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卵形鯧鲹MHCⅡβ和GILT基因的表達(dá)調(diào)控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時(shí)間:2021-06-28 23:53
  卵形鯧鲹(Trachinotus ovatus)肉質(zhì)鮮美,生長(zhǎng)速度快,可攝食人工配合飼料,是我國(guó)熱帶、亞熱帶海域重要的網(wǎng)箱養(yǎng)殖魚(yú)類之一。然而近年來(lái)由于病害頻發(fā),給卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)造成了極大的經(jīng)濟(jì)損失。因此,研究卵形鯧鲹免疫基因與抗病性狀關(guān)聯(lián)性,確定免疫分子標(biāo)記,建立免疫防控技術(shù),對(duì)支撐卵形鯧鲹養(yǎng)殖產(chǎn)業(yè)的健康發(fā)展具有重要意義。本研究從實(shí)驗(yàn)室前期測(cè)序獲得的卵形鯧鲹基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中獲取了主要組織相容性復(fù)合體Ⅱβ(majorhistocompatibility complexⅡβ,MHCⅡβ)和γ-干擾素誘導(dǎo)的溶酶體巰基還原酶(interferon-γ-inducible lysosomal thiol reductase,GILT)的部分序列,利用RACE技術(shù)克隆獲得MHCⅡβ和GILT基因cDNA全序列,以此為基礎(chǔ)比對(duì)基因組數(shù)據(jù)庫(kù),獲得了MHCⅡβ和GILT基因組全序列,分析了其組織表達(dá)和細(xì)菌感染前后表達(dá)譜特征,篩選了基因多態(tài)性位點(diǎn),分析了基因多態(tài)性與抗菌性狀的相關(guān)性,取得的主要結(jié)果如下:一、卵形鯧鲹MHCⅡβ表達(dá)調(diào)控及其基因多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析結(jié)論:ToMHCⅡβcDNA全長(zhǎng)... 

【文章來(lái)源】:上海海洋大學(xué)上海市

【文章頁(yè)數(shù)】:90 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】:碩士

【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
前言
    1.1 卵形鯧鲹簡(jiǎn)介
        1.1.1 卵形鯧鲹形態(tài)特征及生活習(xí)性簡(jiǎn)介
        1.1.2 卵形鯧鲹研究進(jìn)展
    1.2 魚(yú)類的免疫防御
        1.2.1 免疫器官和組織
        1.2.2 免疫細(xì)胞
        1.2.3 體液免疫因子
    1.3 主要組織相容性復(fù)合體(MHC)
        1.3.1 主要組織相容性復(fù)合體簡(jiǎn)介
        1.3.2 MHC基因功能結(jié)構(gòu)
    1.4 MHC基因的遺傳變異與魚(yú)類抗病性
        1.4.1 MHC基因的遺傳變異
    1.5 Γ-干擾素誘導(dǎo)的溶酶體巰基還原酶(GILT)
        1.5.1 溶酵體簡(jiǎn)介
        1.5.2 Γ-干擾素簡(jiǎn)介
        1.5.3 GILT的發(fā)現(xiàn)
        1.5.4 GILT在MHCⅡ類抗原加工中的作用
        1.5.5 GILT的活性特征
        1.5.6 GILT研究概況和發(fā)展趨勢(shì)
    1.6 研究目的、意義及技術(shù)路線
        1.6.1 研究目的與意義
        1.6.2 技術(shù)方案
第二章 卵形鯧鲹MHCⅡB基因的表達(dá)調(diào)控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析
    2.1 實(shí)驗(yàn)材料
        2.1.1 實(shí)驗(yàn)菌種
        2.1.2 實(shí)驗(yàn)用魚(yú)
        2.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
        2.1.4 實(shí)驗(yàn)試劑與配制
    2.2 實(shí)驗(yàn)用品預(yù)處理
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物處理及取樣
        2.2.2 卵形鯧鲹總RNA提取
        2.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        2.2.4 TOMHCⅡB基因CDNA全長(zhǎng)的克隆
        2.2.5 TOMHCⅡΒ 基因序列分析
        2.2.6 TOMHCⅡΒ 基因表達(dá)分析
    2.3 TOMHCⅡΒ 基因多態(tài)性
        2.3.1 卵形鯧鲹基因組DNA的提取
        2.3.2 基因克隆鏈接轉(zhuǎn)化
    2.4 結(jié)果與分析
        2.4.1 TOMHCⅡΒ 的CDNA序列特征
        2.4.2 TOMHCⅡΒ 基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
        2.4.3 MHCⅡΒ 基因組結(jié)構(gòu)比較
        2.4.4 TOMHCⅡΒMRNA組織表達(dá)分析
        2.4.5 TOMHCⅡΒ MRNA的時(shí)空表達(dá)
        2.4.6 美人魚(yú)發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        2.4.7 DNA提取結(jié)果和測(cè)序分析
        2.4.8 TOMHCⅡΒ 基因的多態(tài)性分析
        2.4.9 TOMHCⅡΒ 基因與美人魚(yú)發(fā)光桿菌易感性/抗性的關(guān)聯(lián)性分析
    2.5 討論
第三章 卵形鯧鲹GILT基因的表達(dá)調(diào)控及其多態(tài)性與抗菌性狀的關(guān)聯(lián)分析
    3.1 實(shí)驗(yàn)材料
        3.1.1 實(shí)驗(yàn)菌種
        3.1.2 實(shí)驗(yàn)用魚(yú)
        3.1.3 實(shí)驗(yàn)儀器
        3.1.4 實(shí)驗(yàn)試劑與配制
    3.2 實(shí)驗(yàn)用品預(yù)處理
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物處理及取樣
        3.2.2 總RNA提取卵形鯧鲹RNA的提取
        3.2.3 卵形鯧鲹CDNA的合成
        3.2.4 TOGILT基因CDNA全長(zhǎng)的克隆
        3.2.5 TOGILT基因序列分析
        3.2.6 TOGILT基因表達(dá)分析
    3.3 結(jié)果與分析
        3.3.1 TOGILT的DNA序列特征
        3.3.2 TOGILT基因系統(tǒng)進(jìn)化分析
        3.3.3 TOGILT基因組結(jié)構(gòu)比較
        3.3.4 TOGILT MRNA組織表達(dá)分析
        3.3.5 TOGILT MRNA的時(shí)空表達(dá)
        3.3.6 美人魚(yú)發(fā)光桿菌感染卵形鯧鲹
        3.3.7 DNA提取結(jié)果和測(cè)序分析
        3.3.8 TOGILT基因SNP位點(diǎn)分析
        3.3.9 TOGILT基因型與美人魚(yú)發(fā)光桿菌易感性/抗性的關(guān)聯(lián)性分析
    3.4 討論
小結(jié)
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]亞麻酸對(duì)卵形鯧鲹幼魚(yú)生長(zhǎng)性能、消化酶活性及抗氧化能力的影響[J]. 戚常樂(lè),林黑著,黃忠,周傳朋,楊育凱,虞為,趙書(shū)燕.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2016(06)
[2]不同糖源飼料對(duì)卵形鯧鲹(Trachinotus ovatus)生長(zhǎng)、體組成、血糖水平和肝臟糖酵解酶活力的影響[J]. 董蘭芳,張琴,程光平,許明珠,童潼,熊向英.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2016(05)
[3]石斑魚(yú)(Epinephelus coioides)MHC基因多態(tài)性及其與虹彩病毒抗性的關(guān)聯(lián)分析(英文)[J]. 楊敏,魏京廣,李鵬飛,魏世娜,黃友華,秦啟偉.  Science Bulletin. 2016(09)
[4]金錢魚(yú)MHC Ⅱ β基因結(jié)構(gòu)、多態(tài)性與組織表達(dá)分析[J]. 王曉冰,劉至治,李強(qiáng),張璐菲,張俊彬.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2016(01)
[5]大黃魚(yú)在感染刺激隱核蟲(chóng)后MHC IIB基因的表達(dá)[J]. 陳健,張東玲,葉坤,王志勇.  安徽農(nóng)業(yè)科學(xué). 2015(07)
[6]尼羅羅非魚(yú)MHC Ⅰα全長(zhǎng)cDNA的克隆、多態(tài)性及組織表達(dá)特征[J]. 黎建平,高風(fēng)英,盧邁新,曹建萌,朱華平,可小麗,劉志剛.  中國(guó)水產(chǎn)科學(xué). 2014(06)
[7]卵形鯧鲹尾部骨骼胚后發(fā)育研究[J]. 鄭攀龍,馬振華,郭華陽(yáng),李有寧,張殿昌,江世貴.  南方水產(chǎn)科學(xué). 2014(05)
[8]飼料中硒酵母添加水平對(duì)卵形鯧鲹生長(zhǎng)、食物利用及魚(yú)體組成的影響[J]. 吳玉波,韓華,王巖.  飼料工業(yè). 2013(12)
[9]卵形鯧鲹的營(yíng)養(yǎng)需求研究及其配合飼料研發(fā)[J]. 唐媛媛,張蕉南,艾春香,胡兵.  飼料工業(yè). 2013(08)
[10]卵形鯧鲹主要病害及其研究進(jìn)展[J]. 夏立群,黃郁蔥,魯義善.  安徽農(nóng)學(xué)通報(bào)(上半月刊). 2012(23)

博士論文
[1]草魚(yú)MHC相關(guān)多肽與腫瘤壞死因子受體相關(guān)因子的克隆及其表達(dá)分析[D]. 徐在言.中國(guó)科學(xué)院研究生院(水生生物研究所) 2007
[2]重要海水養(yǎng)殖魚(yú)類MHCⅡ基因克隆、表達(dá)及多態(tài)性分析[D]. 張玉喜.中國(guó)海洋大學(xué) 2006

碩士論文
[1]卵形鯧鲹ToPrx1和ToTrx1基因的特征和功能研究[D]. 王龍.上海海洋大學(xué) 2015
[2]興國(guó)紅鯉和荷包紅鯉MHC Ⅱ類基因多態(tài)性、表達(dá)及其與魚(yú)體抗病力關(guān)系的分析[D]. 劉俊.上海海洋大學(xué) 2014
[3]草魚(yú)MHC II B和組織蛋白酶D基因的克隆、表達(dá)及多態(tài)性分析[D]. 董忠典.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2013
[4]尼羅羅非魚(yú)MHCII類基因的克隆與表達(dá)特征及多態(tài)性研究[D]. 龐紀(jì)彩.上海海洋大學(xué) 2013
[5]羅非魚(yú)T淋巴細(xì)胞幾種標(biāo)志基因的克隆及表達(dá)研究[D]. 劉冬.西南大學(xué) 2012
[6]建鯉MHC基因的克隆與序列分析[D]. 周凱.南京農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
[7]大菱鲆受哈維氏弧菌感染后的基因差異表達(dá)研究[D]. 王傳娟.中國(guó)海洋大學(xué) 2007



本文編號(hào):3255284

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