利用環(huán)境DNA技術調(diào)查入侵種克氏原螯蝦在元陽梯田的分布
發(fā)布時間:2021-08-21 08:47
元陽哈尼梯田是聞名中外的世界文化遺產(chǎn)。近年來入侵物種克氏原螯蝦(Procambarus clarkii,俗稱小龍蝦)在元陽梯田中出現(xiàn),甚至在局部泛濫成災;其種群會在梯田中掘洞,使田間墻體坍塌,嚴重影響梯田景觀。準確估計克氏原螯蝦在梯田中的分布現(xiàn)狀、監(jiān)測其擴散動態(tài)是進行有效防控的基礎。目前常用的監(jiān)測方法主要依靠蝦籠誘捕,費時費力,特別是當種群數(shù)量較低時,數(shù)據(jù)不夠準確。水生生物常常通過分泌物、糞便等向水體中排出DNA(環(huán)境DNA)。結(jié)合生物條形碼技術,環(huán)境DNA可以用來對物種進行快速檢測。本研究的目的是探究環(huán)境DNA技術是否能用于調(diào)查克氏原螯蝦在元陽哈尼梯田中的的分布。本研究利用熒光定量PCR技術(qPCR),通過測定水樣中的克氏原螯蝦的DNA濃度來推斷其分布情況。該方法流程如下:首先,利用克氏原螯蝦組織樣本DNA進行系列稀釋,確定qPCR的定量和定性檢測的有效濃度;其次,在實驗室條件下飼養(yǎng)克氏原螯蝦,利用qPCR檢測水樣中的環(huán)境DNA,繪制種群密度-環(huán)境DNA濃度的標準曲線;最后在元陽哈尼梯田景區(qū)中選擇了58塊樣地采集水樣,將環(huán)境DNA檢測結(jié)果與標準曲線進行擬合,推算克氏原螯蝦的分布和密...
【文章來源】:云南大學云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究背景
1.1.1 外來入侵種
1.1.3 入侵種克氏原螯蝦
1.1.4 克氏原螯蝦入侵元陽梯田生態(tài)系統(tǒng)
1.2 環(huán)境DNA技術(eDNA)技術
1.3 eDNA技術用于水生生態(tài)系統(tǒng)研究
1.3.1 eDNA技術和傳統(tǒng)方法的對比
1.3.2 估測生物量和種群密度
1.3.3 判斷物種組成
1.3.4 監(jiān)測入侵物種
1.3.5 監(jiān)測隱存物種和珍稀瀕危物種
1.4 TaqMan實時熒光定量PCR技術
1.5 科學問題
2 實驗材料與研究方法
2.1 實驗地點概況
2.2 實驗研究方法
2.2.1 熒光定量PCR技術檢測極值的研究
2.2.2 野外采樣和農(nóng)民訪查
2.2.3 環(huán)境DNA的提取和qPCR操作
2.2.4 傳統(tǒng)蝦籠捕蝦實驗
2.2.5 實驗室飼養(yǎng)克氏原螯蝦稀釋實驗
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 研究結(jié)果
3.1 定性閾值(LOD)和定量閾(LOQ)值的檢測結(jié)果
3.2 樣本環(huán)境DNA技術監(jiān)測與傳統(tǒng)蝦籠監(jiān)測的比較
3.3 實驗室飼養(yǎng)克氏原螯蝦稀釋實驗結(jié)果
3.4 稀釋實驗廣義線性模型與元陽哈尼梯田景區(qū)數(shù)據(jù)擬合結(jié)果
3.5 克氏原螯蝦在元陽哈尼梯田的入侵情況
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 熒光定量PCR檢測閾值
4.1.2 環(huán)境DNA監(jiān)測技術與傳統(tǒng)蝦籠監(jiān)測法的比較
4.1.3 環(huán)境DNA檢測技術中對照試驗的重要性
4.1.4 環(huán)境DNA監(jiān)測技術的改進以及使用更精確的定量PCR
4.2 結(jié)論
5 展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]克氏原螯蝦生物學特性的研究[J]. 方春林,鄧勇輝,余智杰,周智勇,王慶萍. 江西水產(chǎn)科技. 2010(03)
[2]克氏原螯蝦的入侵生態(tài)學研究進展[J]. 蔡鳳金,武正軍,何南,寧蕾,黃乘明. 生態(tài)學雜志. 2010(01)
[3]克氏原螯蝦的食性、繁殖和棲息習性研究[J]. 謝文星,董方勇,謝山,黃道明,梁友光,胡傳林. 水利漁業(yè). 2008(04)
[4]元陽哈尼梯田保護與開發(fā)模式初探[J]. 王龍,王琳,李靖. 中國農(nóng)村水利水電. 2008(04)
[5]克氏原螯蝦的生物學[J]. 劉其根,李應森,陳藍蓀. 水產(chǎn)科技情報. 2008(01)
[6]中國外來入侵物種的分布與傳入路徑分析[J]. 徐海根,強勝,韓正敏,郭建英,黃宗國,孫紅英,何舜平,丁暉,吳海榮,萬方浩. 生物多樣性. 2004(06)
[7]實時熒光定量PCR技術及其應用[J]. 歐陽松應,楊冬,歐陽紅生,馬鶴雯. 生命的化學. 2004(01)
[8]中國外來入侵生物的危害與管理對策[J]. 萬方浩,郭建英,王德輝. 生物多樣性. 2002(01)
[9]大山里塑成的奇跡——元陽哈尼梯田申報世界遺產(chǎn)[J]. 史軍超. 今日民族. 2001(04)
[10]生物入侵的生態(tài)威脅及其防除措施[J]. 王獻溥. 植物雜志. 1999(04)
本文編號:3355284
【文章來源】:云南大學云南省 211工程院校
【文章頁數(shù)】:53 頁
【學位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
1 前言
1.1 研究背景
1.1.1 外來入侵種
1.1.3 入侵種克氏原螯蝦
1.1.4 克氏原螯蝦入侵元陽梯田生態(tài)系統(tǒng)
1.2 環(huán)境DNA技術(eDNA)技術
1.3 eDNA技術用于水生生態(tài)系統(tǒng)研究
1.3.1 eDNA技術和傳統(tǒng)方法的對比
1.3.2 估測生物量和種群密度
1.3.3 判斷物種組成
1.3.4 監(jiān)測入侵物種
1.3.5 監(jiān)測隱存物種和珍稀瀕危物種
1.4 TaqMan實時熒光定量PCR技術
1.5 科學問題
2 實驗材料與研究方法
2.1 實驗地點概況
2.2 實驗研究方法
2.2.1 熒光定量PCR技術檢測極值的研究
2.2.2 野外采樣和農(nóng)民訪查
2.2.3 環(huán)境DNA的提取和qPCR操作
2.2.4 傳統(tǒng)蝦籠捕蝦實驗
2.2.5 實驗室飼養(yǎng)克氏原螯蝦稀釋實驗
2.3 數(shù)據(jù)分析
3 研究結(jié)果
3.1 定性閾值(LOD)和定量閾(LOQ)值的檢測結(jié)果
3.2 樣本環(huán)境DNA技術監(jiān)測與傳統(tǒng)蝦籠監(jiān)測的比較
3.3 實驗室飼養(yǎng)克氏原螯蝦稀釋實驗結(jié)果
3.4 稀釋實驗廣義線性模型與元陽哈尼梯田景區(qū)數(shù)據(jù)擬合結(jié)果
3.5 克氏原螯蝦在元陽哈尼梯田的入侵情況
4 討論與結(jié)論
4.1 討論
4.1.1 熒光定量PCR檢測閾值
4.1.2 環(huán)境DNA監(jiān)測技術與傳統(tǒng)蝦籠監(jiān)測法的比較
4.1.3 環(huán)境DNA檢測技術中對照試驗的重要性
4.1.4 環(huán)境DNA監(jiān)測技術的改進以及使用更精確的定量PCR
4.2 結(jié)論
5 展望
參考文獻
致謝
【參考文獻】:
期刊論文
[1]克氏原螯蝦生物學特性的研究[J]. 方春林,鄧勇輝,余智杰,周智勇,王慶萍. 江西水產(chǎn)科技. 2010(03)
[2]克氏原螯蝦的入侵生態(tài)學研究進展[J]. 蔡鳳金,武正軍,何南,寧蕾,黃乘明. 生態(tài)學雜志. 2010(01)
[3]克氏原螯蝦的食性、繁殖和棲息習性研究[J]. 謝文星,董方勇,謝山,黃道明,梁友光,胡傳林. 水利漁業(yè). 2008(04)
[4]元陽哈尼梯田保護與開發(fā)模式初探[J]. 王龍,王琳,李靖. 中國農(nóng)村水利水電. 2008(04)
[5]克氏原螯蝦的生物學[J]. 劉其根,李應森,陳藍蓀. 水產(chǎn)科技情報. 2008(01)
[6]中國外來入侵物種的分布與傳入路徑分析[J]. 徐海根,強勝,韓正敏,郭建英,黃宗國,孫紅英,何舜平,丁暉,吳海榮,萬方浩. 生物多樣性. 2004(06)
[7]實時熒光定量PCR技術及其應用[J]. 歐陽松應,楊冬,歐陽紅生,馬鶴雯. 生命的化學. 2004(01)
[8]中國外來入侵生物的危害與管理對策[J]. 萬方浩,郭建英,王德輝. 生物多樣性. 2002(01)
[9]大山里塑成的奇跡——元陽哈尼梯田申報世界遺產(chǎn)[J]. 史軍超. 今日民族. 2001(04)
[10]生物入侵的生態(tài)威脅及其防除措施[J]. 王獻溥. 植物雜志. 1999(04)
本文編號:3355284
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