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基于SSR的中華鱘親子鑒定和遺傳特性研究

發(fā)布時間:2021-09-05 20:54
  中華鱘(Acipenser sinensis)為典型的大型溯河產卵洄游性魚類,是我國國家一級重點保護野生動物。建立中華鱘人工養(yǎng)殖群體,實現(xiàn)全人工繁殖是人工保存中華鱘物種、實施遷地保護不可或缺的途徑。盡管中華鱘已具有一定的養(yǎng)殖規(guī)模并且人工繁殖已獲得成功,然而在中華鱘資源管理和種群保護中,種群遺傳多樣性、遺傳結構以及系譜關系等遺傳學研究一直未受到足夠的重視,人工養(yǎng)殖的中華鱘遺傳管理方面還相當薄弱。本項目將以中華鱘為研究對象,篩選適用種群遺傳研究的微衛(wèi)星分子標記;通過微衛(wèi)星標記的進一步篩選建立了親子鑒定體系,為研究中華鱘養(yǎng)殖群體的系譜結構奠定基礎;通過分析中國水產科學研究院長江水產研究所荊州太湖中華鱘試驗場(TH)、湖北恒升中華鱘馴養(yǎng)繁殖試驗場(HS)和荊州鳳凰山中華鱘養(yǎng)殖場(FHS)3個中華鱘養(yǎng)殖群體的遺傳結構,評價中華鱘人工養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性水平,為中華鱘科學有效的人工保護提供理論基礎。本研究將為中華鱘人工養(yǎng)殖群體的譜系建立和種群遺傳管理策略的制定提供理論依據(jù),也為其它鱘魚的親子鑒定及遺傳結構分析給予借鑒。主要研究結果如下:(1)通過性腺轉錄組Illumina測序獲得2838個含有微衛(wèi)... 

【文章來源】:西南大學重慶市 211工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】:83 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

基于SSR的中華鱘親子鑒定和遺傳特性研究


圖2.1中華i尋基因組DNA瓊脂糖凝膠電泳圖譜??M:?DL2000?bp?DNA?Maker;?1-4:不同中華If?個體?DNA??

微衛(wèi)星標記,圖譜,微衛(wèi)星引物,多態(tài)性


tctctccagtgcccgctctgtcccaggacaatcacactggagtcgttcgctcggagaacgtgcacgctcacgatcctcaccga??ccggaactgggcctcgcggtagaagtcatcgtggactctcctgccgacccggatctgcactgcttggttccgctg??圖2.2典型微衛(wèi)星序列??Fig.2.2?Ahpical?inicrosatellile?sequences??2.3.3多態(tài)微衛(wèi)星引物蹄選及微衛(wèi)星標記特征??隨機挑選湖北省宜昌市5個野生巾華鮮基因組DNA作為模板,用設計的165??對微衛(wèi)星引物進行PCR擴增,驗證微衛(wèi)星引物的多態(tài)性。PCR產物經(jīng)12%非變性??聚丙稀酰胺凝膠電泳和銀染法染色后,結果顯示有24個微衛(wèi)星位點擴增條帶清晰??且具有明顯多態(tài)性,擴增條帶大小與預期結果一致。為進一步確定蹄選的微衛(wèi)星??引物的穩(wěn)定性及各微衛(wèi)星標記的特征,將初步蹄選的微衛(wèi)星引物在24個野生中華??鍀個體基因組中進行PCR擴增,經(jīng)聚丙烯酰胺凝膠電泳儀進行多態(tài)性蹄選。實驗??結果得

【參考文獻】:
期刊論文
[1]江蘇8個克氏原螯蝦群體遺傳多樣性微衛(wèi)星分析[J]. 邢智珺,姜虎成,陸偉,錢照君,于宏偉,李家樂.  上海海洋大學學報. 2014(05)
[2]厚頜魴兩個野生群體遺傳多樣性分析[J]. 王瑾瑾,童金茍,張耀光,彭作剛.  水生生物學報. 2014(05)
[3]5月齡、7月齡中華鱘子二代光照偏好性研究[J]. 王恒,危起偉,李偉,劉猛,李雷,杜浩,李羅新.  水產學報. 2014(07)
[4]基于微衛(wèi)星標記對長江中上游胭脂魚增殖放流效果的評估[J]. 成為為,汪登強,危起偉,王成友,杜浩,吳金明,李雷.  中國水產科學. 2014(03)
[5]中華鱘子一代配子質量及其子二代生長特征分析[J]. 柴毅,龔進玲,杜浩,李羅新,楊文杰,危起偉.  水產學報. 2014(03)
[6]漠斑牙鲆養(yǎng)殖群體微衛(wèi)星遺傳多樣性的初步分析[J]. 覃盼,廖梅杰,徐永江,潘傳燕,李彬,王印庚,張正.  海洋科學. 2013(12)
[7]鱘魚養(yǎng)殖親魚群體遺傳多樣性分析[J]. 向燕,孔杰,周洲,張龍濤,楊興.  西南農業(yè)學報. 2013(05)
[8]達氏鱘視網(wǎng)膜早期發(fā)育及其相關機能[J]. 史玲玲,危起偉,柴毅,杜浩,李羅新,謝曉.  中國水產科學. 2013(05)
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博士論文
[1]鹽度對中華鱘生長的影響機制及中華鱘的等滲點分析[D]. 李偉.華中農業(yè)大學 2014

碩士論文
[1]達氏鱘微衛(wèi)星分離及其親子鑒定研究[D]. 駱慧.華中農業(yè)大學 2013
[2]基于微衛(wèi)星標記和線粒體cytb基因序列的鲇遺傳多樣性研究[D]. 徐丹丹.西南大學 2013
[3]5個鯽魚群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星研究[D]. 孫建幫.湖南農業(yè)大學 2006



本文編號:3386071

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