動(dòng)物的先天免疫中TLR（Toll-like receptor）信號(hào)通路在機(jī)體中起著舉足輕重的作用。文昌魚因擁有繁瑣有序的先天免疫系統(tǒng),同時(shí)兼有特異性免疫的雛形,逐漸成為研究動(dòng)物免疫系統(tǒng)的模型。Micro RNA（mi RNA）是生物體內(nèi)的一類具有調(diào)控功能的非編碼小RNA,已有的報(bào)道顯示mi R-92家族的多個(gè)成員均參與免疫調(diào)節(jié)。白氏文昌魚mi RNA的研究主要尚處于通過高通量測(cè)序的方法篩選免疫相關(guān)的mi RNA階段,亟待深入開展功能研究。結(jié)合文昌魚特殊的進(jìn)化地位,本論文圍繞mi R-92家族參與文昌魚TLR通路先天免疫調(diào)控開展研究,并進(jìn)一步對(duì)mi R-92家族的進(jìn)化進(jìn)行分析,獲得了以下的結(jié)果:1.本研究對(duì)mi R-92家族的系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行了分析,以白氏文昌魚的mi R-92家族為例,預(yù)測(cè)可能編碼的前體mi RNA莖環(huán)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性。對(duì)不同物種mi R-92家族序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),mi R-92a和mi R-92b在大部分物種中存在。海膽中存在的該家族成員最多,文昌魚的bbe-mi R-92b與其它物種的保守性相比較要高于bbe-mi R-92b與物種內(nèi)其他成員（bbe-mi R-92a、bbe-... 

【文章來源】：南京師范大學(xué)江蘇省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：60 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

白氏文昌魚拍攝于實(shí)驗(yàn)室Fig1.1Branchiostomabelcheriphotographedinthelaboratory

第一章緒論7等）和轉(zhuǎn)錄因子（如AP-1、NF-κB等）。TLR通路通過級(jí)聯(lián)反應(yīng)激活轉(zhuǎn)錄因子最終促進(jìn)下游細(xì)胞因子的表達(dá)，進(jìn)而參與機(jī)體抵御病原體的免疫反應(yīng)[40,41]。圖1.3人類TLR信號(hào)通路的示意圖Fig1.3SchematicdiagramofthehumanTLRsignalingpathway[42]1.5.2IKK基因的功能作用機(jī)制IKK（InhibitorOfNuclearFactorKappa-BKinase）是經(jīng)典免疫調(diào)控通路TLR通路里的關(guān)鍵基因。轉(zhuǎn)錄因子NF-κB通常由促炎信號(hào)因子激活來調(diào)節(jié)體內(nèi)的炎癥反應(yīng)。NF-κB未被激活前，穩(wěn)定的存在于細(xì)胞質(zhì)中與I-κB形成復(fù)合物；當(dāng)細(xì)胞受到刺激時(shí)，I-κB會(huì)被IKK復(fù)合物磷酸化而降解，從而暴露出NF-κB的核定位序列，進(jìn)而進(jìn)入細(xì)胞核內(nèi)行使轉(zhuǎn)錄因子的調(diào)控作用。IKK復(fù)合物包含多個(gè)亞基，主要作用是使I-κB磷酸化，IKKα和IKKβ是兩個(gè)序列高度相似的蛋白激酶，是NF-κB激活的大多數(shù)信號(hào)通路的匯聚點(diǎn)[43]。細(xì)胞內(nèi)大部分IKKα和IKKβ分子都是IKK復(fù)合物的一部分，IKK復(fù)合物還包含一個(gè)名為IKKγ或NEMO（NF-κBessentialmodulator）的調(diào)節(jié)亞基。盡管有廣泛的序列相似性，IKKα和IKKβ由于其不同的底物特性和調(diào)控模式，在很大程度上具有不同的功能。IKKβ(和IKKγ)是通過觸發(fā)促炎反應(yīng)(如TNFα或脂多糖(LPS))來快速激活NF-κB的關(guān)鍵。相比之下，IKKα在TNF家族成員的亞群中激活特定形式的NF-κB，也可能減弱IKKβ

第二章miR-92家族的生物信息學(xué)分析13圖2.1白氏文昌魚miR-92家族二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)圖Fig.2.1SecondarystructurepredictionofmiR-92familyinamphioxus.2.2.2miR-92家族在不同物種的分布基于物種的進(jìn)化地位，選擇了包括白氏文昌魚（Branchiostomabelcheri）、斑馬魚（Daniorerio）、牛（Bostaurus）、大鼠（Rattusnorvegicus）、人（Homosapiens）、非洲爪蟾蜍（Xenopuslaevis）、佛羅里達(dá)文昌魚（Branchiostomafloridae）、海七鰓鰻（Petromyzonmarinus）、玻璃海鞘（Cionaintestinalis）、豬（Susscrofa）、家犬（Canisfamiliaris）、馬（Equuscaballus）和紫海膽（Strongylocentrotuspurpuratus）在內(nèi)的13個(gè)物種（圖2.2），對(duì)各物種中miR-92家族成員的分布情況進(jìn)行了分析，結(jié)果如圖2.3所示，發(fā)現(xiàn)miR-92家族成員在從棘皮動(dòng)物到脊椎動(dòng)物miR-92a中均有分布，其中miR-92a和miR-92b在除了七鰓鰻外的所有物種中均有分布；而miR-92c、miR-92d和miR-92e則只分布在無脊椎動(dòng)物中，其中miR-92c存在于海膽、文昌魚及海鞘中，而miR-92d和miR-92e僅在海膽和海鞘中存在。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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