基于線粒體控制區(qū)序列的花斑蛇鯔遺傳多態(tài)性分析
發(fā)布時間:2021-05-26 15:17
花斑蛇鯔(Sauridaundosquamis)是一種重要的底層經(jīng)濟魚類,本研究利用線粒體控制區(qū)(D-loop區(qū))序列分析了中國近海分布的花斑蛇鯔的遺傳結構和遺傳多樣性,一共測定了6個地理群體129尾樣本的D-loop區(qū)全序列。結果顯示,全長為921bp的序列包含71個多態(tài)性位點,共檢測到101個單倍型;ò呱啧櫩傮w呈現(xiàn)很高的單倍型多樣性(0.9873±0.0048)和較低的核苷酸多樣性(0.0132±0.0067)的特征;卩徑臃嫿ǖ膯伪缎拖到y(tǒng)發(fā)育樹的拓撲結構很淺,沒有形成分化明顯的支系。單倍型在各個地理群體中的分布呈分散交叉狀態(tài),表明地理群體間沒有顯著的遺傳分化。6個群體的分子方差分析顯示,花斑蛇鯔絕大部分的遺傳變異(99.87%)來源于群體內(nèi)的個體之間,而群體間的變異僅占0.13%。大部分地理群體之間的遺傳分化指數(shù)(FST)均很小,揭示了群體間的基因交流很頻繁,存在高度的遺傳同質(zhì)性。這些研究結果表明中國近海的花斑蛇鯔遺傳多樣性豐富,沒有明顯的遺傳分化,是一個隨機交配群,可以作為同一個漁業(yè)單元來管理。
【文章來源】:熱帶海洋學報. 2020,39(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 基因組DNA提取
1.3 PCR擴增與測序
1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結果
2.1 序列特征及遺傳多樣性
2.2 單倍型系統(tǒng)發(fā)育關系
2.3 種群遺傳結構
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于線粒體控制區(qū)的中國近海棘頭梅童魚群體遺傳結構研究[J]. 梁述章,宋煒,馬春艷,蔣科技,張鳳英,趙明,馬凌波. 海洋漁業(yè). 2019(02)
[2]南海北部陸架水域多齒蛇鯔與花斑蛇鯔的年齡與生長[J]. 江艷娥,許友偉,范江濤,孫銘帥,楊玉滔,張魁,張俊,黃梓榮,林昭進,陳作志. 中國水產(chǎn)科學. 2019(01)
[3]基于線粒體DNA D-loop序列的黃斑籃子魚群體遺傳多樣性分析[J]. 黃小林,李文俊,林黑著,楊育凱,李濤,虞為,黃忠. 熱帶海洋學報. 2018(04)
[4]南海北部近海漁業(yè)資源群落結構及其多樣性現(xiàn)狀[J]. 蔡研聰,徐姍楠,陳作志,許友偉,江艷娥,楊長平. 南方水產(chǎn)科學. 2018(02)
[5]南海區(qū)2種桁桿蝦拖網(wǎng)漁獲組成調(diào)查與分析[J]. 楊炳忠,楊吝,譚永光,晏磊,張鵬,李杰. 南方水產(chǎn)科學. 2017(06)
[6]中國近海細鱗鯻線粒體控制區(qū)的遺傳多樣性[J]. 楊喜書,章群,薛丹,呂金磊,黃鎮(zhèn)宇,盧麗鋒. 生態(tài)學報. 2018(05)
[7]基于線粒體控制區(qū)的中國南海海域卵形鯧鲹遺傳多樣性[J]. 呂金磊,章群,楊喜書,宮亞運,曹艷. 海洋漁業(yè). 2017(03)
[8]基于線粒體控制區(qū)部分序列的南海大斑石鱸遺傳多樣性分析[J]. 郜星晨,章群,薛丹,宮亞運,曹艷,韓博平. 海洋科學. 2016(07)
[9]南沙南部陸架海域漁業(yè)資源聲學評估[J]. 張俊,陳國寶,陳作志,于杰,范江濤,邱永松. 南方水產(chǎn)科學. 2015(05)
[10]南沙西南陸架海域底拖網(wǎng)漁獲物組成及生物多樣性[J]. 許友偉,陳作志,范江濤,張俊. 南方水產(chǎn)科學. 2015(05)
本文編號:3206598
【文章來源】:熱帶海洋學報. 2020,39(04)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:8 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 實驗材料
1.2 基因組DNA提取
1.3 PCR擴增與測序
1.4 數(shù)據(jù)分析
2 結果
2.1 序列特征及遺傳多樣性
2.2 單倍型系統(tǒng)發(fā)育關系
2.3 種群遺傳結構
3 討論
【參考文獻】:
期刊論文
[1]基于線粒體控制區(qū)的中國近海棘頭梅童魚群體遺傳結構研究[J]. 梁述章,宋煒,馬春艷,蔣科技,張鳳英,趙明,馬凌波. 海洋漁業(yè). 2019(02)
[2]南海北部陸架水域多齒蛇鯔與花斑蛇鯔的年齡與生長[J]. 江艷娥,許友偉,范江濤,孫銘帥,楊玉滔,張魁,張俊,黃梓榮,林昭進,陳作志. 中國水產(chǎn)科學. 2019(01)
[3]基于線粒體DNA D-loop序列的黃斑籃子魚群體遺傳多樣性分析[J]. 黃小林,李文俊,林黑著,楊育凱,李濤,虞為,黃忠. 熱帶海洋學報. 2018(04)
[4]南海北部近海漁業(yè)資源群落結構及其多樣性現(xiàn)狀[J]. 蔡研聰,徐姍楠,陳作志,許友偉,江艷娥,楊長平. 南方水產(chǎn)科學. 2018(02)
[5]南海區(qū)2種桁桿蝦拖網(wǎng)漁獲組成調(diào)查與分析[J]. 楊炳忠,楊吝,譚永光,晏磊,張鵬,李杰. 南方水產(chǎn)科學. 2017(06)
[6]中國近海細鱗鯻線粒體控制區(qū)的遺傳多樣性[J]. 楊喜書,章群,薛丹,呂金磊,黃鎮(zhèn)宇,盧麗鋒. 生態(tài)學報. 2018(05)
[7]基于線粒體控制區(qū)的中國南海海域卵形鯧鲹遺傳多樣性[J]. 呂金磊,章群,楊喜書,宮亞運,曹艷. 海洋漁業(yè). 2017(03)
[8]基于線粒體控制區(qū)部分序列的南海大斑石鱸遺傳多樣性分析[J]. 郜星晨,章群,薛丹,宮亞運,曹艷,韓博平. 海洋科學. 2016(07)
[9]南沙南部陸架海域漁業(yè)資源聲學評估[J]. 張俊,陳國寶,陳作志,于杰,范江濤,邱永松. 南方水產(chǎn)科學. 2015(05)
[10]南沙西南陸架海域底拖網(wǎng)漁獲物組成及生物多樣性[J]. 許友偉,陳作志,范江濤,張俊. 南方水產(chǎn)科學. 2015(05)
本文編號:3206598
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