為初步探索魚類PKCθ基因在抵御病原菌感染過程中的作用,本研究進(jìn)行了雜交鱧（Channa maculata♀×C. argus♂） PKCθ（CmaPKCθ）基因克隆及其在舒伯特氣單胞菌（Aeromonas schubertii）、鰤魚諾卡氏菌（Nocardia seriolae）感染后的表達(dá)分析�？寺～@得CmaPKCθ的完整開放閱讀框（ORF）長度為2 151 bp,預(yù)測編碼716個氨基酸,具有保守的C1、C2樣、C3和C4結(jié)構(gòu)域。Blast分析表明CmaPKCθ氨基酸序列與尖吻鱸（Lates calcarifer） PKCθ的同源性最高,達(dá)92%。氨基酸多重序列比對顯示CmaPKCθ具有保守的磷酸化位點和泛素化位點。系統(tǒng)進(jìn)化樹結(jié)果顯示雜交鱧與其他魚類的PKCθ聚為一個分支,其中與尖吻鱸PKCθ親緣關(guān)系最近。實時熒光定量PCR結(jié)果表明,CmaPKCθ在健康雜交鱧的所有被檢組織中廣泛表達(dá),其中在肝臟中表達(dá)水平最高,其次為脾臟、胸腺和頭腎,在肌肉中的表達(dá)量最低。舒伯特氣單胞菌和鰤魚諾卡氏菌分別感染雜交鱧后,其肝臟、脾臟和頭腎分別在第5天、第5天、第12小時和第10天、第2天、第3天時達(dá)到... 

【文章來源】：基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】：9 頁

【部分圖文】：

羅氏沼蝦Ec R基因的PCR擴(kuò)增片段

羅氏沼蝦EcR基因預(yù)測的氨基酸序列(ecr-aa)和NCBI中已發(fā)表的EcR氨基酸(EcR-AA)序列比對

借助在線分析軟件Expasy Protscale預(yù)測EcR蛋白的疏水性。結(jié)果顯示，在-0.5以下的區(qū)域有很多氨基酸，即是親水性區(qū)域，表明EcR蛋白具有親水性(圖5)，這與Expasy Protaram預(yù)測得到的總平均疏水指數(shù)(GRAVY=-0.442)結(jié)果一致。圖4 基于EcR基因推導(dǎo)的氨基酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹分析

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
[1]甜瓜蛋白激酶類基因CmPKC的克隆及原核表達(dá)載體的構(gòu)建[J]. 葉春秀,趙曾強(qiáng),于航,張國麗,王建玉,莊振剛,張愛萍,謝宗銘.  分子植物育種. 2017(11)
[2]日本蛇根草查爾酮合酶基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[J]. 孫威,劉杰,陳婷,湯曉辛,鞠志剛,乙引.  分子植物育種. 2017(04)
[3]中華絨螯蟹EcR基因全長cDNA克隆及表達(dá)分析[J]. 王瑤,楊志剛,沈城,姚琴琴,曾奇韜,劉啟彬,成永旭.  水產(chǎn)學(xué)報. 2014(05)
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[5]三疣梭子蟹EcR基因的克隆及表達(dá)分析[J]. 崔曉雨,朱冬發(fā),湯潔,謝熙,邱錫爾.  水產(chǎn)學(xué)報. 2013(11)
[6]雜交鱧（斑鱧♀×烏鱧♂）內(nèi)臟類結(jié)節(jié)病病原菌的分離、鑒定與特性分析[J]. 劉春,李凱彬,王慶,常藕琴,梁慧麗,王芳,潘德博,石存斌,吳淑勤.  水產(chǎn)學(xué)報. 2012(07)
[7]日本沼蝦蛻皮激素受體（EcR）的cDNA克隆及其在胚胎發(fā)育過程中的表達(dá)分析[J]. 陳輝,王文清,朱小玲.  海洋漁業(yè). 2009(04)

博士論文
[1]黃臉油葫蘆雌激素相關(guān)受體（ERR）和蛻皮激素受體（EcR）基因的克隆及其在發(fā)育過程中的表達(dá)研究[D]. 何慧.陜西師范大學(xué) 2010



本文編號：3246779