日本囊對蝦（Marsupenaeus japonicus）是中國沿海地區(qū)最具有經濟價值的蝦類之一。低鹽和高亞硝酸鹽氮是環(huán)境脅迫的兩個重要因子,與蝦類的生長、存活和免疫調節(jié)密切相關。研究低鹽和高亞硝酸鹽氮脅迫日本囊對蝦的分子機制,為日本囊對蝦的健康養(yǎng)殖提供重要理論依據(jù)。本研究對低鹽和高亞硝酸鹽氮脅迫下的日本囊對蝦進行轉錄組分析,并篩選出一個與抗逆性密切相關的海藻糖6-磷酸合成酶（TPS）基因進行克隆,用RNA干擾技術對其抗逆和免疫功能進行初步的研究。主要研究結果如下:（1）低鹽脅迫日本囊對蝦轉錄組分析:在鹽度為8的低鹽脅迫下,分別于6、12、24、48和96h取日本囊對蝦的肝胰腺以及對照組的肝胰腺進行轉錄組測序。我們獲得88890960–105130044個Clean Reads,數(shù)據(jù)量為6.68G-7.88G,G30為93.34-94.53%,利用Trinity組裝后獲得48807條unigenes,N50為1746bp。與對照組相比,分別得到811、589、1095、745和875個差異基因（DEGs）。我們對DEGs進行注釋,得到與滲透調節(jié)、代謝和免疫相關的通路和基因。并通過q P... 

【文章來源】：廣東海洋大學廣東省

【文章頁數(shù)】：102 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

拼接得到的轉錄本unigenes長度分布

廣東海洋大學碩士學位論文13圖2-1拼接得到的轉錄本unigenes長度分布Fig.2-1Unigeneslengthdistributionofsplicedtranscripts圖2-2拼接轉錄本BUSCO評估結果圖（不同的顏色分別代表不同的拼接轉錄本類型）Figure2-2BUSCOevaluationresultsofsplicingtranscript（differentcolorsrepresentdifferentsplicingtranscripttypes）2.2.2基因的功能注釋將拼接得到的48807條unigenes通過NR，NT，KO，Swiss-prot，PFAM，GO和KOG七大數(shù)據(jù)庫進行基因功能注釋，注釋到的基因數(shù)量（比例）分別為27635（56.62%）、23384（47.91%）、3536（7.24%）、24267（49.72%）、26763（54.83%）、26763（54.83%）和9919（20.32%）條。在7個數(shù)據(jù)庫中至少注釋到一個數(shù)據(jù)庫的unigenes數(shù)量為36707條，占總數(shù)的75.20%，而在7個數(shù)據(jù)庫都注釋到的unigenes

廣東海洋大學碩士學位論文15圖2-3NR庫比對上的物種分布圖Figure2-3SpeciesdistributiononNRpoolratiopair圖2-4GO注釋分類統(tǒng)計圖Figure2-4GOannotationclassificationstatistics圖2-5KOG注釋分類統(tǒng)計圖Figure2-5ClassificationstatisticsofKOGnotes

【參考文獻】：
期刊論文
[1]凡納濱對蝦6-磷酸海藻糖合成酶在抗高溫脅迫中的表達特征[J]. 胡利杰,李旭鵬,孟憲紅,欒生,羅坤,隋娟,陳寶龍,曹寶祥,曹家旺,孔杰.  漁業(yè)科學進展. 2020(02)
[2]白背飛虱海藻糖合成酶基因調控幾丁質合成的功能[J]. 張道偉,余亞婭,潘碧瑩,康奎,曾伯平,陳靜,唐斌.  中國農業(yè)科學. 2019(19)
[3]亞硝酸鹽氮對日本囊對蝦幼蝦的急性毒性研究[J]. 陳亭君,劉建勇,申玉春,栗志民.  漁業(yè)現(xiàn)代化. 2019(03)
[4]pH對日本囊對蝦的急性毒性初步研究[J]. 梁彩鳳,劉建勇.  漁業(yè)現(xiàn)代化. 2019(01)
[5]鹽度對日本囊對蝦生長性能影響[J]. 蔣湘,謝妙,劉永奎,曾鳳仙,鄭靜靜,劉建勇.  水產養(yǎng)殖. 2017(07)
[6]RNAi作用機制及應用研究進展[J]. 馮小艷,張樹珍.  生物技術通報. 2017(05)
[7]RNAi在甲殼動物中的研究進展[J]. 李法君,付春鵬,李明爽,李群峰,傅洪拓.  水生生物學報. 2017(02)
[8]德國小蠊兩個海藻糖合成酶基因的克隆、組織分布及溫度誘導表達分析[J]. 陳靜,張道偉.  昆蟲學報. 2015(10)
[9]日本囊對蝦耐熱性狀及其與凡納濱對蝦、脊尾白蝦的比較[J]. 李麗君,宋曉紅,林瑤瓊,鐘聲平,喬瑩,毛勇,蘇永全,王軍.  中國水產科學. 2015(03)
[10]轉錄組學技術在水產動物研究中的運用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇.  水產學報. 2015(04)

博士論文
[1]日本沼蝦免疫應答相關基因的篩選與鑒定[D]. 于杰倫.山東農業(yè)大學 2019
[2]環(huán)境脅迫對羅氏沼蝦和凡納濱對蝦行為、生長及生理活動的影響[D]. 于赫男.暨南大學 2007
[3]環(huán)境因子對甲殼動物滲透調節(jié)與免疫力的影響[D]. 潘魯青.中國海洋大學 2004

碩士論文
[1]日本囊對蝦生長、存活及抗逆性狀遺傳參數(shù)的估計[D]. 鄭靜靜.廣東海洋大學 2017
[2]中華絨螯蟹蛻皮激素調節(jié)蛋白表達、純化及鑒定[D]. 陳潘海.遼寧師范大學 2013
[3]亞硝酸鹽和氨氮對紅螯光殼螯蝦生理生化的影響[D]. 呂曉燕.華東師范大學 2011
[4]高位精養(yǎng)模式日本囊對蝦生長及浮游生物演替規(guī)律[D]. 李婷.廣東海洋大學 2011
[5]環(huán)境脅迫對魚類生理機能影響的初步研究[D]. 洪磊.中國海洋大學 2004



本文編號：3342762