鯉生長(zhǎng)性狀主效QTL育種潛力評(píng)估及其在染色體上的定位
發(fā)布時(shí)間:2021-08-17 19:35
鯉(Cyprinus carpio L.)是世界主要水產(chǎn)養(yǎng)殖種之一,全球年產(chǎn)量約370萬(wàn)噸(FAO,2011)。我國(guó)是世界最大的鯉養(yǎng)殖國(guó)和消費(fèi)國(guó),以年產(chǎn)量270萬(wàn)噸占世界總產(chǎn)量的70%以上(2011)。同時(shí),鯉也是選育出品種最多的養(yǎng)殖魚(yú)類,并且在體型、體色、鱗被等表型性狀上具有廣泛的多樣性,為開(kāi)展遺傳基礎(chǔ)及遺傳育種研究提供了豐富的實(shí)驗(yàn)材料。鯉是開(kāi)展分子育種研究較早的魚(yú)類,在基于遺傳背景的分子育種技術(shù)日臻成熟的情況下,性狀相關(guān)標(biāo)記的篩選及QTL定位研究也取得了重要的進(jìn)展,鑒定了包括體重、體長(zhǎng)、體高、體厚等生長(zhǎng)性狀,乳酸脫氫酶、過(guò)氧化物歧化酶、酸性磷酸酶和堿性磷酸酶等理化性狀,肌纖維密度、脂肪酸含量等肉質(zhì)性狀以及飼料轉(zhuǎn)化率等的QTL上千個(gè)。對(duì)這些QTL進(jìn)行遺傳潛力評(píng)估,發(fā)掘家系間、品種間共享QTL,探討指導(dǎo)分子育種的策略是QTL應(yīng)用于育種實(shí)踐的前提。本研究以鏡鯉一個(gè)全同胞家系為主線,鑒定了12個(gè)生長(zhǎng)性狀的QTL,將這些QTL標(biāo)記在5個(gè)家系中進(jìn)行驗(yàn)證并發(fā)掘共享QTL標(biāo)記,進(jìn)而將鏡鯉中的QTL標(biāo)記應(yīng)用于建鯉群體,發(fā)掘2個(gè)主養(yǎng)鯉品種共享QTL標(biāo)記,通過(guò)分析大量QTL標(biāo)記在育種群體中等位基因的分布...
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:162 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
熒光原位雜交(FISH)基本原理示意圖(摘自http://www.accessexcellence.org/AB/GG/fish.html)
上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文定的相關(guān)性。2009 年,該課題組用同樣的方法排列了大西洋鮭鱒魚(yú)功能基因的定位提供了有力的工具[143]。2012 年,MazzuC 克隆,將羅非魚(yú)連鎖群 LG1,3,5 和 7 定位在染色體上。garra 等[145]將塞內(nèi)加爾鰨(Solea senegalensis)的 10 個(gè) BAC ,其中 9 個(gè)克隆被定位在 1 個(gè)染色體對(duì)上,僅 1 個(gè)克隆在 2 個(gè)陽(yáng)性信號(hào)。2014 年,Taboada 等[146]用 BAC-FISH 的方法整合lmus maximus)的遺傳圖譜和細(xì)胞圖譜,將遺傳圖譜的 24 個(gè)連體上,借助雙色 FISH 將 LG8 和 LG18 以及 LG21 和 LG24 分上。圖譜的整合為性狀的 QTL 精細(xì)定位、比較基因組以及全導(dǎo)。
24圖 2-1 5 種不同分離模式的微衛(wèi)星標(biāo)記在部分個(gè)體中的擴(kuò)增結(jié)果 Amplification of partial samples in microsatellite markers at five segregatio圖 2-2 不同分離模式的標(biāo)記所占的比例g. 2-2 Percentage of microsatellite markers according to different segregation
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鏡鯉肌肉品質(zhì)性狀的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 吳景,鄭先虎,匡友誼,呂偉華,曹頂臣,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2013(06)
[2]建鯉生長(zhǎng)性狀QTL區(qū)間及其與鏡鯉同源性比對(duì)[J]. 顧穎,魯翠云,張曉峰,李超,俞菊華,孫效文. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2013(06)
[3]熒光原位雜交技術(shù)在魚(yú)類基因定位研究中的應(yīng)用[J]. 魯翠云,張明昭,李超,鄭先虎,邱高峰,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2013(04)
[4]鏡鯉(Cyprinus carpio)肌間刺數(shù)量微衛(wèi)星標(biāo)記篩選與相關(guān)性分析[J]. 馬吉敏,匡友誼,鄭先虎,曹頂臣,呂偉華,常瑜,周丹,杜科,孫效文. 動(dòng)物學(xué)研究. 2013(04)
[5]用于目標(biāo)序列染色體定位的鏡鯉BAC-FISH體系構(gòu)建[J]. 鄧海霞,趙紫霞,徐鵬,李艷,王書(shū),孫效文. 水生生物學(xué)報(bào). 2013(03)
[6]基于整合圖譜的鯉生長(zhǎng)相關(guān)性狀QTL的分布及變異規(guī)律[J]. 鄭先虎,匡友誼,呂偉華,曹頂臣,張曉峰,李超,魯翠云,孫效文. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2013(02)
[7]一種雜交鯉四種經(jīng)濟(jì)性狀的QTL定位分析[J]. 呂偉華,匡友誼,鄭先虎,曹頂臣,李超,魯翠云,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]幾種鯉魚(yú)品種魚(yú)種階段生長(zhǎng)對(duì)比試驗(yàn)[J]. 高杰,彭本初,鄭水平. 科學(xué)養(yǎng)魚(yú). 2012(12)
[9]牙鲆遺傳作圖及生長(zhǎng)性狀QTL定位[J]. 牛余澤,廖小林,宋文濤,王磊,趙永偉,高峰濤,陳松林. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(11)
[10]雜交秈稻子粒QTL標(biāo)記遺傳距離與粒重、粒重雜種優(yōu)勢(shì)的相關(guān)性[J]. 游書(shū)梅,曹應(yīng)江,鄭家奎,蔣開(kāi)鋒,張濤,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,羅婧. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(06)
博士論文
[1]鯉連鎖圖譜及生長(zhǎng)、肉質(zhì)性狀QTL定位研究[D]. 鄭先虎.上海海洋大學(xué) 2012
本文編號(hào):3348365
【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市
【文章頁(yè)數(shù)】:162 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【部分圖文】:
熒光原位雜交(FISH)基本原理示意圖(摘自http://www.accessexcellence.org/AB/GG/fish.html)
上海海洋大學(xué)博士學(xué)位論文定的相關(guān)性。2009 年,該課題組用同樣的方法排列了大西洋鮭鱒魚(yú)功能基因的定位提供了有力的工具[143]。2012 年,MazzuC 克隆,將羅非魚(yú)連鎖群 LG1,3,5 和 7 定位在染色體上。garra 等[145]將塞內(nèi)加爾鰨(Solea senegalensis)的 10 個(gè) BAC ,其中 9 個(gè)克隆被定位在 1 個(gè)染色體對(duì)上,僅 1 個(gè)克隆在 2 個(gè)陽(yáng)性信號(hào)。2014 年,Taboada 等[146]用 BAC-FISH 的方法整合lmus maximus)的遺傳圖譜和細(xì)胞圖譜,將遺傳圖譜的 24 個(gè)連體上,借助雙色 FISH 將 LG8 和 LG18 以及 LG21 和 LG24 分上。圖譜的整合為性狀的 QTL 精細(xì)定位、比較基因組以及全導(dǎo)。
24圖 2-1 5 種不同分離模式的微衛(wèi)星標(biāo)記在部分個(gè)體中的擴(kuò)增結(jié)果 Amplification of partial samples in microsatellite markers at five segregatio圖 2-2 不同分離模式的標(biāo)記所占的比例g. 2-2 Percentage of microsatellite markers according to different segregation
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]鏡鯉肌肉品質(zhì)性狀的微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 吳景,鄭先虎,匡友誼,呂偉華,曹頂臣,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2013(06)
[2]建鯉生長(zhǎng)性狀QTL區(qū)間及其與鏡鯉同源性比對(duì)[J]. 顧穎,魯翠云,張曉峰,李超,俞菊華,孫效文. 中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2013(06)
[3]熒光原位雜交技術(shù)在魚(yú)類基因定位研究中的應(yīng)用[J]. 魯翠云,張明昭,李超,鄭先虎,邱高峰,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)雜志. 2013(04)
[4]鏡鯉(Cyprinus carpio)肌間刺數(shù)量微衛(wèi)星標(biāo)記篩選與相關(guān)性分析[J]. 馬吉敏,匡友誼,鄭先虎,曹頂臣,呂偉華,常瑜,周丹,杜科,孫效文. 動(dòng)物學(xué)研究. 2013(04)
[5]用于目標(biāo)序列染色體定位的鏡鯉BAC-FISH體系構(gòu)建[J]. 鄧海霞,趙紫霞,徐鵬,李艷,王書(shū),孫效文. 水生生物學(xué)報(bào). 2013(03)
[6]基于整合圖譜的鯉生長(zhǎng)相關(guān)性狀QTL的分布及變異規(guī)律[J]. 鄭先虎,匡友誼,呂偉華,曹頂臣,張曉峰,李超,魯翠云,孫效文. 中國(guó)科學(xué):生命科學(xué). 2013(02)
[7]一種雜交鯉四種經(jīng)濟(jì)性狀的QTL定位分析[J]. 呂偉華,匡友誼,鄭先虎,曹頂臣,李超,魯翠云,孫效文. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]幾種鯉魚(yú)品種魚(yú)種階段生長(zhǎng)對(duì)比試驗(yàn)[J]. 高杰,彭本初,鄭水平. 科學(xué)養(yǎng)魚(yú). 2012(12)
[9]牙鲆遺傳作圖及生長(zhǎng)性狀QTL定位[J]. 牛余澤,廖小林,宋文濤,王磊,趙永偉,高峰濤,陳松林. 水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2012(11)
[10]雜交秈稻子粒QTL標(biāo)記遺傳距離與粒重、粒重雜種優(yōu)勢(shì)的相關(guān)性[J]. 游書(shū)梅,曹應(yīng)江,鄭家奎,蔣開(kāi)鋒,張濤,楊莉,楊乾華,萬(wàn)先齊,羅婧. 植物遺傳資源學(xué)報(bào). 2012(06)
博士論文
[1]鯉連鎖圖譜及生長(zhǎng)、肉質(zhì)性狀QTL定位研究[D]. 鄭先虎.上海海洋大學(xué) 2012
本文編號(hào):3348365
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