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七鰓鰻(Lampetra japonica)CD81的克隆表達(dá)及生物信息學(xué)分析

發(fā)布時間:2021-10-16 12:53
  CD81屬于四跨膜蛋白超家族(transmembrane4superfamily,TM4SF)成員,廣泛表達(dá)于不同的組織中,可促進(jìn)細(xì)胞自身和細(xì)胞之間的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)并能跨膜作用于某些蛋白。CD81可以參加幾種病毒辨認(rèn)與進(jìn)入細(xì)胞,調(diào)節(jié)不同細(xì)胞的一系列生理反應(yīng)過程。此外,CD81是B細(xì)胞和T細(xì)胞受體的組成成分,它們之間的相互作用會抑制信息的傳遞[1]。當(dāng)前研究的主要內(nèi)容是CD81在B-T細(xì)胞彼此作用中所起到的作用,以及分別在B細(xì)胞和T細(xì)胞中發(fā)揮的功能[2]。CD81在細(xì)胞膜上可與CD4、CD8、CD19、CD21、HLA-DR和α3β1整合素等結(jié)合,并調(diào)控丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)對宿主細(xì)胞的侵染,通過免疫作用刺激產(chǎn)生的CD81抗體能有效的阻止HCV的侵染和傳播等[3]。目前的研究主要集中在高等脊椎動物,但在相對原始的無顎脊椎動物七鰓鰻中CD81的生物學(xué)功能還不清楚。在本文中,通過對脂肪體cDNA文庫中的cDNA序列進(jìn)行查找與生物信息學(xué)分析(此文庫為本實驗室構(gòu)建的日本七鰓鰻(Lampetra japonica)文庫),得到一條與已報道的哺乳動物CD81有較高同源性... 

【文章來源】:遼寧師范大學(xué)遼寧省

【文章頁數(shù)】:70 頁

【學(xué)位級別】:碩士

【部分圖文】:

七鰓鰻(Lampetra japonica)CD81的克隆表達(dá)及生物信息學(xué)分析


總RNA電泳圖(M:DL2000Marker;1:總RNA)

序列,目的,片段,電泳


圖 2.3 CD81 目的片段 PCR 結(jié)果及篩選結(jié)果;A) CD81 PCR 電泳結(jié)果圖;M:DL2,000 Marker;1:CD81 目的片段 PCR 產(chǎn)物;B) CD81 膠收產(chǎn)物電泳結(jié)果圖;M:DL2,000 Marker;1:CD81 割膠回收 PCR 產(chǎn)物;C)菌落 PCR 后擴(kuò)增物(4 個菌落進(jìn)行平行對照);M: DL2,000 Marker;1,2,3,4:4 個菌落 PCR 擴(kuò)增 CD81 目的片段;D)重組質(zhì)粒 DNA;M:DNA Marker DL2,000;1:質(zhì)粒;Fig. 2.3 The PCR product of the fragment of CD81 and positive selection;A) The result of CD81 PCR; M: DNA Marker DL2,000; 1. CD81 PCR products; B) The result ofCD81 recovery PCR products; M: DNA Marker DL2,000; 1. CD81 recovery PCR products; C) Thproduct of the bacterial colony PCR; M:DNA Marker DL2,000; 1,2,3,4:The bacterial colony PCRfour parallel controls of the fragment of CD81; D) The Recombinant plasmid DNA; M: DNA MarkDL2,000; 1: Plasmid;(2) CD81 目的片段測序結(jié)果與驗證測序結(jié)果(附錄 B)顯示,含有起始密碼子 ATG,并且含有終止密碼子 TGA 由證明擴(kuò)增實驗已經(jīng)完成(圖 2.4)。并將實驗擴(kuò)增得到的目的序列利用 Sequench和 ORF Finder 搜索軟件來分析確定此目的片段的開放閱讀框為 702bp,編碼 233 個基酸 (圖 2.5,2.6)。

序列,起始密碼子,終止密碼,序列


圖 2.4 PCR 擴(kuò)增得到的 CD81 目的片段 (注:該序列起始密碼子 ATG 和終止密子 TAG 為斜體加粗,劃線部分為開放閱讀框)Fig.2.4 the sequence of CD81target gene were obtained by using PCR(Note: The initiation codon is bold or italic and the termination codon is bold or italic ,The openreading frame of Lampetra japonica CD81 is underlined with single straight line.)圖 2.5 用 Sequencher 軟件分析的七鰓鰻 CD81ORFFig. 2.5 The open reading frame of Lampetra japonica CD81 by using Sequencher


本文編號:3439842

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