J]. 于蓮,馬麗娜,杜妍,劉思佳,平洋,胡月,魏巍,楊景云. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2012(01)
[4]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[5]復(fù)合池塘循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)微生物群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 姚延丹,李谷,陶玲,李曉莉,張世羊,趙巧玲,林玉良. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(02)
[6]中國水產(chǎn)養(yǎng)殖水體凈化技術(shù)的發(fā)展概況[J]. 王瑋,陳軍,劉晃,何雅萍. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]微生態(tài)制劑的研制[J]. 張祥云,馬洪娟. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2009(03)
[8]基因芯片與高通量DNA測(cè)序技術(shù)前景分析[J]. 滕曉坤,肖華勝. 中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(10)
[9]水霉拮抗菌的篩選及其拮抗作用的初步研究[J]. 張書俊,楊先樂,李聃,李怡,高鵬. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(03)
[10]應(yīng)用PCR-DGGE技術(shù)解析MBR中微生物群落多樣性[J]. 孫寶盛,張斌,吳卿,金敏. 天津大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
博士論文
[1]草莓連作根腐病發(fā)生機(jī)制與微生物及化學(xué)修復(fù)研究[D]. 申光輝.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]養(yǎng)殖對(duì)蝦腸道微生物區(qū)系的特征與功能[D]. 李玉宏.上海海洋大學(xué) 2013
[2]微生物對(duì)養(yǎng)殖水體水質(zhì)調(diào)控作用的研究[D]. 王京偉.山西大學(xué) 2007
[3]微生態(tài)制劑對(duì)南美白對(duì)蝦生長(zhǎng)和非特異性免疫因子影響的研究[D]. 隋大鵬.中國海洋大學(xué) 2003
本文編號(hào):3598891
【文章來源】:天津科技大學(xué)天津市
【文章頁數(shù)】:56 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
1 前言
1.1 微生物和有益微生物
1.1.1 微生物概念
1.1.2 微生物多樣性
1.1.3 有益微生物
1.2 變性梯度凝膠電泳(DGGE)
1.2.1 變性梯度凝膠電泳原理
1.2.2 變性梯度凝膠電泳特點(diǎn)
1.2.3 變性梯度凝膠電泳的應(yīng)用
1.3 高通量測(cè)序
1.3.1 高通量測(cè)序發(fā)展歷史
1.3.2 Illumina MiSeq測(cè)序原理
1.3.3 高通量測(cè)序相關(guān)分析
1.3.4 高通量測(cè)序的優(yōu)缺點(diǎn)及發(fā)展前景
1.3.5 高通量測(cè)序的應(yīng)用
1.4 微生態(tài)制劑
1.4.1 微生態(tài)制劑定義
1.4.2 微生態(tài)制劑的種類和作用機(jī)理
1.4.3 微生態(tài)制劑的應(yīng)用
1.4.4 微生態(tài)制劑的前景展望與當(dāng)前存在的問題
1.5 研究目的意義和技術(shù)路線
1.5.1 目的意義
1.5.2 技術(shù)路線
2. 材料與方法
2.1 實(shí)驗(yàn)材料
2.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物選取
2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器
2.2 實(shí)驗(yàn)方法
2.2.1 高通量測(cè)序與菌群多樣性分析
2.2.2 微生態(tài)制劑在對(duì)蝦養(yǎng)殖中的應(yīng)用
3. 結(jié)果與討論
3.1 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群多樣性分析
3.1.1 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群DNA提取
3.1.2 凡納濱對(duì)蝦腸道總菌群DNA的PCR擴(kuò)增
3.1.3 凡納濱對(duì)蝦腸道高通量測(cè)序結(jié)果
3.2 養(yǎng)殖水體總菌群多樣性分析
3.2.1 養(yǎng)殖水體總菌群DNA提取
3.2.2 養(yǎng)殖水體總菌群DNA的PCR擴(kuò)增
3.2.3 養(yǎng)殖水體高通量測(cè)序結(jié)果
3.3 對(duì)蝦腸道和養(yǎng)殖水體菌群間的差異性結(jié)果
3.4 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦的影響
3.4.1 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦生長(zhǎng)情況的結(jié)果
3.4.2 微生態(tài)制劑對(duì)凡納濱對(duì)蝦抗氧化系統(tǒng)的結(jié)果
3.4.3 微生態(tài)制劑飼養(yǎng)后DGGE檢測(cè)結(jié)果
4. 結(jié)論
5. 展望
6. 參考文獻(xiàn)
7. 論文發(fā)表情況
8. 致謝
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]DGGE技術(shù)對(duì)南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖水體中微生物多樣性的研究[J]. 王亭芳,金風(fēng)杰,馬士禹,常忠義,趙云龍,高紅亮. 生物技術(shù)通報(bào). 2012(10)
[2]復(fù)合微生態(tài)制劑AQ在南美白對(duì)蝦養(yǎng)殖中應(yīng)用效果[J]. 吉遠(yuǎn)軍,李家勝,陸峰,馮俊. 水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2012(05)
[3]微生態(tài)制劑研究進(jìn)展[J]. 于蓮,馬麗娜,杜妍,劉思佳,平洋,胡月,魏巍,楊景云. 中國微生態(tài)學(xué)雜志. 2012(01)
[4]高通量測(cè)序技術(shù)及其應(yīng)用[J]. 王興春,楊致榮,王敏,李瑋,李生才. 中國生物工程雜志. 2012(01)
[5]復(fù)合池塘循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)微生物群落結(jié)構(gòu)分析[J]. 姚延丹,李谷,陶玲,李曉莉,張世羊,趙巧玲,林玉良. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2011(02)
[6]中國水產(chǎn)養(yǎng)殖水體凈化技術(shù)的發(fā)展概況[J]. 王瑋,陳軍,劉晃,何雅萍. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(01)
[7]微生態(tài)制劑的研制[J]. 張祥云,馬洪娟. 中國醫(yī)藥導(dǎo)報(bào). 2009(03)
[8]基因芯片與高通量DNA測(cè)序技術(shù)前景分析[J]. 滕曉坤,肖華勝. 中國科學(xué)(C輯:生命科學(xué)). 2008(10)
[9]水霉拮抗菌的篩選及其拮抗作用的初步研究[J]. 張書俊,楊先樂,李聃,李怡,高鵬. 水生生物學(xué)報(bào). 2008(03)
[10]應(yīng)用PCR-DGGE技術(shù)解析MBR中微生物群落多樣性[J]. 孫寶盛,張斌,吳卿,金敏. 天津大學(xué)學(xué)報(bào). 2008(03)
博士論文
[1]草莓連作根腐病發(fā)生機(jī)制與微生物及化學(xué)修復(fù)研究[D]. 申光輝.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2012
碩士論文
[1]養(yǎng)殖對(duì)蝦腸道微生物區(qū)系的特征與功能[D]. 李玉宏.上海海洋大學(xué) 2013
[2]微生物對(duì)養(yǎng)殖水體水質(zhì)調(diào)控作用的研究[D]. 王京偉.山西大學(xué) 2007
[3]微生態(tài)制劑對(duì)南美白對(duì)蝦生長(zhǎng)和非特異性免疫因子影響的研究[D]. 隋大鵬.中國海洋大學(xué) 2003
本文編號(hào):3598891
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