長江上游中華紋胸鮡遺傳多樣性及結構研究
發(fā)布時間：2021-11-20 20:03
長江上游是生物多樣性豐富區(qū),也是長江特有魚類棲息的生態(tài)敏感區(qū)。中華紋胸鮡屬鲇形目（Siluriformes）、鮡科（Sisoridae）、紋胸鮡屬（Glyptothorax）,是一種小型底棲魚類,對生存環(huán)境有著高度依賴性和適應性,分布也較為廣泛,既可生活在高山峽谷河流中,也可在平原湖泊及河流中,形成了不同的生態(tài)群,是研究生物地理學和環(huán)境適應性的良好對象。近年來長江上游水電梯級開發(fā)造成魚類棲息地縮小和破碎化,對其生境及自然資源產(chǎn)生了重大影響,遺傳多樣性和遺傳結構的研究有助于種質(zhì)資源評估和保護措施的制定。根據(jù)中華紋胸鮡的分布,2017-2018年在長江上游干流[巴南（BN）、江津（JJ）、合江（HJ）、瀘州（LZ）、南溪（NX）]、岷江[犍為（QW）]、金沙江中游[攀枝花（PZH）]、金沙江下游[巧家（QJ）]及支流黑水河[寧南（NN）]9個江段共采集341尾中華紋胸鮡,對中華紋胸鮡開展了群體遺傳研究,主要研究結果如下:1. 采用cyt b和COI序列對長江上游、岷江、金沙江中游、金沙江下游及支流黑水河9個群體共341尾樣本進行分析,結果顯示:（1）遺傳多樣性:cyt b序列共檢測到80個...
【文章來源】：上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
中華紋胸鮡(長江水產(chǎn)研究所，2018)
上海海洋大學碩士學位論文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因擴增引物為FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。兩個基因采用相同PCR擴增體系和反應程序，50μL的體系包含MasterMix酶(2，武漢天一輝遠生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，滅菌去離子水補至50μL。圖2-1中華紋胸鮡采樣位點Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR擴增反應程序如圖2-2所示：圖2-2PCR擴增反應程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖檢測，將擴增效果良好的擴增產(chǎn)物送至武漢天一輝遠生物科技有限公司進行雙向測序，測序引物與PCR引物相同。
上海海洋大學碩士學位論文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因擴增引物為FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。兩個基因采用相同PCR擴增體系和反應程序，50μL的體系包含MasterMix酶(2，武漢天一輝遠生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，滅菌去離子水補至50μL。圖2-1中華紋胸鮡采樣位點Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR擴增反應程序如圖2-2所示：圖2-2PCR擴增反應程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖檢測，將擴增效果良好的擴增產(chǎn)物送至武漢天一輝遠生物科技有限公司進行雙向測序，測序引物與PCR引物相同。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]長江白鱘滅絕敲響生態(tài)警鐘[J]. 張濤,楊麗. 生態(tài)經(jīng)濟. 2020(03)
[2]基于線粒體cytb序列的花斑蛇鯔種群遺傳結構研究[J]. 李敏,黃梓榮,許友偉,陳作志. 南方水產(chǎn)科學. 2019(06)
[3]基于線粒體基因nd5對長江上游黑尾近紅鲌遺傳多樣性分析[J]. 嚴太明,王雄延,羅杰,李松,張騫,何亮,張松培,何佳洋,何智. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(05)
[4]基于微衛(wèi)星標記的黃唇魚遺傳多樣性研究[J]. 趙彥花,區(qū)又君,溫久福,李加兒,周慧. 南方水產(chǎn)科學. 2019(04)
[5]5種類型鯉魚線粒體DNA D-loop及鄰近區(qū)段的遺傳多樣性分析[J]. 白云,王妍,胡瑩,張興華,金萬昆,高永平,楊建新,董仕. 水產(chǎn)科學. 2019(04)
[6]基于CO I和Cytb DNA條形碼在鲌屬魚類物種鑒定中的應用[J]. 王利華,羅相忠,王丹,李偉,李忠,鄒桂偉,梁宏偉. 淡水漁業(yè). 2019(04)
[7]DNA條形碼在西藏水系裂腹魚亞科魚類鑒定中的研究[J]. 周建設,張馳,劉海平,馬波,王萬良,曾本和,牟振波. 淡水漁業(yè). 2019(01)
[8]長江中上游圓筒吻鮈群體線粒體Cyt b遺傳多樣性分析[J]. 蒲艷,田輝伍,陳大慶,段辛斌,劉紹平,汪登強. 淡水漁業(yè). 2019(01)
[9]微衛(wèi)星標記及其在動物親緣關系鑒定中的應用[J]. 張正義,邢秀梅,胡鵬飛,劉松嘯,董依萌,鞠貴春. 基因組學與應用生物學. 2018(04)
[10]長江上游特有魚類紅唇薄鰍線粒體控制區(qū)遺傳多樣性研究[J]. 申紹祎,田輝伍,汪登強,陳大慶,劉紹平. 淡水漁業(yè). 2017(04)
博士論文
[1]長江上游鮈亞科魚類資源及生境選擇策略研究[D]. 高天珩.西南大學 2016
[2]中國鮡科魚類系統(tǒng)發(fā)育、生物地理及高原適應進化研究[D]. 馬秀慧.西南大學 2015
[3]半滑舌鰨、牙鲆微衛(wèi)星遺傳連鎖圖譜的構建[D]. 宋文濤.上海海洋大學 2012
[4]黑斑原鮡遺傳多樣性分析及微衛(wèi)星標記的開發(fā)[D]. 郭寶英.華中農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]中國光唇魚屬親緣地理研究[D]. 侯曉靜.上海海洋大學 2019
[2]華南及鄰近地區(qū)不同群體大刺鰍的遺傳多樣性及親緣地理研究[D]. 江小璐.廣州大學 2018
[3]三種鮡科魚類線粒體全基因組的測定及鮡科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 李博.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[4]長江上游寡鱗飄魚和宜昌鰍鮀早期資源研究[D]. 王涵.西南大學 2016
[5]基于微衛(wèi)星標記和線粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學 2013
[6]美洲斑潛蠅多態(tài)性微衛(wèi)星標記篩選及種群遺傳結構研究[D]. 季巖.揚州大學 2013
[7]大眼華鳊遺傳多樣性和親緣地理學研究[D]. 趙良杰.上海海洋大學 2012
[8]長江上游梯級水電開發(fā)對魚類生物多樣性影響的初探[D]. 李陳.華中科技大學 2012
[9]瀾滄江老撾紋胸鮡遺傳結構分析[D]. 金菊.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[10]怒江扎那紋胸鮡遺傳多樣性研究[D]. 袁希平.華中農(nóng)業(yè)大學 2009
本文編號：3508017
【文章來源】：上海海洋大學上海市
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
中華紋胸鮡(長江水產(chǎn)研究所，2018)
上海海洋大學碩士學位論文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因擴增引物為FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。兩個基因采用相同PCR擴增體系和反應程序，50μL的體系包含MasterMix酶(2，武漢天一輝遠生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，滅菌去離子水補至50μL。圖2-1中華紋胸鮡采樣位點Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR擴增反應程序如圖2-2所示：圖2-2PCR擴增反應程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖檢測，將擴增效果良好的擴增產(chǎn)物送至武漢天一輝遠生物科技有限公司進行雙向測序，測序引物與PCR引物相同。
上海海洋大學碩士學位論文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因擴增引物為FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。兩個基因采用相同PCR擴增體系和反應程序，50μL的體系包含MasterMix酶(2，武漢天一輝遠生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，滅菌去離子水補至50μL。圖2-1中華紋胸鮡采樣位點Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR擴增反應程序如圖2-2所示：圖2-2PCR擴增反應程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖檢測，將擴增效果良好的擴增產(chǎn)物送至武漢天一輝遠生物科技有限公司進行雙向測序，測序引物與PCR引物相同。
【參考文獻】：
期刊論文
[1]長江白鱘滅絕敲響生態(tài)警鐘[J]. 張濤,楊麗. 生態(tài)經(jīng)濟. 2020(03)
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[3]基于線粒體基因nd5對長江上游黑尾近紅鲌遺傳多樣性分析[J]. 嚴太明,王雄延,羅杰,李松,張騫,何亮,張松培,何佳洋,何智. 四川農(nóng)業(yè)大學學報. 2019(05)
[4]基于微衛(wèi)星標記的黃唇魚遺傳多樣性研究[J]. 趙彥花,區(qū)又君,溫久福,李加兒,周慧. 南方水產(chǎn)科學. 2019(04)
[5]5種類型鯉魚線粒體DNA D-loop及鄰近區(qū)段的遺傳多樣性分析[J]. 白云,王妍,胡瑩,張興華,金萬昆,高永平,楊建新,董仕. 水產(chǎn)科學. 2019(04)
[6]基于CO I和Cytb DNA條形碼在鲌屬魚類物種鑒定中的應用[J]. 王利華,羅相忠,王丹,李偉,李忠,鄒桂偉,梁宏偉. 淡水漁業(yè). 2019(04)
[7]DNA條形碼在西藏水系裂腹魚亞科魚類鑒定中的研究[J]. 周建設,張馳,劉海平,馬波,王萬良,曾本和,牟振波. 淡水漁業(yè). 2019(01)
[8]長江中上游圓筒吻鮈群體線粒體Cyt b遺傳多樣性分析[J]. 蒲艷,田輝伍,陳大慶,段辛斌,劉紹平,汪登強. 淡水漁業(yè). 2019(01)
[9]微衛(wèi)星標記及其在動物親緣關系鑒定中的應用[J]. 張正義,邢秀梅,胡鵬飛,劉松嘯,董依萌,鞠貴春. 基因組學與應用生物學. 2018(04)
[10]長江上游特有魚類紅唇薄鰍線粒體控制區(qū)遺傳多樣性研究[J]. 申紹祎,田輝伍,汪登強,陳大慶,劉紹平. 淡水漁業(yè). 2017(04)
博士論文
[1]長江上游鮈亞科魚類資源及生境選擇策略研究[D]. 高天珩.西南大學 2016
[2]中國鮡科魚類系統(tǒng)發(fā)育、生物地理及高原適應進化研究[D]. 馬秀慧.西南大學 2015
[3]半滑舌鰨、牙鲆微衛(wèi)星遺傳連鎖圖譜的構建[D]. 宋文濤.上海海洋大學 2012
[4]黑斑原鮡遺傳多樣性分析及微衛(wèi)星標記的開發(fā)[D]. 郭寶英.華中農(nóng)業(yè)大學 2009
碩士論文
[1]中國光唇魚屬親緣地理研究[D]. 侯曉靜.上海海洋大學 2019
[2]華南及鄰近地區(qū)不同群體大刺鰍的遺傳多樣性及親緣地理研究[D]. 江小璐.廣州大學 2018
[3]三種鮡科魚類線粒體全基因組的測定及鮡科魚類系統(tǒng)發(fā)育分析[D]. 李博.華中農(nóng)業(yè)大學 2016
[4]長江上游寡鱗飄魚和宜昌鰍鮀早期資源研究[D]. 王涵.西南大學 2016
[5]基于微衛(wèi)星標記和線粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學 2013
[6]美洲斑潛蠅多態(tài)性微衛(wèi)星標記篩選及種群遺傳結構研究[D]. 季巖.揚州大學 2013
[7]大眼華鳊遺傳多樣性和親緣地理學研究[D]. 趙良杰.上海海洋大學 2012
[8]長江上游梯級水電開發(fā)對魚類生物多樣性影響的初探[D]. 李陳.華中科技大學 2012
[9]瀾滄江老撾紋胸鮡遺傳結構分析[D]. 金菊.華中農(nóng)業(yè)大學 2011
[10]怒江扎那紋胸鮡遺傳多樣性研究[D]. 袁希平.華中農(nóng)業(yè)大學 2009
本文編號：3508017
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