以�？凇⒛贤�、青島、泉州、湛江5個(gè)地理群體98尾龍頭魚(yú)為研究對(duì)象,通過(guò)PCR擴(kuò)增獲得序列長(zhǎng)度為1 046bp的線(xiàn)粒體ND2基因全序列,共檢測(cè)到變異位點(diǎn)19個(gè),其中18個(gè)單一變異位點(diǎn),1個(gè)簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)。98條序列共定義了19個(gè)單倍型,平均單倍型多樣性（Hd）為0.366±0.063 8,平均核苷酸多樣性（Pi）為0.000 427±0.000 424。群體間平均遺傳距離在0.000 228～0.000 607之間,遺傳分化指數(shù)FST值均小于0.05,群體間沒(méi)有顯著的遺傳分化。AMOVA結(jié)果顯示,龍頭魚(yú)遺傳變異主要來(lái)自于種群內(nèi)（99.68%）。單倍型系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)顯示,19個(gè)單倍型之間不存在明顯的亞種分化。整體的中性檢驗(yàn)結(jié)果均為負(fù)值且顯著偏離中性,表明5個(gè)地理群體龍頭魚(yú)歷史上曾經(jīng)歷過(guò)種群擴(kuò)張。參考ND2基因2.5%～3.6%每百萬(wàn)年的變異速率,估算出群體分化擴(kuò)張時(shí)間大致為（1.87～1.30）萬(wàn)年前的第四紀(jì)更新世晚期。 

【文章來(lái)源】：浙江海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2020,39(02)北大核心

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【部分圖文】：

基于線(xiàn)粒體ND2基因序列構(gòu)建的單倍型鄰接樹(shù)

龍頭魚(yú)Harpodon nehereus，俗稱(chēng)蝦潺、狗母魚(yú)、豆腐魚(yú)等，屬燈籠魚(yú)目Myctophiformes，龍頭魚(yú)科Harpodontidae，龍頭魚(yú)屬Harpodon，為近岸暖水性小型經(jīng)濟(jì)魚(yú)類(lèi)，主要棲息于大陸架水域下層，廣泛分布于西太平洋及印度洋海域，主要包括日本、韓國(guó)及中國(guó)沿海海域[1]，我國(guó)尤以浙江舟山及樂(lè)清一帶分布較廣且產(chǎn)量較高，主要生產(chǎn)季節(jié)龍頭魚(yú)漁獲物所占比例高達(dá)70%以上[2]。20世紀(jì)70年代以來(lái)，隨著帶魚(yú)、大黃魚(yú)、烏賊等主要漁業(yè)資源的衰退，龍頭魚(yú)等次要的經(jīng)濟(jì)種類(lèi)數(shù)量逐漸增加，并以其獨(dú)特的商業(yè)價(jià)值與營(yíng)養(yǎng)價(jià)值逐漸被人們挖掘與喜愛(ài)[3]。目前國(guó)內(nèi)外關(guān)于龍頭魚(yú)的研究多集中在外部形態(tài)特征[4]、漁業(yè)生物學(xué)特性[5-7]、資源數(shù)量分布[8-10]、攝食習(xí)性[11]和食品加工[12-15]等方面，而遺傳背景相關(guān)研究報(bào)道較少，僅見(jiàn)線(xiàn)粒體基因組全序列[16]和分子標(biāo)記技術(shù)開(kāi)發(fā)應(yīng)用[17-20]。NADH脫氫酶第二亞基(NADH dehydrogenase subunit 2,ND2)是線(xiàn)粒體電子傳遞復(fù)合體的重要組分，也是線(xiàn)粒體上13個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因之一[21]，因具有進(jìn)化速率適中且包含豐富的遺傳信息等優(yōu)點(diǎn)，目前被廣泛運(yùn)用于魚(yú)類(lèi)遺傳關(guān)系和系統(tǒng)分類(lèi)地位的研究[21-24]，顯示出其良好的分子標(biāo)記特性。了解和掌握漁業(yè)種群結(jié)構(gòu)及其變化規(guī)律，是開(kāi)展資源開(kāi)發(fā)管理的基礎(chǔ)和前提，而遺傳結(jié)構(gòu)則是種群結(jié)構(gòu)的內(nèi)在體現(xiàn)，綜合反映了種群大小組成、繁育系統(tǒng)、隔離程度及遷移格局的時(shí)空[25]。本研究以線(xiàn)粒體ND2基因?yàn)榉肿訕?biāo)記，對(duì)我國(guó)5個(gè)地理種群的龍頭魚(yú)遺傳結(jié)構(gòu)和變異進(jìn)行了比較分析，了解群體之間的遺傳分化和種群歷史動(dòng)態(tài)，旨在揭示我國(guó)近海龍頭魚(yú)種質(zhì)資源現(xiàn)狀，為保護(hù)并合理開(kāi)發(fā)利用龍頭魚(yú)資源提供參考資料。1 材料與方法

對(duì)5個(gè)群體共98尾龍頭魚(yú)線(xiàn)粒體ND2基因序列進(jìn)行比對(duì)分析，共獲得有效長(zhǎng)度為1 046 bp的龍頭魚(yú)ND2基因序列，未發(fā)現(xiàn)堿基的插入與缺失。全部位點(diǎn)中，變異位點(diǎn)(variable sites)19個(gè)，單一可變位點(diǎn)(singleton variable sites)18個(gè)，簡(jiǎn)約信息位點(diǎn)(parsimony informative sites)1個(gè)。18個(gè)堿基發(fā)生了轉(zhuǎn)換，主要發(fā)生在A-G之間；2處堿基發(fā)生顛換，均為A-T；轉(zhuǎn)換數(shù)高于顛換數(shù)，與線(xiàn)粒體基因組DNA進(jìn)化過(guò)程中轉(zhuǎn)換頻率高于顛換的規(guī)律一致[34]。4種堿基平均含量分別為：T 29.2%、C 34.9%、A 24.4%、G 11.6%。其中G堿基的含量偏低，表現(xiàn)出明顯的反G偏倚。A+T的含量為53.6%，略高于G+C的含量，與大多數(shù)脊椎動(dòng)物線(xiàn)粒體DNA堿基G+C含量位于37%～50%之間的情況一致[35]。從密碼子堿基組成情況來(lái)看，不同群體間也存在較大差異，表現(xiàn)出強(qiáng)烈的偏倚性。第1密碼子中，C、A堿基使用頻率較T、G高；第2密碼子中，堿基的使用明顯偏向T和C；第3密碼子中C堿基含量最高，而G堿基含量顯著偏低(圖2)。98尾個(gè)體共定義了19種單倍型，各單倍型分布情況如表2所示。其中Hap1出現(xiàn)頻率最高，其次為Hap3，由�？凇⑶鄭u和湛江3個(gè)群體共享，其余每種單倍型均為一個(gè)群體所獨(dú)有。5個(gè)地理群體中，單倍型類(lèi)型最多的為湛江群體(8種)，最少的是泉州群體，僅有2種單倍型(Hap1和Hap13)。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]基于線(xiàn)粒體ND2基因序列的少鱗鱚遺傳多樣性研究[J]. 鄭德育,郭易佳,楊天燕,高天翔,鄭瑤,袁冬皓,斯舒謹(jǐn).  南方水產(chǎn)科學(xué). 2019(05)
[2]基于線(xiàn)粒體Cyt b基因的龍頭魚(yú)群體遺傳結(jié)構(gòu)分析[J]. 郭易佳,楊天燕,孟瑋,韓志強(qiáng),高天翔.  水生生物學(xué)報(bào). 2019(05)
[3]溫臺(tái)漁場(chǎng)龍頭魚(yú)的生長(zhǎng)、死亡及最適開(kāi)捕規(guī)格[J]. 杜曉雪,高春霞,田思泉,劉偉成,王家啟,葉深.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2018(10)
[4]華南6水系與瀾滄江-湄公河攀鱸線(xiàn)粒體ND2基因的遺傳多樣性分析[J]. 楊喜書(shū),章群,余帆洋,呂金磊,底曉丹,邵偉軍,黃鎮(zhèn)宇,盧麗鋒.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2017(03)
[5]東海區(qū)龍頭魚(yú)數(shù)量分布與漁業(yè)生物學(xué)現(xiàn)狀分析[J]. 羅海舟,張華東,李鵬飛,周永東.  浙江海洋學(xué)院學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2012(03)
[6]浙南沿岸龍頭魚(yú)數(shù)量分布調(diào)查[J]. 楊星星,洪小括,葉海濱.  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2012(03)
[7]龍頭魚(yú)生長(zhǎng)特征及資源的可持續(xù)利用[J]. 陳玲,水柏年,董文霞.  中外企業(yè)家. 2012(06)
[8]龍頭魚(yú)魚(yú)片的加工技術(shù)工藝條件研究[J]. 陳端貞.  吉林農(nóng)業(yè). 2011(08)
[9]東海區(qū)龍頭魚(yú)攝食習(xí)性的研究[J]. 林顯鵬,朱增軍,李鵬飛.  海洋漁業(yè). 2010(03)
[10]東海區(qū)龍頭魚(yú)數(shù)量分布及其環(huán)境特征[J]. 林龍山.  上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2009(01)

碩士論文
[1]浙江南部近海龍頭魚(yú)的生物學(xué)特征及其空間分布格局[D]. 杜曉雪.上海海洋大學(xué) 2018
[2]基于線(xiàn)粒體ND2基因序列的華南地區(qū)斑鱧遺傳多樣性研究[D]. 阮燕如.暨南大學(xué) 2014
[3]中國(guó)野生烏鱧（Channa argus）遺傳多樣性分析[D]. 高志遠(yuǎn).暨南大學(xué) 2013
[4]黑龍江與長(zhǎng)江流域蒙古鲌遺傳多樣性的線(xiàn)粒體ND2基因序列分析[D]. 夏月恒.暨南大學(xué) 2013
[5]龍頭魚(yú)SSR和SRAP標(biāo)記篩選及遺傳多樣性分析[D]. 李海燕.浙江海洋學(xué)院 2012
[6]中國(guó)野生香魚(yú)（Plecoglossus altivelis）遺傳多樣性分析[D]. 樂(lè)小亮.暨南大學(xué) 2010
[7]中國(guó)東部6個(gè)大型湖泊翹嘴鲌（Culter alburnus）遺傳多樣性的線(xiàn)粒體ND2基因序列分析[D]. 伊西慶.暨南大學(xué) 2009



本文編號(hào)：3452390