微生物是水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)的重要組成部分,在水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)中的起著十分重要的作用。作為生產(chǎn)者,微生物可以利用光能或者無(wú)機(jī)物制造有機(jī)物,為水產(chǎn)養(yǎng)殖動(dòng)物提供營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)。作為分解者,微生物可以除去水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境中的殘餌、糞便、動(dòng)植物殘?bào)w等,推動(dòng)了水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)中的物質(zhì)循環(huán)和能量流動(dòng)。此外,水產(chǎn)養(yǎng)殖環(huán)境中也存在著許多致病微生物和諸多益生菌。所以,了解水產(chǎn)養(yǎng)殖系統(tǒng)中的微生物群落結(jié)構(gòu),可以為監(jiān)測(cè)養(yǎng)殖系統(tǒng)的生態(tài)狀況、開(kāi)發(fā)新的微生物資源、養(yǎng)殖病害的防治提供理論基礎(chǔ)。本研究首先采用平板菌落計(jì)數(shù)法分析了草魚(yú)養(yǎng)殖水體異養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量周年變化,結(jié)果表明,養(yǎng)殖水體中異養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量呈季節(jié)性變化,6月份和8月份水體中異養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量最高,10月份次之,4月份和12月份最低。其次采用高通量測(cè)序技術(shù)分析了草魚(yú)養(yǎng)殖水體微生物群落結(jié)構(gòu),結(jié)果表明,草魚(yú)養(yǎng)殖水體微生物群落結(jié)構(gòu)也隨季節(jié)發(fā)生變化,在門(mén)水平上,不同月份共有的優(yōu)勢(shì)菌為變形菌門(mén)（Proteobacteria）、放線(xiàn)菌門(mén)（Actinobacteria）、擬桿菌門(mén)（Bacteroidetes）、浮霉菌門(mén)（Planctomycetes）。厚壁菌門(mén)（Firmicutes）只在4月份和6月份出現(xiàn),綠彎菌... 

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【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Abstract
第1章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 草魚(yú)養(yǎng)殖現(xiàn)狀
    1.2 微生物在水產(chǎn)養(yǎng)殖中的作用
        1.2.1 促進(jìn)養(yǎng)殖動(dòng)物生長(zhǎng)
        1.2.2 凈化養(yǎng)殖水質(zhì)
        1.2.3 提高養(yǎng)殖動(dòng)物免疫力
    1.3 微生物與養(yǎng)殖病害
    1.4 養(yǎng)殖環(huán)境微生物研究主要方法
        1.4.1 高通量測(cè)序技術(shù)
        1.4.2 變性梯度凝膠電泳技術(shù)
        1.4.3 Biolog技術(shù)
    1.5 嗜水氣單胞菌
        1.5.1 嗜水氣單胞菌的致病性
        1.5.2 嗜水氣單胞菌的防治
    1.6 本論文的研究目的及意義
第2章 草魚(yú)池塘微生物群落結(jié)構(gòu)分析
    2.1 試驗(yàn)材料
        2.1.1 主要儀器
        2.1.2 培養(yǎng)基
        2.1.3 藥品試劑
    2.2 試驗(yàn)方法
        2.2.1 樣品采集
        2.2.2 水樣理化指標(biāo)測(cè)定
        2.2.3 水樣的處理
        2.2.4 異養(yǎng)細(xì)菌計(jì)數(shù)
        2.2.5 水樣宏基因組的提取
        2.2.6 細(xì)菌16S rDNA基因的PCR擴(kuò)增
        2.2.7 測(cè)序數(shù)據(jù)處理
        2.2.8 細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成分析
        2.2.9 細(xì)菌多樣性與豐富度分析
    2.3 結(jié)果
        2.3.1 水樣的理化性質(zhì)
        2.3.2 水體中異養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量變化
        2.3.3 水體微生物宏基因組提取
        2.3.4 水體微生物群落結(jié)構(gòu)組成
        2.3.5 多樣性分析和豐富度分析
    2.4 討論
    2.5 小結(jié)
第3章 嗜水氣單胞菌拮抗菌的篩選及鑒定
    3.1 試驗(yàn)材料
        3.1.1 菌種來(lái)源
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)儀器
        3.1.3 培養(yǎng)基
        3.1.4 試劑
    3.2 試驗(yàn)方法
        3.2.1 水樣和泥樣的采集
        3.2.2 樣品細(xì)菌的分離
        3.2.3 嗜水氣單胞菌拮抗菌的篩選
        3.2.4 拮抗菌鑒定
        3.2.5 生理生化實(shí)驗(yàn)
        3.2.6 分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 拮抗菌篩選結(jié)果
        3.3.2 菌株WM-1的形態(tài)學(xué)觀(guān)察
        3.3.3 菌株WM-1的生理生化特征
        3.3.4 菌株WM-1的16S rDNA分析
    3.4 討論
    3.5 小結(jié)
第4章 拮抗菌株WM-1發(fā)酵條件優(yōu)化
    4.1 試驗(yàn)材料
        4.1.1 供試菌種
        4.1.2 培養(yǎng)基
        4.1.3 主要儀器及試劑
    4.2 試驗(yàn)方法
        4.2.1 菌種活化
        4.2.2 菌株WM-1種齡確定
        4.2.3 種子液的制備
        4.2.4 無(wú)菌發(fā)酵液的制備
    4.3 抑菌活性測(cè)定
    4.4 菌株WM-1發(fā)酵培養(yǎng)基優(yōu)化
        4.4.1 碳源試驗(yàn)
        4.4.2 氮源試驗(yàn)
        4.4.3 無(wú)機(jī)鹽試驗(yàn)
        4.4.4 正交試驗(yàn)
    4.5 菌株WM-1發(fā)酵條件優(yōu)化
        4.5.1 培養(yǎng)基初始pH值對(duì)發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.5.2 培養(yǎng)溫度對(duì)發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.5.3 搖床轉(zhuǎn)速對(duì)發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.5.4 裝液量對(duì)發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.5.5 培養(yǎng)時(shí)間對(duì)發(fā)酵液抑菌活性的影響
    4.6 優(yōu)化培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件對(duì)菌株抑菌活性的影響
    4.7 數(shù)據(jù)處理
    4.8 結(jié)果與分析
        4.8.1 菌株WM-1種齡確定
        4.8.2 不同碳源對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.3 不同氮源對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.4 不同無(wú)機(jī)鹽對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.5 培養(yǎng)基成分的正交試驗(yàn)
        4.8.6 培養(yǎng)基初始pH值對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.7 不同培養(yǎng)溫度對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.8 不同裝液量對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.9 搖床轉(zhuǎn)速對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
        4.8.10 培養(yǎng)時(shí)間對(duì)菌株WM-1發(fā)酵液抑菌活性的影響
    4.9 優(yōu)化培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件對(duì)菌株抑菌活性的影響
    4.10 討論
    4.11 小結(jié)
第5章 結(jié)論與展望
    5.1 結(jié)論
    5.2 展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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[8]青石斑魚(yú)海水循環(huán)水養(yǎng)殖水體的細(xì)菌群落特征[J]. 侯婷婷,鐘志平,劉纓,劉志培.  微生物學(xué)報(bào). 2016(02)
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碩士論文
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[2]感染嗜水氣單胞菌草魚(yú)腸道菌群結(jié)構(gòu)研究[D]. 李東亮.西北農(nóng)林科技大學(xué) 2016
[3]水雍菜浮床養(yǎng)殖模式下黃顙魚(yú)腸道及環(huán)境微生物多樣性的研究[D]. 石焱.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
[4]玉米莖基腐病拮抗菌（48SJ7-1）鑒定、培養(yǎng)條件優(yōu)化及應(yīng)用的研究[D]. 耿肖兵.東北農(nóng)業(yè)大學(xué) 2015
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[6]皺紋盤(pán)鮑養(yǎng)殖水體及其消化道中細(xì)菌動(dòng)態(tài)變化特征研究[D]. 楊寶麗.上海海洋大學(xué) 2015
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[8]蝦蟹養(yǎng)殖水體中微生物群落多樣性分析[D]. 呂寧.中國(guó)海洋大學(xué) 2014
[9]團(tuán)頭魴池塘養(yǎng)殖系統(tǒng)菌群結(jié)構(gòu)及組成多樣性研究[D]. 李曉.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2014
[10]甜瓜枯萎病病原拮抗菌的篩選及利用響應(yīng)面法優(yōu)化發(fā)酵條件[D]. 鄒立飛.海南大學(xué) 2013



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