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尼羅羅非魚CD22基因的克隆表達(dá)和功能研究

發(fā)布時(shí)間:2021-11-08 07:07
  尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)是世界以及我國(guó)南方區(qū)域養(yǎng)殖的重要淡水魚類之一。近年來隨著我國(guó)水產(chǎn)養(yǎng)殖規(guī)模的擴(kuò)大,羅非魚病毒性和細(xì)菌性疾病多發(fā),造成了嚴(yán)重的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重影響該養(yǎng)殖業(yè)的發(fā)展,因此免疫防治成為解決這些病害問題的重要突破口。CD22屬是唾液酸結(jié)合免疫球蛋白樣凝集(Sigles)家族成員,為I型跨蛋白。該基因表達(dá)在成熟的B細(xì)胞膜上。CD22的細(xì)胞內(nèi)域包括免疫受體酪氨酸活化基序(Immunoreceptor tyrosine-based activation motif,ITAM)和免疫受體酪氨酸抑制基序(Immunoreceptor tyrosine-based inhibition motifs,ITIM)。CD22是一個(gè)黏附類的信號(hào)分子,與細(xì)胞間相互作用有關(guān),在B細(xì)胞的轉(zhuǎn)導(dǎo)過程中起重要作用。本研究克隆的CD22基因開放閱讀框序列,對(duì)比其表達(dá)特征及功能進(jìn)行了分析。研究結(jié)果如下:1.本論文探索尼羅羅非魚(Oreochromis niloticus)CD22在免疫應(yīng)答中的作用。根據(jù)NCBI上公布的羅非魚CD22基因(記為On-CD22)(Gen Bank登... 

【文章來源】:廣東海洋大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】:55 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

尼羅羅非魚CD22基因的克隆表達(dá)和功能研究


On-CD22基因克隆Fig.2-1CloningofOn-CD22

氨基酸序列,結(jié)構(gòu)域,氨基酸序列,二級(jí)結(jié)構(gòu)


尼羅羅非魚CD22基因的克隆表達(dá)和功能研究16圖2-3On-CD22氨基酸序列保守結(jié)構(gòu)域Fig.2-3ConservativedomainwithinaminoacidsequenceofOn-CD222.4.2二級(jí)結(jié)構(gòu)和三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)使用在線軟件ExPASy中的SOPMA程序預(yù)測(cè)On-CD22蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),分析結(jié)果顯示(圖2-4),該蛋白以無規(guī)則卷曲為主,其中α-螺旋占總鏈的6.74%,無規(guī)則卷曲占總鏈的52.53%,β-轉(zhuǎn)角占總鏈的3.37%,延伸鏈占總鏈的37.36%。利用在線軟件SWISS-MODEL對(duì)On-CD22蛋白進(jìn)行同源模建,獲其三級(jí)結(jié)構(gòu)模型,其最佳模型是5vKm.1.A(圖2-5),序列一致性為30.71%;另一模型是5lf5.1A,序列一致性為22.04%。圖2-4On-CD22蛋白二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)Fig.2-4PredictedsecondarystructureofOn-CD22圖注:藍(lán)色:α-螺;紅色:β-轉(zhuǎn)角;綠色:延伸鏈;紫色:無規(guī)則卷曲;Note:Blue:α-helix;Red:β-extend;Purple:randomcoil;Green:Extensionchain

三維結(jié)構(gòu),蛋白,羅非魚,小家鼠


廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文17圖2-5On-CD22蛋白跨膜區(qū)三維結(jié)構(gòu)Fig.2-5Thethree-dimensionalstructuresoftransmembraneregionofOn-CD222.4.3On-CD22序列同源比對(duì)及進(jìn)化分析利用MegAlign軟件將克隆得到的On-CD22基因序列與伯氏樸麗魚、斑馬擬麗魚、大黃魚、尼加拉瓜湖始麗魚、布氏新亮鯛、奧利亞羅非魚、小家鼠、奈里樸麗魚、智人等與該基因序列進(jìn)行相似性比對(duì),其中尼羅羅非魚與奧利亞羅非魚序列相似性高達(dá)96.53%,與奈里樸麗魚序列相似性為54.78%(表2-4)。利用MEGA7.0軟件采用鄰接法構(gòu)建羅非魚CD22基因系統(tǒng)進(jìn)化樹,結(jié)果顯示尼羅羅非魚與奧利亞羅非魚的親緣性最近,其次是奈里樸麗魚,而與小家鼠和智人等物種相距最遠(yuǎn)。其他物種的CD22氨基酸序列的鄰接法系統(tǒng)進(jìn)化樹(圖2-6)羅非魚與奧利亞羅非魚的CD22聚為1支,有較高的同源性。表2-4序列相似性Table2-4similaritysequence物種序列號(hào)序列相似性Maylandiazebra斑馬擬麗魚XP_004566890.189.57%Larimichthyscrocea大黃魚XP_019112342.254.7%Haplochromisburtoni伯氏樸麗魚XP_005943881.190.12%Archocentruscentrarchus尼加拉瓜湖始麗魚XP_030605075.172.01%Neolamprologusbrichardi布氏新亮鯛XP_006794956.190.12%Oreochromisaureus奧利亞羅非魚XP_031588969.196.53%Musmusculus小家鼠XP_006539553.132.5%Haplochromisnyererei奈里樸麗魚XP_005743322.190.12%Homosapiens智人NP_001265346.131.07%

【參考文獻(xiàn)】:
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本文編號(hào):3483246

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