日本囊對(duì)蝦（Marsupenaeus japonicus）是中國(guó)沿海地區(qū)最具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值的蝦類之一。低鹽和高亞硝酸鹽氮是環(huán)境脅迫的兩個(gè)重要因子,與蝦類的生長(zhǎng)、存活和免疫調(diào)節(jié)密切相關(guān)。研究低鹽和高亞硝酸鹽氮脅迫日本囊對(duì)蝦的分子機(jī)制,為日本囊對(duì)蝦的健康養(yǎng)殖提供重要理論依據(jù)。本研究對(duì)低鹽和高亞硝酸鹽氮脅迫下的日本囊對(duì)蝦進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組分析,并篩選出一個(gè)與抗逆性密切相關(guān)的海藻糖6-磷酸合成酶（TPS）基因進(jìn)行克隆,用RNA干擾技術(shù)對(duì)其抗逆和免疫功能進(jìn)行初步的研究。主要研究結(jié)果如下:（1）低鹽脅迫日本囊對(duì)蝦轉(zhuǎn)錄組分析:在鹽度為8的低鹽脅迫下,分別于6、12、24、48和96h取日本囊對(duì)蝦的肝胰腺以及對(duì)照組的肝胰腺進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序。我們獲得88890960–105130044個(gè)Clean Reads,數(shù)據(jù)量為6.68G-7.88G,G30為93.34-94.53%,利用Trinity組裝后獲得48807條unigenes,N50為1746bp。與對(duì)照組相比,分別得到811、589、1095、745和875個(gè)差異基因（DEGs）。我們對(duì)DEGs進(jìn)行注釋,得到與滲透調(diào)節(jié)、代謝和免疫相關(guān)的通路和基因。并通過(guò)q P... 

【文章來(lái)源】：廣東海洋大學(xué)廣東省

【文章頁(yè)數(shù)】：102 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

拼接得到的轉(zhuǎn)錄本unigenes長(zhǎng)度分布

廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文13圖2-1拼接得到的轉(zhuǎn)錄本unigenes長(zhǎng)度分布Fig.2-1Unigeneslengthdistributionofsplicedtranscripts圖2-2拼接轉(zhuǎn)錄本BUSCO評(píng)估結(jié)果圖（不同的顏色分別代表不同的拼接轉(zhuǎn)錄本類型）Figure2-2BUSCOevaluationresultsofsplicingtranscript（differentcolorsrepresentdifferentsplicingtranscripttypes）2.2.2基因的功能注釋將拼接得到的48807條unigenes通過(guò)NR，NT，KO，Swiss-prot，PFAM，GO和KOG七大數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行基因功能注釋，注釋到的基因數(shù)量（比例）分別為27635（56.62%）、23384（47.91%）、3536（7.24%）、24267（49.72%）、26763（54.83%）、26763（54.83%）和9919（20.32%）條。在7個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)中至少注釋到一個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)的unigenes數(shù)量為36707條，占總數(shù)的75.20%，而在7個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)都注釋到的unigenes

廣東海洋大學(xué)碩士學(xué)位論文15圖2-3NR庫(kù)比對(duì)上的物種分布圖Figure2-3SpeciesdistributiononNRpoolratiopair圖2-4GO注釋分類統(tǒng)計(jì)圖Figure2-4GOannotationclassificationstatistics圖2-5KOG注釋分類統(tǒng)計(jì)圖Figure2-5ClassificationstatisticsofKOGnotes

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]凡納濱對(duì)蝦6-磷酸海藻糖合成酶在抗高溫脅迫中的表達(dá)特征[J]. 胡利杰,李旭鵬,孟憲紅,欒生,羅坤,隋娟,陳寶龍,曹寶祥,曹家旺,孔杰.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2020(02)
[2]白背飛虱海藻糖合成酶基因調(diào)控幾丁質(zhì)合成的功能[J]. 張道偉,余亞婭,潘碧瑩,康奎,曾伯平,陳靜,唐斌.  中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué). 2019(19)
[3]亞硝酸鹽氮對(duì)日本囊對(duì)蝦幼蝦的急性毒性研究[J]. 陳亭君,劉建勇,申玉春,栗志民.  漁業(yè)現(xiàn)代化. 2019(03)
[4]pH對(duì)日本囊對(duì)蝦的急性毒性初步研究[J]. 梁彩鳳,劉建勇.  漁業(yè)現(xiàn)代化. 2019(01)
[5]鹽度對(duì)日本囊對(duì)蝦生長(zhǎng)性能影響[J]. 蔣湘,謝妙,劉永奎,曾鳳仙,鄭靜靜,劉建勇.  水產(chǎn)養(yǎng)殖. 2017(07)
[6]RNAi作用機(jī)制及應(yīng)用研究進(jìn)展[J]. 馮小艷,張樹珍.  生物技術(shù)通報(bào). 2017(05)
[7]RNAi在甲殼動(dòng)物中的研究進(jìn)展[J]. 李法君,付春鵬,李明爽,李群峰,傅洪拓.  水生生物學(xué)報(bào). 2017(02)
[8]德國(guó)小蠊兩個(gè)海藻糖合成酶基因的克隆、組織分布及溫度誘導(dǎo)表達(dá)分析[J]. 陳靜,張道偉.  昆蟲學(xué)報(bào). 2015(10)
[9]日本囊對(duì)蝦耐熱性狀及其與凡納濱對(duì)蝦、脊尾白蝦的比較[J]. 李麗君,宋曉紅,林瑤瓊,鐘聲平,喬瑩,毛勇,蘇永全,王軍.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2015(03)
[10]轉(zhuǎn)錄組學(xué)技術(shù)在水產(chǎn)動(dòng)物研究中的運(yùn)用[J]. 羅輝,葉華,肖世俊,鄭曙明,王曉清,王志勇.  水產(chǎn)學(xué)報(bào). 2015(04)

博士論文
[1]日本沼蝦免疫應(yīng)答相關(guān)基因的篩選與鑒定[D]. 于杰倫.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2019
[2]環(huán)境脅迫對(duì)羅氏沼蝦和凡納濱對(duì)蝦行為、生長(zhǎng)及生理活動(dòng)的影響[D]. 于赫男.暨南大學(xué) 2007
[3]環(huán)境因子對(duì)甲殼動(dòng)物滲透調(diào)節(jié)與免疫力的影響[D]. 潘魯青.中國(guó)海洋大學(xué) 2004

碩士論文
[1]日本囊對(duì)蝦生長(zhǎng)、存活及抗逆性狀遺傳參數(shù)的估計(jì)[D]. 鄭靜靜.廣東海洋大學(xué) 2017
[2]中華絨螯蟹蛻皮激素調(diào)節(jié)蛋白表達(dá)、純化及鑒定[D]. 陳潘海.遼寧師范大學(xué) 2013
[3]亞硝酸鹽和氨氮對(duì)紅螯光殼螯蝦生理生化的影響[D]. 呂曉燕.華東師范大學(xué) 2011
[4]高位精養(yǎng)模式日本囊對(duì)蝦生長(zhǎng)及浮游生物演替規(guī)律[D]. 李婷.廣東海洋大學(xué) 2011
[5]環(huán)境脅迫對(duì)魚類生理機(jī)能影響的初步研究[D]. 洪磊.中國(guó)海洋大學(xué) 2004



本文編號(hào)：3342762