4個瓦氏黃顙魚群體遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析
發(fā)布時間:2021-06-23 06:05
為研究嘉陵江、沅江、漢水、贛江4個不同地區(qū)瓦氏黃顙魚群體的遺傳多樣性及親緣關(guān)系,隨機(jī)選取80個微衛(wèi)星位點(diǎn)對來自4個群體的127尾個體進(jìn)行PCR擴(kuò)增,成功擴(kuò)增出48對微衛(wèi)星引物,篩選得到25個多態(tài)性微衛(wèi)星位點(diǎn)。測得的遺傳多樣性度量結(jié)果表明,4個群體的等位基因數(shù)為2~18,平均有效等位基因數(shù)2.383~3.578,平均觀測雜合度0.460~0.581,平均期望雜合度0.487~0.674,平均多態(tài)信息含量0.431~0.627。嘉陵江、沅江、漢水、贛江4個瓦氏黃顙魚群體表現(xiàn)為高度多態(tài)的位點(diǎn)分別為9、11、23、21個,中度多態(tài)的位點(diǎn)分別為12、11、3、5個。通過計(jì)算4個瓦氏黃顙魚群體間的遺傳相似系數(shù)和遺傳距離,并構(gòu)建進(jìn)化樹,發(fā)現(xiàn)贛江群體單獨(dú)聚為一類,嘉陵江、沅江和漢水群體聚為一類,其中,在嘉陵江、沅江和漢水群體這個分支中,沅江和漢水群體聚為一類。用Structure 2.3.4軟件對4個瓦氏黃顙魚群體進(jìn)行貝葉斯聚類分析驗(yàn)證,結(jié)果與進(jìn)化樹分析的結(jié)果一致。本研究利用微衛(wèi)星標(biāo)記對4個瓦氏黃顙魚群體進(jìn)行遺傳評估,研究結(jié)果可為長江流域瓦氏黃顙魚的保護(hù)、監(jiān)測和遺傳育種提供分子基礎(chǔ)資料。
【文章來源】:水產(chǎn)科學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
4個瓦氏黃顙魚群體的地理位置
分子方差分析結(jié)果(表5)表明,群體中有31.04%(P<0.01)的遺傳變異來自于群體間,68.96%(P<0.01)的遺傳變異來自于群體內(nèi),表明遺傳變異大部分存在于個體之間,群體內(nèi)的遺傳變異大于群體間的遺傳變異。4個瓦氏黃顙魚群體間的遺傳分化指數(shù)為0.1613~0.4020(表6),屬于較高水平遺傳分化(遺傳分化指數(shù)>0.15)。其中嘉陵江瓦氏黃顙魚群體和贛江瓦氏黃顙魚群體之間的遺傳分化水平最低,遺傳分化指數(shù)0.1613,屬于較大程度的分化(0.15<遺傳分化指數(shù)<0.25)。而嘉陵江瓦氏黃顙魚群體和漢水瓦氏黃顙魚群體之間遺傳分化水平最高,遺傳分化指數(shù)0.4020,兩者間的分化程度極大(遺傳分化指數(shù)>0.25)(表6)。利用Structure 2.3.4軟件對4個瓦氏黃顙魚群體25個微衛(wèi)星座位等位基因數(shù)據(jù)進(jìn)行貝葉斯聚類分析與遺傳結(jié)構(gòu)推導(dǎo)分析(圖3)。按照文獻(xiàn)[13]計(jì)算最優(yōu)K值的方法,得到當(dāng)K=3時,沅江和漢水群體在遺傳結(jié)構(gòu)上相似,可為一類;嘉陵江和贛江各為一類。
利用Structure 2.3.4軟件對4個瓦氏黃顙魚群體25個微衛(wèi)星座位等位基因數(shù)據(jù)進(jìn)行貝葉斯聚類分析與遺傳結(jié)構(gòu)推導(dǎo)分析(圖3)。按照文獻(xiàn)[13]計(jì)算最優(yōu)K值的方法,得到當(dāng)K=3時,沅江和漢水群體在遺傳結(jié)構(gòu)上相似,可為一類;嘉陵江和贛江各為一類。3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廣西稻田養(yǎng)殖金邊鯉群體遺傳多樣性分析[J]. 甘寶江,張盛,韋玲靜,黃杰,莫潔琳,甘習(xí)軍,滕忠作,葉香塵. 水產(chǎn)科學(xué). 2019(05)
[2]雜交黃顙魚(黃顙魚♀×瓦氏黃顙魚♂)及其雙親遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 張佳佳,李杰,張國松,王濤,尹紹武,唐忠林,茆健強(qiáng),王若然. 水產(chǎn)科學(xué). 2018(05)
[3]普通黃顙魚、瓦氏黃顙魚及其雜種一代遺傳特征的微衛(wèi)星分析[J]. 李景芬,采克俊,公翠萍,王曙,周志金. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(07)
[4]大口黑鱸LPL基因SNPs及其與適應(yīng)人工配合飼料能力的相關(guān)性研究[J]. 馬冬梅,朱擇敏,白俊杰,全迎春,樊佳佳,田園園,廖國禮,梁旭方. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]長江中下游湖泊和云南撫仙湖黃顙魚群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 劉紅艷,陳校輝,熊飛. 華中師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(02)
[6]微衛(wèi)星分析鯉魚雜交系F2代家系群體遺傳多樣性[J]. 陳子桂,王培培,廖愚,覃俊奇,袁宗偉,葉香塵,呂業(yè)堅(jiān). 水產(chǎn)科技情報(bào). 2016(02)
[7]仿刺參中國群體與韓國群體雜交子代微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 王鶴,王田田,胡麗萍,趙強(qiáng),孫國華,孫靈毅. 水產(chǎn)科學(xué). 2016(01)
[8]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析3個暗紋東方鲀(Takifugu obscurus)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性[J]. 鄒杰,馬愛軍,趙艷飛,何偉國,王婷,岳亮,劉大勇,郭正龍. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[9]河川沙塘鱧、鴨綠沙塘鱧及其雜交子代的微衛(wèi)星分析[J]. 張麗娟,祝斐,尹紹武,張亞萍,侯新遠(yuǎn),胡亞麗. 淡水漁業(yè). 2014(05)
[10]卵形鯧鲹育種群體遺傳多樣性分析[J]. 孫立元,郭華陽,朱彩艷,馬振華,江世貴,張殿昌. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2014(02)
碩士論文
[1]黃顙魚微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及群體遺傳多樣性分析[D]. 孔藝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3244391
【文章來源】:水產(chǎn)科學(xué). 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:12 頁
【部分圖文】:
4個瓦氏黃顙魚群體的地理位置
分子方差分析結(jié)果(表5)表明,群體中有31.04%(P<0.01)的遺傳變異來自于群體間,68.96%(P<0.01)的遺傳變異來自于群體內(nèi),表明遺傳變異大部分存在于個體之間,群體內(nèi)的遺傳變異大于群體間的遺傳變異。4個瓦氏黃顙魚群體間的遺傳分化指數(shù)為0.1613~0.4020(表6),屬于較高水平遺傳分化(遺傳分化指數(shù)>0.15)。其中嘉陵江瓦氏黃顙魚群體和贛江瓦氏黃顙魚群體之間的遺傳分化水平最低,遺傳分化指數(shù)0.1613,屬于較大程度的分化(0.15<遺傳分化指數(shù)<0.25)。而嘉陵江瓦氏黃顙魚群體和漢水瓦氏黃顙魚群體之間遺傳分化水平最高,遺傳分化指數(shù)0.4020,兩者間的分化程度極大(遺傳分化指數(shù)>0.25)(表6)。利用Structure 2.3.4軟件對4個瓦氏黃顙魚群體25個微衛(wèi)星座位等位基因數(shù)據(jù)進(jìn)行貝葉斯聚類分析與遺傳結(jié)構(gòu)推導(dǎo)分析(圖3)。按照文獻(xiàn)[13]計(jì)算最優(yōu)K值的方法,得到當(dāng)K=3時,沅江和漢水群體在遺傳結(jié)構(gòu)上相似,可為一類;嘉陵江和贛江各為一類。
利用Structure 2.3.4軟件對4個瓦氏黃顙魚群體25個微衛(wèi)星座位等位基因數(shù)據(jù)進(jìn)行貝葉斯聚類分析與遺傳結(jié)構(gòu)推導(dǎo)分析(圖3)。按照文獻(xiàn)[13]計(jì)算最優(yōu)K值的方法,得到當(dāng)K=3時,沅江和漢水群體在遺傳結(jié)構(gòu)上相似,可為一類;嘉陵江和贛江各為一類。3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廣西稻田養(yǎng)殖金邊鯉群體遺傳多樣性分析[J]. 甘寶江,張盛,韋玲靜,黃杰,莫潔琳,甘習(xí)軍,滕忠作,葉香塵. 水產(chǎn)科學(xué). 2019(05)
[2]雜交黃顙魚(黃顙魚♀×瓦氏黃顙魚♂)及其雙親遺傳多樣性的微衛(wèi)星分析[J]. 張佳佳,李杰,張國松,王濤,尹紹武,唐忠林,茆健強(qiáng),王若然. 水產(chǎn)科學(xué). 2018(05)
[3]普通黃顙魚、瓦氏黃顙魚及其雜種一代遺傳特征的微衛(wèi)星分析[J]. 李景芬,采克俊,公翠萍,王曙,周志金. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué). 2018(07)
[4]大口黑鱸LPL基因SNPs及其與適應(yīng)人工配合飼料能力的相關(guān)性研究[J]. 馬冬梅,朱擇敏,白俊杰,全迎春,樊佳佳,田園園,廖國禮,梁旭方. 農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào). 2018(01)
[5]長江中下游湖泊和云南撫仙湖黃顙魚群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[J]. 劉紅艷,陳校輝,熊飛. 華中師范大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2016(02)
[6]微衛(wèi)星分析鯉魚雜交系F2代家系群體遺傳多樣性[J]. 陳子桂,王培培,廖愚,覃俊奇,袁宗偉,葉香塵,呂業(yè)堅(jiān). 水產(chǎn)科技情報(bào). 2016(02)
[7]仿刺參中國群體與韓國群體雜交子代微衛(wèi)星標(biāo)記分析[J]. 王鶴,王田田,胡麗萍,趙強(qiáng),孫國華,孫靈毅. 水產(chǎn)科學(xué). 2016(01)
[8]利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析3個暗紋東方鲀(Takifugu obscurus)養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性[J]. 鄒杰,馬愛軍,趙艷飛,何偉國,王婷,岳亮,劉大勇,郭正龍. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2015(02)
[9]河川沙塘鱧、鴨綠沙塘鱧及其雜交子代的微衛(wèi)星分析[J]. 張麗娟,祝斐,尹紹武,張亞萍,侯新遠(yuǎn),胡亞麗. 淡水漁業(yè). 2014(05)
[10]卵形鯧鲹育種群體遺傳多樣性分析[J]. 孫立元,郭華陽,朱彩艷,馬振華,江世貴,張殿昌. 南方水產(chǎn)科學(xué). 2014(02)
碩士論文
[1]黃顙魚微衛(wèi)星標(biāo)記的篩選及群體遺傳多樣性分析[D]. 孔藝.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
本文編號:3244391
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