發(fā)布時間：2021-06-05 18:51

　　大菱鲆（Scophthalmus maximus）屬于鰈形目、鲆科、菱鲆屬,二十世紀九十年―跨洋引種‖引入我國,大菱鲆對夏季高溫耐受能力較差。因受水溫條件限制,我國北方主要采用―養(yǎng)殖大棚+深井海水‖模式進行養(yǎng)殖,但近年來,隨著地下海水的匱乏、南北接力養(yǎng)殖模式的出現,養(yǎng)殖生產中對大菱鲆耐高溫新品種的需求日益增加。另外,隨著分子技術的發(fā)展,應用分子生物學手段,加快開展大菱鲆耐熱性狀的分子機制研究,對于培育耐高溫的養(yǎng)殖品種具有較大的研究意義。本研究論文通過高通量測序手段,建立了大菱鲆熱應激條件下腎臟轉錄組數據庫,其中泛素蛋白酶體系相關的差異基因被顯著富集,對關鍵基因開展分子克隆及功能驗證,對于熱應激分子機制研究提供數據參考及理論支持;同時在本實驗室獲得的耐高溫QTL基礎上,開展共享QTL標記挖掘,為分子標記育種研究提供可靠的標記基礎。具體研究結果如下:1.為探索大菱鲆耐高溫的分子機制,篩選耐高溫相關基因,采用高通量測序平臺（IlluminaHiSeq-2500）分別對5個不同高溫處理組的大菱鲆腎臟進行轉錄組測序,進行生物信息學分析,包括GO（基因功能注釋）、SSR（簡單重復序列）分析等。獲得... 

【文章來源】：上海海洋大學上海市

【文章頁數】：62 頁

【學位級別】：碩士

【部分圖文】：

Unigene長度分布圖

Unigenes的GO功能分類圖

圖 2-5 Unigenes 的 KOG 功能分類Fig 2-5 KOG function classification of unigenes2.2.6 Unigenes 的 KEGG 分析結合 KEGG 數據庫注釋信息，進一步將大菱鲆腎臟 Unigenes 進行 pathway注釋，其中有 15488 個 unigenes 獲得對應的 Ko 編號，歸屬于 218 條代謝通路，分類為 5 類 KEGG 途徑：代謝途徑、遺傳信息處理、細胞過程、環(huán)境信息和生物系統(tǒng)。其中，代謝途徑主要包括碳水化合物代謝通路、氨基酸代謝通路、能量代謝通路、脂類代謝通路，核苷酸代謝通路等，占據 KO 注釋 unigenes 的 25.4%（3941 條）；遺傳信息處理主要包括翻譯，折疊、分選和相互作用，轉錄，復制和修復等，共注釋到 1907 條 unigenes，占 12.3%；細胞過程主要由轉運和代謝作用，細胞生長與死亡，運輸分解代謝，細胞連接等組成，共注釋到 2927 條unigenes，占 18.9%；環(huán)境信息主要包括信號轉導，信號分子與相互作用，共注釋 3230 條 unigenes，占 20.8%；此外 2161 條 unigenes 被注釋到生物系統(tǒng)中�；驍盗�

【參考文獻】：
期刊論文
[1]大菱鲆（Scophthalmus maximus）蛋白質二硫鍵異構酶SmPDIA3的表達分析和功能驗證[J]. 唐啟政,孫志賓,王新安,馬愛軍,楊雙雙,黃智慧.  海洋與湖沼. 2019(02)
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[3]植物逆境相關C2H2型鋅指蛋白的研究進展[J]. 趙麗娟,易小婭,曾幼玲.  分子植物育種. 2016(03)
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[7]松江鱸魚皮膚的顯微和亞顯微結構[J]. 蔣鑫,潘連德,馬召騰.  動物學雜志. 2012(04)
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博士論文
[1]基于microRNA-mRNA聯合分析對內蒙古絨山羊絨毛生長周期及啟動調控的研究[D]. 趙濛.內蒙古農業(yè)大學 2016
[2]大菱鲆耐高溫性狀選育及遺傳機理研究[D]. 黃智慧.中國海洋大學 2014
[3]鯉生長性狀主效QTL育種潛力評估及其在染色體上的定位[D]. 魯翠云.上海海洋大學 2014

碩士論文
[1]擁擠脅迫和亞硝酸鹽脅迫對草魚應激相關基因和泛素—蛋白酶體系統(tǒng)的影響[D]. 孫怡晴.華中農業(yè)大學 2018
[2]基于大菱鲆皮膚組織轉錄組的抗逆基因克隆、表達及功能研究[D]. 唐啟政.上海海洋大學 2018
[3]高溫逆境下大菱鲆體表生理生化特性研究[D]. 黃智慧.中國海洋大學 2010
[4]C2H2型鋅指蛋白--ZNFD的生物學功能初探[D]. 雷陳.蘇州大學 2010



本文編號：3212710