微生物群落在養(yǎng)殖池塘生態(tài)系統(tǒng)中發(fā)揮著重要的作用,與環(huán)境質(zhì)量及養(yǎng)殖動(dòng)物的生長(zhǎng)和疾病暴發(fā)密切相關(guān)。為了考察中國(guó)明對(duì)蝦不同混養(yǎng)模式中的微生態(tài)狀況,本研究基于16S rRNA基因的高通量測(cè)序技術(shù),比較了6種不同中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落的差異。結(jié)果表明,6種混養(yǎng)池塘沉積物的主要微生物均為變形菌門（Proteobacteria）和放線菌門（Actinobacteria）,與褐牙鲆的混養(yǎng),會(huì)導(dǎo)致變形菌門豐度升高,同時(shí)抑制放線菌門的生長(zhǎng)。中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、菲律賓蛤仔混養(yǎng)具有最高的沉積物微生物群落豐富度和多樣性。通過(guò)對(duì)微生物功能進(jìn)行預(yù)測(cè)發(fā)現(xiàn),化能異養(yǎng)和含硫化合物的呼吸是中國(guó)對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落的主要功能。中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、菲律賓蛤仔混養(yǎng)沉積物中部分細(xì)菌的某特異性富集,可以提高沉積物中溶解氧量并促進(jìn)化學(xué)物污染物的降解。綜上所述,中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、菲律賓蛤仔混養(yǎng)模式在6種不同中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘中微生態(tài)狀況最佳。 

【文章來(lái)源】：海洋通報(bào). 2020,39(06)北大核心CSCD

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(a）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落高通量測(cè)序得到的tags和OTUs數(shù)目；（b）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落稀疏曲線；（c）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落不同分類學(xué)水平注釋比例

圖1 (a）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落高通量測(cè)序得到的tags和OTUs數(shù)目；（b）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落稀疏曲線；（c）中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物微生物群落不同分類學(xué)水平注釋比例2.2 不同中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘微生物群落差異

為了全面比較不同中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘微生物群落的差異，本研究在門水平分析了不同混養(yǎng)模式對(duì)于主要微生物物種豐度的影響，結(jié)果見(jiàn)圖3。從圖中可見(jiàn)，6種混養(yǎng)模式中，豐度最高的微生物均為變形菌門（Proteobacteria），其次為放線菌門（Actinobacteria）。在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、縊蟶、褐牙鲆混養(yǎng)池塘（DX6）中，變形菌門豐度最高，為67.9%，在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、縊蟶混養(yǎng)池塘（DX5）中，變形菌門豐度最低，為47.4%，放線菌的豐度最高，為19.7%，而在DX6中，放線菌的豐度最低，僅為8.8%。DX6與DX5相比，增加了褐牙鲆，說(shuō)明褐牙鲆的生長(zhǎng)會(huì)特異性的富集養(yǎng)殖池塘沉積物中的變形菌門，同時(shí)會(huì)抑制放線菌的生長(zhǎng)。除此之外，在中國(guó)明對(duì)蝦、海參、斑節(jié)對(duì)蝦混養(yǎng)池塘（DX3）和中國(guó)明對(duì)蝦、三疣梭子蟹混養(yǎng)池塘（DX4）中，厚壁菌門（Firmicutes）的豐度明顯高于其他養(yǎng)殖池塘，在DX3和DX4中厚壁菌門的豐度分別為8.9%和9.5%。而其他池塘僅為4%左右。厚壁菌門主要為厭氧菌，其在DX3和DX4養(yǎng)殖池塘中豐度較高，說(shuō)明海參和梭子蟹對(duì)于養(yǎng)殖池塘沉積物的翻動(dòng)作用并不明顯，而其他養(yǎng)殖池因?yàn)榇嬖诜坡少e蛤仔或縊蟶等底棲貝類，使得養(yǎng)殖池沉積物中溶解氧較高，導(dǎo)致厚壁菌生長(zhǎng)受限。由于大部分測(cè)序數(shù)據(jù)均只能注釋到科水平，因此本實(shí)驗(yàn)在科水平進(jìn)一步比較不同中國(guó)明對(duì)蝦混養(yǎng)池塘沉積物中特異性富集的微生物，結(jié)果見(jiàn)圖4。在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、菲律賓蛤仔、斑節(jié)對(duì)蝦混養(yǎng)池塘（DX1）中，大部分微生物與其他養(yǎng)殖模式無(wú)明顯差別，只有一種未鑒定的Gamma-proteobacteria和JTB255 marine benthic group在DX1沉積物中豐度較高。在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、菲律賓蛤仔混養(yǎng)池塘（DX2）中，Erythrobacteraceae、Solibacteraceae和一種未鑒定的Chloroplast被特異性富集。在中國(guó)明對(duì)蝦、刺參、斑節(jié)對(duì)蝦混養(yǎng)池塘（DX3）中，F(xiàn)amilyl、Christensenellaceae、Spirochaetaceae、Microbacteriaceae和Acantholeuribacteraceae的豐度明顯高于其他養(yǎng)殖池塘。在中國(guó)明對(duì)蝦、三疣梭子蟹混養(yǎng)池塘（DX4）中，Draconibacteriaceae、Staphylococcaceae和Sphingomonadaceae的豐度顯著升高。在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、縊蟶混養(yǎng)池塘（DX5）中，OM1clade、Nitrospiraceae和Flavobacteriaceae被明顯富集。在中國(guó)明對(duì)蝦、海蜇、縊蟶、褐牙鲆混養(yǎng)池塘（DX6）中，豐度出現(xiàn)明顯提高的微生物種類最多，包括Caulobacteriaceae、Moraxellaceae、Sva1033、Desulfobacteraceae、Helicobacteraceae、Burkholderiaceae和Comamonadaceae。

【參考文獻(xiàn)】：
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