雅魯藏布江大峽谷縫合帶墨脫近溪蟹的群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
發(fā)布時間:2022-01-05 14:57
本研究為明確雅魯藏布江縫合帶下游墨脫近溪蟹(Potamiscus motuoense)的遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu),提取采自西藏林芝墨脫縣5個地理群體合計128個個體的墨脫近溪蟹樣本總DNA,并獲取其16S r RNA、28S rRNA及ITS2 3個基因片段序列。結(jié)果表明,墨脫近溪蟹兩基因聯(lián)合片段共計981 bp,5個地理群體合計128個個體共檢出18個多態(tài)性位點及17種單倍型,總?cè)后w的單倍型多樣性(h)及核苷酸多樣性(π)指數(shù)分別為(0.857±0.014)和(0.002 77±0.000 16),表明墨脫近溪蟹群體遺傳多樣性低。群體間遺傳分化系數(shù)(Fst)為0.490 620.900 93之間,基因流(Nm)值在0.005 500.519 12之間,顯示墨脫近溪蟹5個地理群體間出現(xiàn)明顯的遺傳分化,基因交流匱乏。Mantel檢驗分析表明,群體間的遺傳距離與地理距離之間無顯著相關性;AMOVA分析表明,其遺傳變異主要來自群體間。本研究為研究雅魯藏布江縫合帶下游墨脫近溪蟹的遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu)提供基本數(shù)據(jù)。
【文章來源】:基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:13 頁
【部分圖文】:
Potamiscus motuoense模式標本與采集標本比對
Potamiscus motuoense雄性標本解剖
P.motuoense雌性標本解剖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于COⅠ序列的不同地理種群巖蟲遺傳多樣性研究[J]. 趙歡,張伯序,薛圣倫,王一梟,楊大佐,周一兵. 大連海洋大學學報. 2018(01)
[2]基于線粒體COⅡ基因的中國大豆食心蟲不同地理種群遺傳分化分析[J]. 朱詩禹,徐偉,高宇,崔娟,歐師琪,史樹森. 昆蟲學報. 2017(04)
[3]利用Cytb和16S rRNA序列研究多鱗四指馬鲅和四指馬鲅的種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 徐志進,章霞,柳敏海,傅榮兵,李偉業(yè),油九菊. 大連海洋大學學報. 2015(03)
[4]基于線粒體COI基因序列的大豆食心蟲中國東北地理種群遺傳多樣性分析[J]. 王紅,徐忠新,韓嵐嵐,王克勤,趙奎軍. 昆蟲學報. 2014(09)
[5]雅魯藏布大峽谷景區(qū)生態(tài)旅游環(huán)境容量研究[J]. 王忠斌,楊小林,張敏,范清梅. 林業(yè)調(diào)查規(guī)劃. 2014(03)
[6]基于線粒體DNA標記的阿根廷滑柔魚2個產(chǎn)卵群體遺傳變異分析[J]. 劉連為,陳新軍,許強華,方舟,陸化杰. 海洋漁業(yè). 2014(01)
[7]生物避難所及其識別方法評述[J]. 胡忠俊,張鐿鋰,劉林山,于海彬. 生態(tài)學雜志. 2013(12)
[8]基于線粒體COI基因序列的黃脛小車蝗不同地理種群的遺傳分化及基因流分析[J]. 孫嵬,張柱亭,董輝,錢海濤,石玉,謝麗娜,叢斌. 昆蟲學報. 2013(08)
[9]五種嚙齒類動物mtDNA蛋白編碼基因序列變化的比較[J]. 宋國華,陳朝陽,龐文彪,岳文斌. 中國實驗動物學報. 2013(01)
[10]北部灣擬穴青蟹(Scylla paramamosain)群體遺傳結(jié)構(gòu)及其擴張分析[J]. 宋忠魁,李夢蕓,聶振平,孫奉玉,趙鵬,蘇瓊. 海洋與湖沼. 2012(04)
碩士論文
[1]基于mtDNA Cyt b基因和D-loop區(qū)的祁連山裸鯉遺傳多樣性及分類地位分析[D]. 張久盤.甘肅農(nóng)業(yè)大學 2015
[2]北部灣紅樹林蟹類物種多樣性與遺傳多樣性研究[D]. 楊明柳.廣西大學 2014
[3]中國野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂小亮.暨南大學 2010
[4]雅魯藏布大峽谷地區(qū)地震活動性研究[D]. 邵翠茹.中國地震局地球物理研究所 2009
本文編號:3570558
【文章來源】:基因組學與應用生物學. 2020,39(07)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:13 頁
【部分圖文】:
Potamiscus motuoense模式標本與采集標本比對
Potamiscus motuoense雄性標本解剖
P.motuoense雌性標本解剖
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于COⅠ序列的不同地理種群巖蟲遺傳多樣性研究[J]. 趙歡,張伯序,薛圣倫,王一梟,楊大佐,周一兵. 大連海洋大學學報. 2018(01)
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[3]利用Cytb和16S rRNA序列研究多鱗四指馬鲅和四指馬鲅的種群遺傳結(jié)構(gòu)[J]. 徐志進,章霞,柳敏海,傅榮兵,李偉業(yè),油九菊. 大連海洋大學學報. 2015(03)
[4]基于線粒體COI基因序列的大豆食心蟲中國東北地理種群遺傳多樣性分析[J]. 王紅,徐忠新,韓嵐嵐,王克勤,趙奎軍. 昆蟲學報. 2014(09)
[5]雅魯藏布大峽谷景區(qū)生態(tài)旅游環(huán)境容量研究[J]. 王忠斌,楊小林,張敏,范清梅. 林業(yè)調(diào)查規(guī)劃. 2014(03)
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[8]基于線粒體COI基因序列的黃脛小車蝗不同地理種群的遺傳分化及基因流分析[J]. 孫嵬,張柱亭,董輝,錢海濤,石玉,謝麗娜,叢斌. 昆蟲學報. 2013(08)
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[10]北部灣擬穴青蟹(Scylla paramamosain)群體遺傳結(jié)構(gòu)及其擴張分析[J]. 宋忠魁,李夢蕓,聶振平,孫奉玉,趙鵬,蘇瓊. 海洋與湖沼. 2012(04)
碩士論文
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[2]北部灣紅樹林蟹類物種多樣性與遺傳多樣性研究[D]. 楊明柳.廣西大學 2014
[3]中國野生香魚(Plecoglossus altivelis)遺傳多樣性分析[D]. 樂小亮.暨南大學 2010
[4]雅魯藏布大峽谷地區(qū)地震活動性研究[D]. 邵翠茹.中國地震局地球物理研究所 2009
本文編號:3570558
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