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群體感應淬滅酶YtnP對草魚腸道菌群多樣性及免疫響應調控作用的研究

發(fā)布時間:2021-06-01 21:11
  群體感應及其淬滅作用是近年來在微生態(tài)領域最為重要的發(fā)現(xiàn)之一。微生物間通過群體感應與淬滅作用建立細胞-細胞間的通訊連接,并在微生物間生態(tài)競爭與動態(tài)平衡中發(fā)揮重要作用。目前群體感應淬滅已經(jīng)成為抗細菌感染研究的熱點領域。然而生物體是一個整體系統(tǒng),微生物與宿主間存在復雜的相互作用關系。群體感應淬滅機制在發(fā)揮抗菌作用的同時,對腸道微生態(tài)系統(tǒng)的作用規(guī)律尚未知曉,亟需進行科學的研究與評價。本論文通過高通量測序與宏基因組技術,研究了外源添加群體感應淬滅酶YtnP對草魚腸道菌群多樣性及其相關功能基因的影響,揭示了群體感應淬滅作用與宿主腸道菌群間的相互關系,為其在水產(chǎn)養(yǎng)殖上應用提供理論依據(jù)。1.單一添加群體感應淬滅酶YtnP對草魚腸道菌群的作用規(guī)律選取30條體重25±1g的草魚隨機分為兩組,每組三個平行,試驗組注射體積100μL濃度為25μg/m L的的重組純化YtnP,進行了周期48h的急性試驗。在試驗的24 h、48 h分別采取草魚腸道及內容物進行16S r RNA測序。結果表明對照組和試驗組樣品的OTU分別為142±102和143±67;試驗組腸道菌群的Alpha多樣性指數(shù)差異均不顯著(P>0... 

【文章來源】:上海海洋大學上海市

【文章頁數(shù)】:93 頁

【學位級別】:碩士

【部分圖文】:

群體感應淬滅酶YtnP對草魚腸道菌群多樣性及免疫響應調控作用的研究


用群體感應限制霍亂弧菌的定植

群體感應淬滅酶YtnP對草魚腸道菌群多樣性及免疫響應調控作用的研究


門分類水平的熱圖

分布情況,優(yōu)勢菌,豐度,桿菌


上海海洋大學碩士學位論文15圖2-2門水平上各腸段的優(yōu)勢菌群及相對豐度。分組A、B、C:(24h及48h)對照組前、中、后腸;分組D、E、F:(24h及48h)試驗組前、中、后腸。Figure2-2Dominantfloraandrelativeabundanceofeachintestinalsegmentatthelevelofphylum.GroupA、B、C:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineofcontrolgroup;GroupD、E、F:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineoftreatmentgroup.2.2.2.2屬分類水平的結果分析在屬分類水平上取相對豐度最高的前10種OTU相對應的菌群進行統(tǒng)計分析,結果表明:對照組中優(yōu)勢物種為鯨桿菌屬(Cetobacterium)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、未特指消化鏈球菌屬(Unspecified_Peptostreptococcaceae)、勞森菌屬(Lawsonia)、紅桿菌屬(Rhodobacter)、Unspecified_TM7_3、未特指根瘤菌屬(Unspecified_Rhizobiales),其他屬占比不足1%。試驗組中優(yōu)勢物種為鯨桿菌屬(Cetobacterium)、諾卡氏菌屬(Nocardia)、分枝桿菌屬(Mycobacterium)、未特指根瘤菌屬(Unspecified_Rhizobiales)、未特指的微桿菌屬(Unspecified_Microbacteriaceae)、紅桿菌屬(Rhodobacter)、紅球菌屬(Rhodococcus),其他屬占比不足1%(見表2-4)。不同腸段的菌群豐度在屬水平上有差異,主要表現(xiàn)在各組別中腸和后腸的鯨桿菌屬的豐度高,前腸低;各組別前腸和中腸的諾卡氏菌屬豐度高,后腸低;而對照組前腸和后腸的未特指消化鏈球菌屬的豐度高,試驗組各腸段未特指消化鏈球菌屬豐度均較低;其余物種屬水平上不同腸段的分布情況見圖2-4。

【參考文獻】:
期刊論文
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[3]纖維單胞菌屬放線菌的研究進展[J]. 石云雷,余利巖,張玉琴.  微生物學報. 2019(01)
[4]美洲大蠊腸道內生微桿菌的分離鑒定及其抑菌活性研究[J]. 劉凌燕,陳志宇,曾還雄,林培彬,金小寶.  生物技術通報. 2018(06)
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[6]益生芽孢桿菌對動物免疫功能影響研究進展[J]. 谷笑笑,王振華,潘康成.  微生物學通報. 2016(09)
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[8]嗜水氣單胞菌毒力因子檢測及不同毒力基因型菌株對劍尾魚的致病性研究[J]. 任燕,孫承文,石存斌,潘厚軍,陶家發(fā),吳淑勤.  廣東農(nóng)業(yè)科學. 2015(17)
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博士論文
[1]淬滅酶及沙蒿多糖對綿羊瘤胃微生態(tài)和營養(yǎng)代謝及免疫影響研究[D]. 李勝利.內蒙古農(nóng)業(yè)大學 2016

碩士論文
[1]地衣芽孢桿菌T-1群體感應淬滅基因ytnP的克隆表達及其功能研究[D]. 彭孟凡.上海海洋大學 2018
[2]腸道菌群群體感應抑制劑協(xié)同解毒祛瘀滋陰方治療MRL/lpr小鼠的作用研究[D]. 謝朵麗.浙江中醫(yī)藥大學 2018
[3]感染嗜水氣單胞菌草魚腸道菌群結構研究[D]. 李東亮.西北農(nóng)林科技大學 2016



本文編號:3210160

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