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基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的溪紅點鮭微衛(wèi)星標(biāo)記篩選及引進群體遺傳結(jié)構(gòu)

發(fā)布時間:2022-01-07 15:33
  為了深入了解引進溪紅點鮭種質(zhì)遺傳結(jié)構(gòu)狀況,本研究利用溪紅點鮭轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)設(shè)計四核苷酸重復(fù)微衛(wèi)星引物1 081對,選擇其中200對進行引物合成,經(jīng)過篩選鑒定共獲得111個特異性好且擴增效率高的微衛(wèi)星標(biāo)記,用其中27個多態(tài)性標(biāo)記比較分析了溪紅點鮭引進群體和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性。結(jié)果顯示,27個微衛(wèi)星位點在2個群體中共檢測到171個等位基因,多態(tài)性信息含量(PIC)為0.426 0~0.877 4,平均為0.673 1,其中23個位點高度多態(tài)(PIC≥0.5)。引進群體和養(yǎng)殖群體的平均等位基因數(shù)(Na)分別為5.555 6和4.444 4;平均有效等位基因數(shù)(Ne)分別為3.914 5和3.108 2;平均觀測雜合度(Ho)分別為0.356 2和0.265 0;平均期望雜合度(He)分別為0.700 2和0.621 0;平均PIC分別為0.640 9和0.555 5。引進群體和養(yǎng)殖群體的遺傳參數(shù)t檢驗結(jié)果顯示,養(yǎng)殖群體的5項遺傳多樣性參數(shù)均顯著或極顯著低于引進群體,表明盡管溪紅點鮭養(yǎng)殖群體的PIC仍處于高度多態(tài)水平(PIC≥0.5),但是經(jīng)過多代群體自繁,已經(jīng)出現(xiàn)等位基因嚴(yán)重富集的現(xiàn)象。經(jīng)Bo... 

【文章來源】:水產(chǎn)學(xué)報. 2020,44(10)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:10 頁

【參考文獻】:
期刊論文
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博士論文
[1]鯉生長性狀主效QTL育種潛力評估及其在染色體上的定位[D]. 魯翠云.上海海洋大學(xué) 2014



本文編號:3574801

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