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日本鰻鱺小腸共生微生物多樣性及其功能分析

發(fā)布時間:2021-10-29 18:03
  日本鰻鱺經(jīng)濟價值高,是我國鰻鱺養(yǎng)殖業(yè)的重要品種。但是在實際養(yǎng)殖過程中,鰻鱺養(yǎng)殖密度大、產(chǎn)量高,容易造成營養(yǎng)不良、水質(zhì)惡化、環(huán)境污染等問題,從而導(dǎo)致鰻鱺受病害威脅的程度遠大于其他養(yǎng)殖水產(chǎn)種類,經(jīng)常發(fā)生腸炎等疾病,直接影響鰻業(yè)產(chǎn)值,造成巨大的經(jīng)濟損失。日本鰻鱺腸道中生活著大量的細菌,對魚類的生長發(fā)育、營養(yǎng)健康、免疫抗病等具有重要的作用。深入了解其物種和群落組成,是探索宿主內(nèi)腸道微生物作用機理以及研究宿主與腸道菌群相互關(guān)系的基礎(chǔ)和前提。主要研究結(jié)果如下:本研究采用傳統(tǒng)微生物分離純培養(yǎng)方法,從日本鰻鱺小腸中分離出33株形狀、顏色、大小不一的細菌,經(jīng)鑒定,共分離到16株不同的細菌(GenBank Accession Number:KP716690, KP716697, KP716703, KP716701, KP716691, KP716698, KP716692, KP716699, KP716694, KP716702, KP716695, KP716700, KP716704, KP716689, KP716696, KP716693),其中變形菌門Proteobacteria所占比例為7... 

【文章來源】:福建師范大學(xué)福建省

【文章頁數(shù)】:107 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

日本鰻鱺小腸共生微生物多樣性及其功能分析


圖3-2測序樣品稀釋曲線??Fig.3-2?民?arefaction?curve?of?the?Ay?口幻?smalMntestine?bacteria?symbionts??

豐度分布,豐度分布,樣品,豐度


AJ2的OTUs數(shù)量為502,兩個重復(fù)樣品之間AJ2的OTUs的數(shù)量較豐富,可能是由??于樣品選取、DNA提取及PC民擴增過程中存在的誤差或者是由于自身的生理狀況??不一所導(dǎo)致的結(jié)果。兩個樣品中OTU的豐度統(tǒng)計分析如圖3-3,從圖中分析可知,??兩個重復(fù)樣品中大多數(shù)的Tag數(shù)量為1%,有6條OTUs的豐度大于1%,293條的??OTUs豐度大于0.05%。選取最大豐度排名前21的OTUs進行統(tǒng)計分析,具體信息??見表3-4。??2'、1?HAJi??g?20?-?I?"AJ2????15?I??h|??客?0?Pi"i?■,??123456789?16?34??Abundance?of?化e?OTUs(%)??圖3-3樣品OTUs的豐度分布??Fig.3-3?Abundance?of?化?e?OTUs?of?bac?化?ria?in?化?e?small?intestine?of?A?口??35??

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3.2.2日本媛觸小腸細菌分類等級往釋??基于?RDP?clas細er[i巧和?GreenGene?數(shù)據(jù)庫(http://greengenes.lbl.gov)?[1巧財??Effective?Tags進行物種注釋分析。統(tǒng)計各分類水平上的Tag序列數(shù)(圖3-4),結(jié)果??表明兩個重復(fù)樣品中50%tU上的Tags序列能夠注釋到"綱"的水平,而往釋到"目"的??級別的Tags序列比例接近50%。??25000?-I??■?Domain??■Phvhini??奇20000?圍?口。。巧??M?P?口?Order??考?15000?-?■?Family??一?■?□?G^iius??i?10000?-??n?!■->.?"Speck*??之-美ill??AJl?AJ2??Sample??圖3-4兩個重復(fù)樣品中各分類水平中Tags數(shù)統(tǒng)計??Fig.3-4?Taxonomic?distributio打?of?assigned?V4?tag?sequences??3.2.3日本錢麵小腸菌群多樣性??3.2.3.1基于口分類水平上(phylum?level)的日本錢麵小腸細菌多樣性分析??高通量測序分析表明日本媛麵小腸中細菌的覆蓋度在99.99%tU上。本文選取豐??度前14的Tag序列進行分化結(jié)果表明其主要由變形菌口?Prcrteobacteria、厚壁菌口??Firmicutes、放線茜口?Actinobacteria、酸桿茜口?Acidobac1:eria、擬桿菌口?Bacteroidetes、??柔膜茜口?Tenericutes、疵微菌

【參考文獻】:
期刊論文
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碩士論文
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[2]草魚腸道菌群的變化和免疫機能的關(guān)系[D]. 李莉.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2003



本文編號:3465135

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