大黃魚選育群體SSR遺傳多樣性分析、耐低溫分子標記篩選和耐低溫基因CIRP表達
發(fā)布時間：2021-11-20 17:08
大黃魚（Pseudosciaena crocea）隸屬鱸形目、石首魚科、黃魚屬，是我國重要的海水網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚類。因浙江養(yǎng)殖海區(qū)冬季水溫較低，每年有大黃魚被凍死，養(yǎng)殖戶每年或多或少有經(jīng)濟損失。為此，項目組成員通過人工選育獲得了耐低溫能力強的大黃魚“東海1號”。本研究針對該大黃魚選育群體進行遺傳多樣性分析和耐低溫相關分子標記篩選，以及克隆耐低溫基因CIRP并分析其在低溫脅迫下的組織表達情況。遺傳多樣性分析表明，選育群體的平均觀測雜合度、平均期望雜合度和多態(tài)信息含量分別為0.681、0.657和0.596，表明其遺傳多樣性較高，具備進一步遺傳育種的潛力，但應給與保護，避免遺傳多樣性進一步丟失。選育群體中兩個不同低溫耐受群體的平均等位基因數(shù)為4.4544.546，平均觀測雜合度為0.6770.685，平均期望雜合度為0.6530.661，多態(tài)信息含量為0.5910.601，兩個群體間的遺傳多樣性水平相當，表明耐低溫性狀差異可能不會導致群體間的遺傳分化。微衛(wèi)星分析結(jié)果顯示，標記KPC43在選育群體的2組大黃魚樣...
【文章來源】：寧波大學浙江省
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
部分大黃魚基因組DNA電泳檢測圖
圖 3.1 微衛(wèi)星引物 KPC43 擴增的兩群體間差異顯著的部分條帶Fig.3.1 Significantly diffienent band amplified by microsatellite primer KPC43注：1-10 為 DM；11-30 為 DN；M：PUC19 DNA ladder表 3.1 KPC43 位點差異顯著的兩個等位基因在各組中出現(xiàn)次數(shù)統(tǒng)計Tab.3.1 The statistic of two differential alleles of microsatellite loci KPC43等位基因片段大�。╞p）占 M 組總數(shù)（百分比 %）占 N 組總數(shù)（百分比 %）150 23/30（76.67%） 10/30（30.0 %）170 7/30（23.33 %） 24/30（80.0%）注：M 為“東海 1 號”低溫敏感組；N 為“東海 1 號”低溫耐受組。表 3.2 微衛(wèi)星位點 KPC43 兩個差異等位基因與大黃魚耐低溫性的相關性分析Tab.3.2 The correlative analysis of two differential alleles microsatellite loci KPC43 and thecold tolerance of Pseudosciaena crocea微衛(wèi)星位點 KPC43 KPC43差異等位基因大小170 150
圖 3.2 KPC 位點 2 個差異等位基因片段序列的比對結(jié)果（各等位基因相同序列以陰影部分標注）序列比對結(jié)果表明，微衛(wèi)星位點 KPC43 兩個差異等位基因片段序列的差別僅在于（TG）重復單位的重復次數(shù)不同，KPC43170bp比 KPC43150bp在（TG）重復單位上多重復了 10 次。3 討論本研究中二核苷酸微衛(wèi)星 KPC43 的 PAGE 擴增電泳圖中出現(xiàn)了滯后于主帶的影子帶（stutter bands），影子帶比主帶小2 bp。出現(xiàn)影子帶的原因與 PCR 反應條件、變性及電泳條件的控制不當有關。關于影子帶形成機理，Muray等[95]（1993）在研究 CA 二核苷酸重復序列的 PCR 擴增時認為，CA 重復序列區(qū)中 20 bp 的隨機缺失所導致的影子帶可能是 DNA 鏈在復制過程中發(fā)生滑動錯配所致。由于主帶是特異性條帶，濃度高而亮度大；而影子帶為非特異性條帶，濃度小而亮度低，并且影子帶一般比主帶跑的慢，因此并不影響我們對等位基因的判讀。迄今，關于魚類抗寒相關分子標記的研究，我國已有相關報道。如梁利群等[39]（2003）首次從荷包紅鯉抗寒品系中篩選到了 6 個與鯉耐低溫相關的 RAPD 標記，隨
【參考文獻】：
期刊論文
[1]草魚野生群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析[J]. 傅建軍,李家樂,沈玉幫,王榮泉,宣云峰,徐曉雁,陳勇. 遺傳. 2013(02)
[2]急性溫度應激對吉富品系尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）幼魚生化指標和肝臟HSP70 mRNA表達的影響[J]. 強俊,楊弘,王輝,徐跑,何杰. 海洋與湖沼. 2012(05)
[3]鯉耐低溫候選基因CcSCD全長cDNA的克隆及功能預測[J]. 常玉梅,徐麗華,李世國,唐然,梁利群. 水產(chǎn)學雜志. 2012(03)
[4]褐牙鲆耐熱相關分子標記篩選及遺傳多樣性分析[J]. 李三磊,徐冬冬,樓寶,辛儉,耿智,程國寶. 上海海洋大學學報. 2012(04)
[5]不同強度冷刺激對大鼠心臟、大腦、睪丸和肺臟中CIRP表達的影響[J]. 趙雅楠,李玉恒,李昌盛,林增,李儉,楊煥民,李士澤. 應用與環(huán)境生物學報. 2012(01)
[6]低溫應激對吉富羅非魚血清生化指標及肝臟HSP70基因表達的影響[J]. 劉波,王美垚,謝駿,徐跑,戈賢平,何義進,繆凌鴻,潘良坤. 生態(tài)學報. 2011(17)
[7]閩粵群和岱衢群養(yǎng)殖大黃魚（Pseudosciaena crocea）及其雜交子代遺傳差異的SSR分析[J]. 黃振遠,蘇永全,張建設,吳常文. 海洋與湖沼. 2011(04)
[8]鯉腦組織低溫差異表達候選基因的篩選[J]. 徐麗華,常玉梅,劉春雷,梁利群,劉金亮,池炳杰. 遺傳. 2011(03)
[9]鯉EST標記與耐低溫性狀的相關性分析及定位[J]. 常玉梅,高國強,徐麗華,劉金亮,劉春雷,梁利群. 動物學研究. 2010(06)
[10]低溫脅迫下大黃魚肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,徐鎮(zhèn),徐萬土. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2010(02)
本文編號：3507773
【文章來源】：寧波大學浙江省
【文章頁數(shù)】：56 頁
【學位級別】：碩士
【部分圖文】：
部分大黃魚基因組DNA電泳檢測圖
圖 3.1 微衛(wèi)星引物 KPC43 擴增的兩群體間差異顯著的部分條帶Fig.3.1 Significantly diffienent band amplified by microsatellite primer KPC43注：1-10 為 DM；11-30 為 DN；M：PUC19 DNA ladder表 3.1 KPC43 位點差異顯著的兩個等位基因在各組中出現(xiàn)次數(shù)統(tǒng)計Tab.3.1 The statistic of two differential alleles of microsatellite loci KPC43等位基因片段大�。╞p）占 M 組總數(shù)（百分比 %）占 N 組總數(shù)（百分比 %）150 23/30（76.67%） 10/30（30.0 %）170 7/30（23.33 %） 24/30（80.0%）注：M 為“東海 1 號”低溫敏感組；N 為“東海 1 號”低溫耐受組。表 3.2 微衛(wèi)星位點 KPC43 兩個差異等位基因與大黃魚耐低溫性的相關性分析Tab.3.2 The correlative analysis of two differential alleles microsatellite loci KPC43 and thecold tolerance of Pseudosciaena crocea微衛(wèi)星位點 KPC43 KPC43差異等位基因大小170 150
圖 3.2 KPC 位點 2 個差異等位基因片段序列的比對結(jié)果（各等位基因相同序列以陰影部分標注）序列比對結(jié)果表明，微衛(wèi)星位點 KPC43 兩個差異等位基因片段序列的差別僅在于（TG）重復單位的重復次數(shù)不同，KPC43170bp比 KPC43150bp在（TG）重復單位上多重復了 10 次。3 討論本研究中二核苷酸微衛(wèi)星 KPC43 的 PAGE 擴增電泳圖中出現(xiàn)了滯后于主帶的影子帶（stutter bands），影子帶比主帶小2 bp。出現(xiàn)影子帶的原因與 PCR 反應條件、變性及電泳條件的控制不當有關。關于影子帶形成機理，Muray等[95]（1993）在研究 CA 二核苷酸重復序列的 PCR 擴增時認為，CA 重復序列區(qū)中 20 bp 的隨機缺失所導致的影子帶可能是 DNA 鏈在復制過程中發(fā)生滑動錯配所致。由于主帶是特異性條帶，濃度高而亮度大；而影子帶為非特異性條帶，濃度小而亮度低，并且影子帶一般比主帶跑的慢，因此并不影響我們對等位基因的判讀。迄今，關于魚類抗寒相關分子標記的研究，我國已有相關報道。如梁利群等[39]（2003）首次從荷包紅鯉抗寒品系中篩選到了 6 個與鯉耐低溫相關的 RAPD 標記，隨
【參考文獻】：
期刊論文
[1]草魚野生群體遺傳變異的微衛(wèi)星分析[J]. 傅建軍,李家樂,沈玉幫,王榮泉,宣云峰,徐曉雁,陳勇. 遺傳. 2013(02)
[2]急性溫度應激對吉富品系尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）幼魚生化指標和肝臟HSP70 mRNA表達的影響[J]. 強俊,楊弘,王輝,徐跑,何杰. 海洋與湖沼. 2012(05)
[3]鯉耐低溫候選基因CcSCD全長cDNA的克隆及功能預測[J]. 常玉梅,徐麗華,李世國,唐然,梁利群. 水產(chǎn)學雜志. 2012(03)
[4]褐牙鲆耐熱相關分子標記篩選及遺傳多樣性分析[J]. 李三磊,徐冬冬,樓寶,辛儉,耿智,程國寶. 上海海洋大學學報. 2012(04)
[5]不同強度冷刺激對大鼠心臟、大腦、睪丸和肺臟中CIRP表達的影響[J]. 趙雅楠,李玉恒,李昌盛,林增,李儉,楊煥民,李士澤. 應用與環(huán)境生物學報. 2012(01)
[6]低溫應激對吉富羅非魚血清生化指標及肝臟HSP70基因表達的影響[J]. 劉波,王美垚,謝駿,徐跑,戈賢平,何義進,繆凌鴻,潘良坤. 生態(tài)學報. 2011(17)
[7]閩粵群和岱衢群養(yǎng)殖大黃魚（Pseudosciaena crocea）及其雜交子代遺傳差異的SSR分析[J]. 黃振遠,蘇永全,張建設,吳常文. 海洋與湖沼. 2011(04)
[8]鯉腦組織低溫差異表達候選基因的篩選[J]. 徐麗華,常玉梅,劉春雷,梁利群,劉金亮,池炳杰. 遺傳. 2011(03)
[9]鯉EST標記與耐低溫性狀的相關性分析及定位[J]. 常玉梅,高國強,徐麗華,劉金亮,劉春雷,梁利群. 動物學研究. 2010(06)
[10]低溫脅迫下大黃魚肝臟蛋白質(zhì)組雙向電泳分析[J]. 李明云,冀德偉,吳海慶,陳炯,史雨紅,徐鎮(zhèn),徐萬土. 農(nóng)業(yè)生物技術學報. 2010(02)
本文編號：3507773
本文鏈接：http://sikaile.net/nykjlw/scyylw/3507773.html
最近更新
教材專著
