紫菜核糖體rDNA基因結(jié)構(gòu)多樣性分析
發(fā)布時間:2021-07-07 18:47
紫菜是我國重要的海洋經(jīng)濟(jì)作物,是潮間帶藻類的模式物種。生活史包括大型配子體(葉狀體)世代和微型孢子體(絲狀體)世代,繁殖方式包括無性繁殖和有性繁殖兩種,這種特殊而又復(fù)雜的生活史使得紫菜在進(jìn)化過程中具有較高的變異度。核糖體rDNA基因作為一種分子標(biāo)記用于研究種的分類及遺傳多樣性被廣泛接受,但最近研究發(fā)現(xiàn)許多真核生物的rDNA基因結(jié)構(gòu)在種間及種內(nèi)存在變異,甚至在個體內(nèi)部ITS序列也存在多樣性。這種變異及多態(tài)性對于正確解釋物種的系統(tǒng)發(fā)生和遺傳結(jié)構(gòu)顯得尤為重要。本研究以條斑紫菜和壇紫菜為研究對象,對兩個物種野生群體和養(yǎng)殖群體的核糖體rDNA在基因結(jié)構(gòu)的多樣性進(jìn)行了分析,取得以下結(jié)果:1.條斑紫菜養(yǎng)殖群體30個個體和野生群體27株個體的18SrDNA均不包含內(nèi)含子序列,ITS序列未呈現(xiàn)明顯的插入/缺失,EcoRV帶型沒有呈現(xiàn)多樣性,表明所選用的來自不同品系的個體間及個體內(nèi)18SrDNA-ITS-5.8SrDNA基因結(jié)構(gòu)單一。其二級結(jié)構(gòu)能使18SrRNA的3’端、5.8SrRNA、28SrRNA5’端,三部分成熟端互相靠近,形成一個核心結(jié)構(gòu)。2.壇紫菜野生群體18SrDNA-ITS-5.8SrDN...
【文章來源】:中國海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 紫菜的生物學(xué)研究進(jìn)展
1.1 紫菜的分類
1.2 紫菜的繁殖和生活史
2. 紫菜遺傳多樣性研究進(jìn)展
2.1 分子標(biāo)記技術(shù)在紫菜遺傳多樣性研究中的應(yīng)用
2.2 紫菜核糖體 rDNA 在遺傳多樣性分析中的應(yīng)用
2.3 ITS 區(qū)域的多態(tài)性研究
3. 紫菜 18SrDNAⅠ型基因內(nèi)含子研究進(jìn)展
3.1 Ⅰ型基因內(nèi)含子特性
3.2 Ⅰ型內(nèi)含子的結(jié)構(gòu)
3.3 Ⅰ型內(nèi)含子自我剪接
3.4 Ⅰ型內(nèi)含子的移動機(jī)制
3.5 紫菜中內(nèi)含子的類型
4. 本研究的目的和意義
第二章 紫菜核糖體 rDNA18S-ITS-5.8S 基因結(jié)構(gòu)分析
1 材料
1.1 樣品來源
1.2 主要試劑及配制方法
1.3 引物設(shè)計(jì)
2 方法
2.1 DNA 提取及質(zhì)量檢測
2.2 18S-ITS-5.8S 片段的擴(kuò)增
2.3 目的片段的回收
2.4 18S-ITS-5.8S 片段的克隆
2.5 18S-ITS-5.8S 酶切多態(tài)性檢測
3 結(jié)果與分析
3.1 條斑紫菜 18S rDNA-ITS-5.8SrDNA 基因結(jié)構(gòu)分析
3.2 壇紫菜 18S rDNA-ITS-5.8SrDNA 基因結(jié)構(gòu)分析
4 討論
4.1 紫菜核糖體 18S rDNA 基因結(jié)構(gòu)
4.2 紫菜 ITS 序列的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
本文編號:3270170
【文章來源】:中國海洋大學(xué)山東省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:61 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
Abstract
第一章 文獻(xiàn)綜述
1 紫菜的生物學(xué)研究進(jìn)展
1.1 紫菜的分類
1.2 紫菜的繁殖和生活史
2. 紫菜遺傳多樣性研究進(jìn)展
2.1 分子標(biāo)記技術(shù)在紫菜遺傳多樣性研究中的應(yīng)用
2.2 紫菜核糖體 rDNA 在遺傳多樣性分析中的應(yīng)用
2.3 ITS 區(qū)域的多態(tài)性研究
3. 紫菜 18SrDNAⅠ型基因內(nèi)含子研究進(jìn)展
3.1 Ⅰ型基因內(nèi)含子特性
3.2 Ⅰ型內(nèi)含子的結(jié)構(gòu)
3.3 Ⅰ型內(nèi)含子自我剪接
3.4 Ⅰ型內(nèi)含子的移動機(jī)制
3.5 紫菜中內(nèi)含子的類型
4. 本研究的目的和意義
第二章 紫菜核糖體 rDNA18S-ITS-5.8S 基因結(jié)構(gòu)分析
1 材料
1.1 樣品來源
1.2 主要試劑及配制方法
1.3 引物設(shè)計(jì)
2 方法
2.1 DNA 提取及質(zhì)量檢測
2.2 18S-ITS-5.8S 片段的擴(kuò)增
2.3 目的片段的回收
2.4 18S-ITS-5.8S 片段的克隆
2.5 18S-ITS-5.8S 酶切多態(tài)性檢測
3 結(jié)果與分析
3.1 條斑紫菜 18S rDNA-ITS-5.8SrDNA 基因結(jié)構(gòu)分析
3.2 壇紫菜 18S rDNA-ITS-5.8SrDNA 基因結(jié)構(gòu)分析
4 討論
4.1 紫菜核糖體 18S rDNA 基因結(jié)構(gòu)
4.2 紫菜 ITS 序列的應(yīng)用
參考文獻(xiàn)
致謝
個人簡歷
本文編號:3270170
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