卵形鯧鲹（Trachinotus ovatus）肉質(zhì)鮮美,生長速度快,可攝食人工配合飼料,是我國熱帶、亞熱帶海域重要的網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚類之一。然而近年來由于病害頻發(fā),給卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)造成了極大的經(jīng)濟(jì)損失。因此,研究卵形鯧鲹免疫基因與抗病性狀關(guān)聯(lián)性,確定免疫分子標(biāo)記,建立免疫防控技術(shù),對支撐卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展具有重要意義。本研究從實驗室前期測序獲得的卵形鯧鲹基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中獲取了主要組織相容性復(fù)合體Ⅱβ（majorhistocompatibility complexⅡβ,MHCⅡβ）和γ-干擾素誘導(dǎo)的溶酶體巰基還原酶（interferon-γ-inducible lysosomal thiol reductase,GILT）的部分序列,利用RACE技術(shù)克隆獲得MHCⅡβ和GILT基因cDNA全序列,以此為基礎(chǔ)比對基因組數(shù)據(jù)庫,獲得了MHCⅡβ和GILT基因組全序列,分析了其組織表達(dá)和細(xì)菌感染前后表達(dá)譜特征,篩選了基因多態(tài)性位點,分析了基因多態(tài)性與抗菌性狀的相關(guān)性,取得的主要結(jié)果如下:一、卵形鯧鲹MHCⅡβ表達(dá)調(diào)控及其基因多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析結(jié)論:ToMHCⅡβcDNA全長... 

【文章來源】：上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁數(shù)】：90 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
前言
    1.1 卵形鯧鲹簡介
        1.1.1 卵形鯧鲹形態(tài)特征及生活習(xí)性簡介
        1.1.2 卵形鯧鲹研究進(jìn)展
    1.2 魚類的免疫防御
        1.2.1 免疫器官和組織
        1.2.2 免疫細(xì)胞
        1.2.3 體液免疫因子
    1.3 主要組織相容性復(fù)合體(MHC)
        1.3.1 主要組織相容性復(fù)合體簡介
        1.3.2 MHC基因功能結(jié)構(gòu)
    1.4 MHC基因的遺傳變異與魚類抗病性
        1.4.1 MHC基因的遺傳變異
    1.5 Γ-干擾素誘導(dǎo)的溶酶體巰基還原酶(GILT)
        1.5.1 溶酵體簡介
        1.5.2 Γ-干擾素簡介
        1.5.3 GILT的發(fā)現(xiàn)
        1.5.4 GILT在MHCⅡ類抗原加工中的作用
        1.5.5 GILT的活性特征
        1.5.6 GILT研究概況和發(fā)展趨勢
    1.6 研究目的、意義及技術(shù)路線
        1.6.1 研究目的與意義
        1.6.2 技術(shù)方案
第二章 卵形鯧鲹MHCⅡB基因的表達(dá)調(diào)控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析
    2.1 實驗材料
        2.1.1 實驗菌種
        2.1.2 實驗用魚
        2.1.3 實驗儀器
        2.1.4 實驗試劑與配制
    2.2 實驗用品預(yù)處理
        2.2.1 實驗動物處理及取樣
        2.2.2 卵形鯧鲹總RNA提取
        2.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        2.2.4 TOMHCⅡB基因CDNA全長的克隆
        2.2.5 TOMHCⅡΒ 基因序列分析
        2.2.6 TOMHCⅡΒ 基因表達(dá)分析
    2.3 TOMHCⅡΒ 基因多態(tài)性
        2.3.1 卵形鯧鲹基因組DNA的提取
        2.3.2 基因克隆鏈接轉(zhuǎn)化
    2.4 結(jié)果與分析
        2.4.1 TOMHCⅡΒ 的CDNA序列特征
        2.4.2 TOMHCⅡΒ 基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.4.3 MHCⅡΒ 基因組結(jié)構(gòu)比較
        2.4.4 TOMHCⅡΒMRNA組織表達(dá)分析
        2.4.5 TOMHCⅡΒ MRNA的時空表達(dá)
        2.4.6 美人魚發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        2.4.7 DNA提取結(jié)果和測序分析
        2.4.8 TOMHCⅡΒ 基因的多態(tài)性分析
        2.4.9 TOMHCⅡΒ 基因與美人魚發(fā)光桿菌易感性/抗性的關(guān)聯(lián)性分析
    2.5 討論
第三章 卵形鯧鲹GILT基因的表達(dá)調(diào)控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析
    3.1 實驗材料
        3.1.1 實驗菌種
        3.1.2 實驗用魚
        3.1.3 實驗儀器
        3.1.4 實驗試劑與配制
    3.2 實驗用品預(yù)處理
        3.2.1 實驗動物處理及取樣
        3.2.2 總RNA提取卵形鯧鲹RNA的提取
        3.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        3.2.4 TOGILT基因CDNA全長的克隆
        3.2.5 TOGILT基因序列分析
        3.2.6 TOGILT基因表達(dá)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 TOGILT的DNA序列特征
        3.3.2 TOGILT基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
        3.3.3 TOGILT基因組結(jié)構(gòu)比較
        3.3.4 TOGILT MRNA組織表達(dá)分析
        3.3.5 TOGILT MRNA的時空表達(dá)
        3.3.6 美人魚發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        3.3.7 DNA提取結(jié)果和測序分析
        3.3.8 TOGILT基因SNP位點分析
        3.3.9 TOGILT基因型與美人魚發(fā)光桿菌易感性/抗性的關(guān)聯(lián)性分析
    3.4 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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碩士論文
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[3]草魚MHC II B和組織蛋白酶D基因的克隆、表達(dá)及多態(tài)性分析[D]. 董忠典.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]尼羅羅非魚MHCII類基因的克隆與表達(dá)特征及多態(tài)性研究[D]. 龐紀(jì)彩.上海海洋大學(xué) 2013
[5]羅非魚T淋巴細(xì)胞幾種標(biāo)志基因的克隆及表達(dá)研究[D]. 劉冬.西南大學(xué) 2012
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本文編號：3255284