刺參（Apostichopus japonicus）隸屬于棘皮動(dòng)物門(mén)、游走亞門(mén)、海參綱、楯手目、刺參科，自然分布在西太平洋的中國(guó)、韓國(guó)、日本沿海，深受這些國(guó)家人民的喜愛(ài)。利用分子標(biāo)記的方法研究刺參的遺傳多樣性是近些年發(fā)展起來(lái)的。本文利用SSR與COⅠ兩種分子標(biāo)記方法對(duì)大連自然刺參群體與養(yǎng)殖刺參群體進(jìn)行遺傳多樣性研究和遺傳結(jié)構(gòu)比對(duì)分析。結(jié)果表明，SSR標(biāo)記揭示了自然群體具有高度的遺傳多樣性。篩選獲得33對(duì)引物，目的片段大小為67-306bp之間；每個(gè)引物檢測(cè)出等位基因數(shù)3-8不等；有效等位基因平均為4.736個(gè)；期望雜合度He和觀測(cè)雜合度Ho分別為0.270-0.8446和0.598-0.875；大連海域自然群體的多態(tài)信息含量平均數(shù)為0.732，說(shuō)明遺傳多樣性豐富；共有23對(duì)引物符合哈迪溫伯格平衡，被檢測(cè)位點(diǎn)偏離Hardy–Weinberg平衡的現(xiàn)象普遍存在，我們認(rèn)為這可能是由實(shí)驗(yàn)所采用的樣本數(shù)量和規(guī)格大小有限或者是由于無(wú)效等位基因的存在。COⅠ序列對(duì)野生和養(yǎng)殖群體測(cè)序、比對(duì)和對(duì)位排列后的結(jié)果表明，有654個(gè)堿基具有同源序列，共四個(gè)群體選取49個(gè)體，40個(gè)個(gè)體發(fā)現(xiàn)變異位點(diǎn)（YSA9個(gè)、Y... 

【文章來(lái)源】：大連海洋大學(xué)遼寧省

【文章頁(yè)數(shù)】：59 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

普通方法提取刺參DNA1％瓊脂糖電泳圖（M=DL2000）

改進(jìn)方法提取刺參DNA1％瓊脂糖電泳圖（M=DL2000）

退火溫度60℃全部引物同一基因組PCR檢測(cè)電泳圖

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]利用DNA條形碼技術(shù)鑒定一批鱷魚(yú)產(chǎn)品[J]. 郭鳳娟,陽(yáng)建春,胡詩(shī)佳,李詠施.  生物技術(shù)通報(bào). 2013(08)
[2]基于COI基因序列的太湖新銀魚(yú)遺傳多樣性[J]. 張迪,雷光春,龔成,王忠鎖.  湖泊科學(xué). 2012(02)
[3]亞洲黑熊COI序列變異及其DNA條碼的應(yīng)用[J]. 魯再豐,蔣國(guó)紅,白素英.  東北林業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(10)
[4]福建近海藍(lán)圓鲹種群遺傳多樣性的AFLP分析[J]. 張麗艷,蘇永全,丁少雄,牛素芳,劉東騰,王軍.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2010(05)
[5]基于線(xiàn)粒體CO1基因的DNA條形碼在石首魚(yú)科（Sciaenidae）魚(yú)類(lèi)系統(tǒng)分類(lèi)中的應(yīng)用[J]. 柳淑芳,陳亮亮,戴芳群,莊志猛.  海洋與湖沼. 2010(02)
[6]舟山鮸魚(yú)群體遺傳多樣性的AFLP研究[J]. 彭志蘭,柳敏海,傅榮兵,羅海忠,夏楓峰,徐志進(jìn).  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2010(02)
[7]中國(guó)東海日本鰻鱺種群遺傳結(jié)構(gòu)的AFLP分析[J]. 張辛,許璞,許廣平,劉培庭,仲霞銘,李旭光,徐健榮,丁亞平,許曉風(fēng).  水生態(tài)學(xué)雜志. 2010(01)
[8]三種蟶的遺傳多樣性分析[J]. 邵艷卿,陸榮茂,董迎輝,柴雪良,肖國(guó)強(qiáng),林志華.  海洋科學(xué). 2009(10)
[9]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)
[10]單核苷酸多態(tài)性及其在水產(chǎn)動(dòng)物遺傳育種中的應(yīng)用[J]. 劉福平,白俊杰.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2008(04)

博士論文
[1]仿刺參（Apostichopus japonicus）分子標(biāo)記開(kāi)發(fā)及應(yīng)用[D]. 鄢婧婧.中國(guó)海洋大學(xué) 2013

碩士論文
[1]威海仿刺參野生種群遺傳多樣性分析[D]. 陶翠花.山東大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3475297