斜帶石斑魚(Epinephelus coioides)NF-κB信號(hào)通路相關(guān)基因的分子克隆及其功能初步研究
發(fā)布時(shí)間:2021-09-01 05:21
石斑魚是我國(guó)以及東南亞各國(guó)重要的海水養(yǎng)殖魚類,經(jīng)濟(jì)價(jià)值極高。隨著石斑魚養(yǎng)殖密度的增加以及海水養(yǎng)殖環(huán)境的不斷惡化,各種疾病的爆發(fā)對(duì)石斑魚養(yǎng)殖業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失。新加坡石斑魚虹彩病毒(Singapore grouper iridovirus, SGIV)是從養(yǎng)殖患病石斑魚中分離到的一種高致病性病毒病原,可導(dǎo)致石斑魚死亡率達(dá)90%以上。NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路參與調(diào)節(jié)機(jī)體免疫和發(fā)育的多種生理活動(dòng),是聯(lián)系機(jī)體天然免疫系統(tǒng)和特異性免疫系統(tǒng)的紐帶。本研究以斜帶石斑魚為對(duì)象,成功克隆鑒定了三個(gè)與NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)的基因,分別編碼石斑魚NF-κB因子抑制蛋白IκBα兩種亞型(命名為EcIκBαA和EcIκBαB)和抑制蛋白1κB激酶IKKα(命名為EcIKKα)。在此基礎(chǔ)上,本文進(jìn)一步分析了IκBα的兩種亞型在SGIV感染中的功能,為探索魚NF-κB信號(hào)通路的免疫調(diào)節(jié)功能奠定了理論基礎(chǔ)。EcIκBαA和EcIκBαB分別編碼308和318個(gè)氨基酸,其中EcIκBαA和EcIκBαB與斑馬魚的IκBαA和IκBαB分別有59%和53%的同源性。氨基酸序列比對(duì)分析結(jié)果表明,EcIκBαA和EcIκB...
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 綜述
1 免疫系統(tǒng)概述和魚類免疫系統(tǒng)研究進(jìn)展
1.1 免疫系統(tǒng)概述
1.2 魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展
2 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
2.1 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路概述
2.2 NF-κB信號(hào)通路的分子生物學(xué)基礎(chǔ)
2.3 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的激活及其調(diào)節(jié)機(jī)制
3 NF-κB與動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展
3.1 NF-κB與無(wú)脊椎動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究
3.2 NF-κB與脊椎動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究
4 病毒利用宿主的NF-KB信號(hào)通路實(shí)現(xiàn)免疫逃避和快速增值
5 石斑魚及其疾病研究
5.1 石斑魚研究進(jìn)展
5.2 石斑魚虹彩病毒研究進(jìn)展
6 研究的目的和意義
第二章 石斑魚兩種類型的IκBα的分子克隆和功能分析
1 前言
2 實(shí)驗(yàn)材料
2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.2 細(xì)胞、病毒及其它微生物病原
2.3 質(zhì)粒載體和受體菌株
2.4 細(xì)胞培養(yǎng)基及細(xì)菌培養(yǎng)基
2.5 酶類及相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)品
2.6 實(shí)驗(yàn)用試劑盒
2.7 其他溶液和試劑
2.8 常用的生物信息學(xué)分析軟件和網(wǎng)站
3 實(shí)驗(yàn)方法和步驟
3.1 GS細(xì)胞培養(yǎng)和傳代
3.2 病毒的增殖
3.3 用GS細(xì)胞測(cè)定SGIV病毒滴度
3.4 魚體組織樣品采集及免疫刺激
3.5 總RNA樣品的提取
3.6 設(shè)計(jì)RACE引物,獲得石斑魚IκBα的cDNA序列
3.7 石斑魚兩種類型的EcIκBα基因全長(zhǎng)的獲得
3.8 半定量PCR檢測(cè)石斑魚IκBα的mRNA表達(dá)譜
3.9 qPCR檢測(cè)不同刺激后石斑魚頭腎組織中IκBα表達(dá)變化
3.10 EcIκBαA和EcIκBαB亞細(xì)胞定位分析
3.11 兩種類型的EcIκBα對(duì)NF-κB因子p65和c-Rel的調(diào)節(jié)
3.12 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)SGIV復(fù)制的影響
3.13 數(shù)據(jù)分析軟件
4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.1 EcIκBαA和EcIκBαB cDNA全長(zhǎng)擴(kuò)增和序列分析
4.2 EcIκBαA和EcIκBαB基因組全長(zhǎng)擴(kuò)增和序列分析
4.3 EcIκBαA和EcIκBαB氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化關(guān)系分析
4.4 石斑魚EcIκBαA和EcIκBαB基因表達(dá)模式分析
4.5 石斑魚EcIκBαA和EcIκBαB亞細(xì)胞定位分析
4.6 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)NF-κB的調(diào)節(jié)
4.7 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)SGIV復(fù)制的影響
5 討論
6 小結(jié)
第三章 石斑魚IκB激酶EcIKKα基因的分離和功能研究
1 前言
2 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
3 實(shí)驗(yàn)方法
3.1 設(shè)計(jì)引物,利用RACE技術(shù)獲得IκBα基因序列
3.2 石斑魚IKKα基因的表達(dá)模式分析
3.3 聚肌胞苷酸(Poly I:C)免疫刺激石斑魚
3.4 生物統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析
4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.1 石斑魚IKKα基因擴(kuò)增和序列分析
4.2 EcIKKα和已報(bào)道物種的IKKα氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化關(guān)系分析
4.3 EcIKKα基因表達(dá)模式分析
4.4 polyI:C刺激后EcIKKα的變化
5 討論
6 小結(jié)
全文總結(jié)和今后工作展望
全文總結(jié)
今后可進(jìn)一步開展以下工作
參考文獻(xiàn)
略縮詞
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的和待發(fā)表的論文
攻讀碩士期間參加的學(xué)術(shù)交流活動(dòng)
致謝
本文編號(hào):3376343
【文章來(lái)源】:海南大學(xué)海南省 211工程院校
【文章頁(yè)數(shù)】:85 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
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摘要
Abstract
第一章 綜述
1 免疫系統(tǒng)概述和魚類免疫系統(tǒng)研究進(jìn)展
1.1 免疫系統(tǒng)概述
1.2 魚類免疫系統(tǒng)的研究進(jìn)展
2 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路
2.1 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路概述
2.2 NF-κB信號(hào)通路的分子生物學(xué)基礎(chǔ)
2.3 NF-κB信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路的激活及其調(diào)節(jié)機(jī)制
3 NF-κB與動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究進(jìn)展
3.1 NF-κB與無(wú)脊椎動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究
3.2 NF-κB與脊椎動(dòng)物免疫信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)研究
4 病毒利用宿主的NF-KB信號(hào)通路實(shí)現(xiàn)免疫逃避和快速增值
5 石斑魚及其疾病研究
5.1 石斑魚研究進(jìn)展
5.2 石斑魚虹彩病毒研究進(jìn)展
6 研究的目的和意義
第二章 石斑魚兩種類型的IκBα的分子克隆和功能分析
1 前言
2 實(shí)驗(yàn)材料
2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
2.2 細(xì)胞、病毒及其它微生物病原
2.3 質(zhì)粒載體和受體菌株
2.4 細(xì)胞培養(yǎng)基及細(xì)菌培養(yǎng)基
2.5 酶類及相關(guān)標(biāo)準(zhǔn)品
2.6 實(shí)驗(yàn)用試劑盒
2.7 其他溶液和試劑
2.8 常用的生物信息學(xué)分析軟件和網(wǎng)站
3 實(shí)驗(yàn)方法和步驟
3.1 GS細(xì)胞培養(yǎng)和傳代
3.2 病毒的增殖
3.3 用GS細(xì)胞測(cè)定SGIV病毒滴度
3.4 魚體組織樣品采集及免疫刺激
3.5 總RNA樣品的提取
3.6 設(shè)計(jì)RACE引物,獲得石斑魚IκBα的cDNA序列
3.7 石斑魚兩種類型的EcIκBα基因全長(zhǎng)的獲得
3.8 半定量PCR檢測(cè)石斑魚IκBα的mRNA表達(dá)譜
3.9 qPCR檢測(cè)不同刺激后石斑魚頭腎組織中IκBα表達(dá)變化
3.10 EcIκBαA和EcIκBαB亞細(xì)胞定位分析
3.11 兩種類型的EcIκBα對(duì)NF-κB因子p65和c-Rel的調(diào)節(jié)
3.12 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)SGIV復(fù)制的影響
3.13 數(shù)據(jù)分析軟件
4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.1 EcIκBαA和EcIκBαB cDNA全長(zhǎng)擴(kuò)增和序列分析
4.2 EcIκBαA和EcIκBαB基因組全長(zhǎng)擴(kuò)增和序列分析
4.3 EcIκBαA和EcIκBαB氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化關(guān)系分析
4.4 石斑魚EcIκBαA和EcIκBαB基因表達(dá)模式分析
4.5 石斑魚EcIκBαA和EcIκBαB亞細(xì)胞定位分析
4.6 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)NF-κB的調(diào)節(jié)
4.7 過(guò)表達(dá)EcIκBαA和EcIκBαB對(duì)SGIV復(fù)制的影響
5 討論
6 小結(jié)
第三章 石斑魚IκB激酶EcIKKα基因的分離和功能研究
1 前言
2 實(shí)驗(yàn)材料和試劑
3 實(shí)驗(yàn)方法
3.1 設(shè)計(jì)引物,利用RACE技術(shù)獲得IκBα基因序列
3.2 石斑魚IKKα基因的表達(dá)模式分析
3.3 聚肌胞苷酸(Poly I:C)免疫刺激石斑魚
3.4 生物統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件分析
4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析
4.1 石斑魚IKKα基因擴(kuò)增和序列分析
4.2 EcIKKα和已報(bào)道物種的IKKα氨基酸序列比對(duì)及進(jìn)化關(guān)系分析
4.3 EcIKKα基因表達(dá)模式分析
4.4 polyI:C刺激后EcIKKα的變化
5 討論
6 小結(jié)
全文總結(jié)和今后工作展望
全文總結(jié)
今后可進(jìn)一步開展以下工作
參考文獻(xiàn)
略縮詞
攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的和待發(fā)表的論文
攻讀碩士期間參加的學(xué)術(shù)交流活動(dòng)
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本文編號(hào):3376343
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