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基于COI基因序列的中國(guó)東南沿海四指馬鲅屬魚類的遺傳多樣性分析

發(fā)布時(shí)間:2021-10-19 11:23
  四指馬鲅屬(Eleutheronoma)是廣泛分布于印度-西太平洋的名貴海洋魚類,也是東南亞地區(qū)各國(guó)重要的養(yǎng)殖對(duì)象。本文在對(duì)中國(guó)東南沿海10個(gè)地理群體194尾四指馬鲅屬魚類進(jìn)行形態(tài)鑒定的基礎(chǔ)上,通過(guò)PCR擴(kuò)增技術(shù)和DNA直接測(cè)序法測(cè)定魚體線粒體COI基因序列,結(jié)合從GeneBank下載的印度洋、澳大利亞北部沿海以及中國(guó)西沙和南沙等海域的四指馬鲅屬魚類DNA同源序列共207條基因序列,進(jìn)行遺傳分析,得到如下結(jié)果:1、四指馬鲅屬魚類的分類地位四指馬鲅屬魚類在NJ樹(shù)中聚類為3個(gè)明顯譜系,根據(jù)各譜系間的遺傳距離、遺傳分化指數(shù)(Fst值)以及外部形態(tài)特征鑒定結(jié)果,結(jié)合歷史資料,確定中國(guó)東南沿海大多數(shù)四指馬鲅屬魚類為多鱗四指馬鲅(E.rhadinum);確定E. coecus Macleay為有效種,東興大部分個(gè)體、福州少數(shù)個(gè)體與澳大利亞全部個(gè)體均為本種,且中國(guó)沿海和澳大利亞北部海域E.coecus群體間存在較大的遺傳分化,或?yàn)椴煌膩喎N。東興個(gè)別樣品與印度洋海域的四指馬鲅屬魚類聚類,根據(jù)四指馬鲅(E.tetradactylus)地模標(biāo)本的地理分布情況,初步認(rèn)為這個(gè)譜系為四指馬鲅,考慮到廣闊的印度... 

【文章來(lái)源】:暨南大學(xué)廣東省 211工程院校

【文章頁(yè)數(shù)】:67 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【部分圖文】:

基于COI基因序列的中國(guó)東南沿海四指馬鲅屬魚類的遺傳多樣性分析


1-1魚類線粒體基因結(jié)構(gòu)圖(Meyer,1994)

示意圖,中國(guó)東南沿海,采樣地點(diǎn),儀器設(shè)備


-1中國(guó)東南沿海四指馬鲅屬魚類的采樣地點(diǎn)分布示意圖

網(wǎng)絡(luò)圖,譜系,單倍型,魚類


聚群現(xiàn)象,分為 3 個(gè)明顯的譜系,同時(shí)一共包含了 34 個(gè)單倍型,其中譜系 1 含有 2倍型,譜系 2 含有 11 個(gè)單倍型,譜系 3 只有 3 個(gè)單倍型。為了更清晰的顯示各個(gè)譜馬鲅屬魚類的單倍型分布情況,下面按譜系分別繪制 TCS 單倍型網(wǎng)絡(luò)支系圖。

【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
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碩士論文
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本文編號(hào):3444775

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