尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）是世界以及我國南方區(qū)域養(yǎng)殖的重要淡水魚類之一。近年來隨著我國水產(chǎn)養(yǎng)殖規(guī)模的擴大,羅非魚病毒性和細菌性疾病多發(fā),造成了嚴重的經(jīng)濟損失,嚴重影響該養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,因此免疫防治成為解決這些病害問題的重要突破口。CD22屬是唾液酸結合免疫球蛋白樣凝集（Sigles）家族成員,為I型跨蛋白。該基因表達在成熟的B細胞膜上。CD22的細胞內域包括免疫受體酪氨酸活化基序（Immunoreceptor tyrosine-based activation motif,ITAM）和免疫受體酪氨酸抑制基序（Immunoreceptor tyrosine-based inhibition motifs,ITIM）。CD22是一個黏附類的信號分子,與細胞間相互作用有關,在B細胞的轉導過程中起重要作用。本研究克隆的CD22基因開放閱讀框序列,對比其表達特征及功能進行了分析。研究結果如下:1.本論文探索尼羅羅非魚（Oreochromis niloticus）CD22在免疫應答中的作用。根據(jù)NCBI上公布的羅非魚CD22基因（記為On-CD22）（Gen Bank登... 

【文章來源】：廣東海洋大學廣東省

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【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

On-CD22基因克隆Fig.2-1CloningofOn-CD22

尼羅羅非魚CD22基因的克隆表達和功能研究16圖2-3On-CD22氨基酸序列保守結構域Fig.2-3ConservativedomainwithinaminoacidsequenceofOn-CD222.4.2二級結構和三級結構預測使用在線軟件ExPASy中的SOPMA程序預測On-CD22蛋白的二級結構，分析結果顯示（圖2-4）,該蛋白以無規(guī)則卷曲為主，其中α-螺旋占總鏈的6.74%，無規(guī)則卷曲占總鏈的52.53%，β-轉角占總鏈的3.37%，延伸鏈占總鏈的37.36%。利用在線軟件SWISS-MODEL對On-CD22蛋白進行同源模建，獲其三級結構模型，其最佳模型是5vKm.1.A（圖2-5），序列一致性為30.71%；另一模型是5lf5.1A,序列一致性為22.04%。圖2-4On-CD22蛋白二級結構預測Fig.2-4PredictedsecondarystructureofOn-CD22圖注：藍色：α-螺；紅色：β-轉角；綠色：延伸鏈；紫色：無規(guī)則卷曲；Note：Blue：α-helix；Red：β-extend；Purple：randomcoil；Green：Extensionchain

廣東海洋大學碩士學位論文17圖2-5On-CD22蛋白跨膜區(qū)三維結構Fig.2-5Thethree-dimensionalstructuresoftransmembraneregionofOn-CD222.4.3On-CD22序列同源比對及進化分析利用MegAlign軟件將克隆得到的On-CD22基因序列與伯氏樸麗魚、斑馬擬麗魚、大黃魚、尼加拉瓜湖始麗魚、布氏新亮鯛、奧利亞羅非魚、小家鼠、奈里樸麗魚、智人等與該基因序列進行相似性比對，其中尼羅羅非魚與奧利亞羅非魚序列相似性高達96.53%,與奈里樸麗魚序列相似性為54.78%（表2-4）。利用MEGA7.0軟件采用鄰接法構建羅非魚CD22基因系統(tǒng)進化樹，結果顯示尼羅羅非魚與奧利亞羅非魚的親緣性最近，其次是奈里樸麗魚，而與小家鼠和智人等物種相距最遠。其他物種的CD22氨基酸序列的鄰接法系統(tǒng)進化樹（圖2-6）羅非魚與奧利亞羅非魚的CD22聚為1支，有較高的同源性。表2-4序列相似性Table2-4similaritysequence物種序列號序列相似性Maylandiazebra斑馬擬麗魚XP_004566890.189.57%Larimichthyscrocea大黃魚XP_019112342.254.7%Haplochromisburtoni伯氏樸麗魚XP_005943881.190.12%Archocentruscentrarchus尼加拉瓜湖始麗魚XP_030605075.172.01%Neolamprologusbrichardi布氏新亮鯛XP_006794956.190.12%Oreochromisaureus奧利亞羅非魚XP_031588969.196.53%Musmusculus小家鼠XP_006539553.132.5%Haplochromisnyererei奈里樸麗魚XP_005743322.190.12%Homosapiens智人NP_001265346.131.07%

【參考文獻】：
期刊論文
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博士論文
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碩士論文
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[5]羅非魚免疫記憶及體外淋巴細胞增殖的研究[D]. 龐碧劍.廣東海洋大學 2012
[6]中國羅非魚出口貿易國際競爭力研究[D]. 王斌.江南大學 2011
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