大黃魚養(yǎng)殖環(huán)境中浮游細(xì)菌和浮游病毒的遺傳多樣性研究
發(fā)布時(shí)間:2021-06-20 19:28
細(xì)菌和病毒作為海洋生態(tài)系統(tǒng)中重要的兩類微生物,具有極高的豐度和極豐富的多樣性,在全球物質(zhì)循環(huán)和能量流轉(zhuǎn)過程中發(fā)揮著重要的作用。在海洋環(huán)境中,浮游細(xì)菌和病毒的群落結(jié)構(gòu)復(fù)雜,隨著環(huán)境變化而發(fā)生改變,同時(shí)又反過來影響著環(huán)境。海水養(yǎng)殖環(huán)境是一類特殊的海洋環(huán)境,養(yǎng)殖活動給養(yǎng)殖環(huán)境輸入了大量的營養(yǎng)物質(zhì),影響著養(yǎng)殖環(huán)境中微生物的群落結(jié)構(gòu);诖,本論文調(diào)查分析了寧德近海大黃魚養(yǎng)殖環(huán)境和非養(yǎng)殖環(huán)境浮游細(xì)菌和浮游病毒的豐度和遺傳多樣性及其在時(shí)間尺度上的變化趨勢、大黃魚不同部位的可培養(yǎng)和不可培養(yǎng)微生物的群落結(jié)構(gòu),試圖揭示海水養(yǎng)殖環(huán)境下的微生物群落結(jié)構(gòu)和多樣性及養(yǎng)殖行為對微生物群落結(jié)構(gòu)的影響。主要研究結(jié)果如下:1.利用流式細(xì)胞技術(shù)對寧德近海大黃魚養(yǎng)殖環(huán)境和非養(yǎng)殖環(huán)境的浮游細(xì)菌和浮游病毒豐度進(jìn)行了為期一年的檢測。結(jié)果表明,養(yǎng)殖環(huán)境浮游細(xì)菌和浮游病毒均顯示出極高的豐度,浮游細(xì)菌豐度范圍為:3.21×105-5.16×106cellsmL-1,浮游病毒豐度范圍為:9.07×106-4.22×107 particles mL-1。兩者在時(shí)間尺度上均呈現(xiàn)明顯的變化規(guī)律,在7月高溫季節(jié)豐度最高,而1月低溫季節(jié)豐度相對較...
【文章來源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1主要海洋細(xì)菌類群中己有純培養(yǎng)(黑色)和仍未能獲得培養(yǎng)(紅色)的??部分匯總(基于16S?rRNA基因序列的分析結(jié)果;綜合Pace,1997和Keller?&??
層逐漸遞減的明顯時(shí)空分布特征,富營養(yǎng)地區(qū)浮游病毒顯著高于寡營養(yǎng)地區(qū),夏??秋季浮游病毒一般來說也會高于冬季。??1.2.1.2海洋病毒的分類??海洋浮游病毒具有極高的形態(tài)多樣性和遺傳多樣性,目前國際上對海洋病毒??的分類主要依據(jù)其核酸類型、宿主類型和形態(tài)結(jié)構(gòu)等特征,尚未建立統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。??海洋病毒核酸類型為RNA和DNA,目前海洋浮游病毒研究主要聚焦在豐度最高??的雙鏈DNA病毒,但單鏈DNA病毒和RNA病毒豐度也很高(Labontd?and?Suttle,??2013;?Steward?el?al.,?2013;?Tomaru?et?a/.,?2009;?Shirai?et?al.,?2008;?Miranda?el?al.,??2016)。根據(jù)海洋病毒的宿主類型將海洋病毒主要分為噬菌體(宿主為細(xì)菌)和??噬藻體(宿主為真核藻類),除此之外還有浮游植物病毒、浮游動物病毒、真菌??病毒和人類病毒等(Wommack,2000)。??
?10??Number?of?fishes??圖1.3海水魚和淡水魚消化道中厭氧細(xì)菌組成(Romero占fl/.,?2014)??Figure?1.3?Anaerobic?bacteria?reported?in?the?GI?tract?of?marine?and?freshwater??fish?(Romero?el?al^?2014).??與恒溫動物相比,魚類腸道微生物多樣性和豐度均較低,人類腸道微生物群??落多達(dá)400種(Berg,丨996;?Tannock,1998),成人腸道中大約有1014個(gè)微生物細(xì)??胞,成魚腸道中細(xì)菌數(shù)量約為105CFU/g-107CFU/g,微生物群落結(jié)構(gòu)也更簡單。??1.3.2影響魚類腸道菌群結(jié)構(gòu)的因素??魚類腸道微生物群落是一個(gè)動態(tài)變化的系統(tǒng),其群落結(jié)構(gòu)和微生物數(shù)量受一??系列內(nèi)源性和外源性因素影響,包括魚的種類、發(fā)育階段、生理狀態(tài)、食物組成、??投喂策略、環(huán)境條件以及季節(jié)等。??各品種魚的腸道菌群組成各異。研宄表明,海鱒Ca/wo/rw//<3rrw//a)腸道??優(yōu)勢菌群分別為腸桿菌科、氣單胞菌屬、假單胞菌屬,其占比分別為52%,?22%??和]4%
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廈門海域春季浮游病毒的豐度及形態(tài)多樣性分析[J]. 蔡蘭蘭,殷思博,楊蕓蘭,張銳. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(06)
[2]象山港網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)與非養(yǎng)殖區(qū)的細(xì)菌群落分布[J]. 胡常巨,熊金波,陳和平,王凱,葉然,崔永平,朱建林,張德民. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(24)
[3]Survey of cyanomyovirus abundance in Shantou coastal waters by g20[J]. 李傳標(biāo),丁俊,周立鎮(zhèn),張昭,李升康,劉文華,溫小波. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2015(03)
[4]人工養(yǎng)殖對蝦腸道內(nèi)可培養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量及組成分析[J]. 張盛靜,趙小金,宋曉玲,張曉靜,萬曉媛,黃倢. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]南太平洋環(huán)流區(qū)底層水可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性研究[J]. 李昭,喬延路,范曉陽,史曉翀,張曉華. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(06)
[6]深海微生物多樣性[J]. 王風(fēng)平,周悅恒,張新旭,肖湘. 生物多樣性. 2013(04)
[7]象山港網(wǎng)箱養(yǎng)殖對近海沉積物細(xì)菌群落的影響[J]. 裘瓊芬,張德民,葉仙森,鄭珍珍. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]大黃魚(Pseudosciaena crocea)源美人魚發(fā)光桿菌(Photobacterium damselae)的分離鑒定及致病性研究[J]. 張飛,蘇永全,王軍,覃映雪,馬英,鄢慶枇. 海洋與湖沼. 2012(06)
[9]冬季和春季長江口及其近海水域浮游病毒豐度的分析[J]. 白曉歌,汪岷,馬晶晶,孫軍,梁彥韜,喬倩. 海洋與湖沼. 2007(04)
[10]西北太平洋沉積物中細(xì)菌多樣性的研究[J]. 穆春華,包振民,陳剛,郝魯江,祁自忠,勞軍,李廣雪,胡景杰. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2006(04)
博士論文
[1]膠州灣和東太平洋海。ā13°N)沉積物微生物多樣性研究[D]. 李友訓(xùn).中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2008
碩士論文
[1]四種功能性飼料添加劑對花鰻鱺生長性能、脂肪代謝、非特異性免疫和肝腸健康的影響[D]. 解文麗.廈門大學(xué) 2017
[2]長江口及鄰近海域海水細(xì)菌多樣性及時(shí)空分布規(guī)律研究[D]. 劉曉輝.浙江海洋大學(xué) 2017
[3]野生與養(yǎng)殖大鯢腸道微生物多樣性分析及產(chǎn)酶活性研究[D]. 劉棟.陜西理工學(xué)院 2016
[4]燦爛、哈維弧菌噬菌體的分離鑒定及其生物學(xué)特性的研究[D]. 李男.大連海洋大學(xué) 2016
[5]日本鰻鱺小腸共生微生物多樣性及其功能分析[D]. 簡思美.福建師范大學(xué) 2016
[6]北極斯瓦爾巴群島冰川流域氮循環(huán)細(xì)菌的多樣性及分類學(xué)研究[D]. 孫景.青島科技大學(xué) 2015
[7]東太平洋深海熱液區(qū)沉積物細(xì)菌和古菌多樣性分析及一株中溫細(xì)菌的分類鑒定[D]. 劉青.國家海洋局第三海洋研究所 2014
[8]副溶血弧菌噬菌體的分離鑒定、裂解性能及其在副溶血弧菌快速檢測中的初步應(yīng)用[D]. 彭勇.中國海洋大學(xué) 2013
[9]山東省東平湖四種常見淡水魚腸道菌群分析[D]. 周玉法.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[10]黃顙魚腸道菌群分析和益生菌的研究[D]. 周金敏.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3239790
【文章來源】:廈門大學(xué)福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校
【文章頁數(shù)】:104 頁
【學(xué)位級別】:碩士
【部分圖文】:
圖1.1主要海洋細(xì)菌類群中己有純培養(yǎng)(黑色)和仍未能獲得培養(yǎng)(紅色)的??部分匯總(基于16S?rRNA基因序列的分析結(jié)果;綜合Pace,1997和Keller?&??
層逐漸遞減的明顯時(shí)空分布特征,富營養(yǎng)地區(qū)浮游病毒顯著高于寡營養(yǎng)地區(qū),夏??秋季浮游病毒一般來說也會高于冬季。??1.2.1.2海洋病毒的分類??海洋浮游病毒具有極高的形態(tài)多樣性和遺傳多樣性,目前國際上對海洋病毒??的分類主要依據(jù)其核酸類型、宿主類型和形態(tài)結(jié)構(gòu)等特征,尚未建立統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)。??海洋病毒核酸類型為RNA和DNA,目前海洋浮游病毒研究主要聚焦在豐度最高??的雙鏈DNA病毒,但單鏈DNA病毒和RNA病毒豐度也很高(Labontd?and?Suttle,??2013;?Steward?el?al.,?2013;?Tomaru?et?a/.,?2009;?Shirai?et?al.,?2008;?Miranda?el?al.,??2016)。根據(jù)海洋病毒的宿主類型將海洋病毒主要分為噬菌體(宿主為細(xì)菌)和??噬藻體(宿主為真核藻類),除此之外還有浮游植物病毒、浮游動物病毒、真菌??病毒和人類病毒等(Wommack,2000)。??
?10??Number?of?fishes??圖1.3海水魚和淡水魚消化道中厭氧細(xì)菌組成(Romero占fl/.,?2014)??Figure?1.3?Anaerobic?bacteria?reported?in?the?GI?tract?of?marine?and?freshwater??fish?(Romero?el?al^?2014).??與恒溫動物相比,魚類腸道微生物多樣性和豐度均較低,人類腸道微生物群??落多達(dá)400種(Berg,丨996;?Tannock,1998),成人腸道中大約有1014個(gè)微生物細(xì)??胞,成魚腸道中細(xì)菌數(shù)量約為105CFU/g-107CFU/g,微生物群落結(jié)構(gòu)也更簡單。??1.3.2影響魚類腸道菌群結(jié)構(gòu)的因素??魚類腸道微生物群落是一個(gè)動態(tài)變化的系統(tǒng),其群落結(jié)構(gòu)和微生物數(shù)量受一??系列內(nèi)源性和外源性因素影響,包括魚的種類、發(fā)育階段、生理狀態(tài)、食物組成、??投喂策略、環(huán)境條件以及季節(jié)等。??各品種魚的腸道菌群組成各異。研宄表明,海鱒Ca/wo/rw//<3rrw//a)腸道??優(yōu)勢菌群分別為腸桿菌科、氣單胞菌屬、假單胞菌屬,其占比分別為52%,?22%??和]4%
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]廈門海域春季浮游病毒的豐度及形態(tài)多樣性分析[J]. 蔡蘭蘭,殷思博,楊蕓蘭,張銳. 廈門大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2015(06)
[2]象山港網(wǎng)箱養(yǎng)殖區(qū)與非養(yǎng)殖區(qū)的細(xì)菌群落分布[J]. 胡常巨,熊金波,陳和平,王凱,葉然,崔永平,朱建林,張德民. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2015(24)
[3]Survey of cyanomyovirus abundance in Shantou coastal waters by g20[J]. 李傳標(biāo),丁俊,周立鎮(zhèn),張昭,李升康,劉文華,溫小波. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2015(03)
[4]人工養(yǎng)殖對蝦腸道內(nèi)可培養(yǎng)細(xì)菌數(shù)量及組成分析[J]. 張盛靜,趙小金,宋曉玲,張曉靜,萬曉媛,黃倢. 上海海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2015(02)
[5]南太平洋環(huán)流區(qū)底層水可培養(yǎng)細(xì)菌多樣性研究[J]. 李昭,喬延路,范曉陽,史曉翀,張曉華. 中國海洋大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版). 2014(06)
[6]深海微生物多樣性[J]. 王風(fēng)平,周悅恒,張新旭,肖湘. 生物多樣性. 2013(04)
[7]象山港網(wǎng)箱養(yǎng)殖對近海沉積物細(xì)菌群落的影響[J]. 裘瓊芬,張德民,葉仙森,鄭珍珍. 生態(tài)學(xué)報(bào). 2013(02)
[8]大黃魚(Pseudosciaena crocea)源美人魚發(fā)光桿菌(Photobacterium damselae)的分離鑒定及致病性研究[J]. 張飛,蘇永全,王軍,覃映雪,馬英,鄢慶枇. 海洋與湖沼. 2012(06)
[9]冬季和春季長江口及其近海水域浮游病毒豐度的分析[J]. 白曉歌,汪岷,馬晶晶,孫軍,梁彥韜,喬倩. 海洋與湖沼. 2007(04)
[10]西北太平洋沉積物中細(xì)菌多樣性的研究[J]. 穆春華,包振民,陳剛,郝魯江,祁自忠,勞軍,李廣雪,胡景杰. 海洋學(xué)報(bào)(中文版). 2006(04)
博士論文
[1]膠州灣和東太平洋海。ā13°N)沉積物微生物多樣性研究[D]. 李友訓(xùn).中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2008
碩士論文
[1]四種功能性飼料添加劑對花鰻鱺生長性能、脂肪代謝、非特異性免疫和肝腸健康的影響[D]. 解文麗.廈門大學(xué) 2017
[2]長江口及鄰近海域海水細(xì)菌多樣性及時(shí)空分布規(guī)律研究[D]. 劉曉輝.浙江海洋大學(xué) 2017
[3]野生與養(yǎng)殖大鯢腸道微生物多樣性分析及產(chǎn)酶活性研究[D]. 劉棟.陜西理工學(xué)院 2016
[4]燦爛、哈維弧菌噬菌體的分離鑒定及其生物學(xué)特性的研究[D]. 李男.大連海洋大學(xué) 2016
[5]日本鰻鱺小腸共生微生物多樣性及其功能分析[D]. 簡思美.福建師范大學(xué) 2016
[6]北極斯瓦爾巴群島冰川流域氮循環(huán)細(xì)菌的多樣性及分類學(xué)研究[D]. 孫景.青島科技大學(xué) 2015
[7]東太平洋深海熱液區(qū)沉積物細(xì)菌和古菌多樣性分析及一株中溫細(xì)菌的分類鑒定[D]. 劉青.國家海洋局第三海洋研究所 2014
[8]副溶血弧菌噬菌體的分離鑒定、裂解性能及其在副溶血弧菌快速檢測中的初步應(yīng)用[D]. 彭勇.中國海洋大學(xué) 2013
[9]山東省東平湖四種常見淡水魚腸道菌群分析[D]. 周玉法.山東農(nóng)業(yè)大學(xué) 2011
[10]黃顙魚腸道菌群分析和益生菌的研究[D]. 周金敏.華中農(nóng)業(yè)大學(xué) 2010
本文編號:3239790
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