大鯢（Andrias davidianus），是現(xiàn)存最大的有尾兩棲類動(dòng)物，同時(shí)也是我國獨(dú)有的珍惜保護(hù)動(dòng)物，具有很高的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。由于上世紀(jì)末人為大量捕殺和生存環(huán)境的惡化，野生大鯢數(shù)量銳減。近年來，由于人工養(yǎng)殖技術(shù)和繁殖技術(shù)不斷地提高，養(yǎng)殖規(guī)模的不斷擴(kuò)大，大鯢養(yǎng)殖群體數(shù)量得到了快速的恢復(fù)，但是野生種群依然沒有得到有效的恢復(fù)。加之由于公共數(shù)據(jù)庫中缺乏大鯢的遺傳信息和基因序列，使得有關(guān)大鯢的免疫抗病機(jī)制和遺傳背景的研究難以深入，因而很難從根本上解決大鯢人工養(yǎng)殖過程中的疾病防治和大鯢野生資源保護(hù)所面臨的問題。本研究利用Illumina paired-end技術(shù)對(duì)大鯢皮膚和脾臟進(jìn)行轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析。并在此基礎(chǔ)上利用所獲得的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)對(duì)大鯢皮膚和脾臟進(jìn)行組織差異表達(dá)分析，篩選獲得皮膚和脾臟特異表達(dá)的免疫基因，并采用實(shí)時(shí)定量PCR對(duì)部分特異表達(dá)免疫基因進(jìn)行了表達(dá)模式分析，同時(shí)篩選一批新的EST-SSR位點(diǎn)，取得如下結(jié)果：1.通過測(cè)序，從大鯢皮膚和脾臟分別獲得20,698,732和20,587,272轉(zhuǎn)錄組測(cè)序原始數(shù)據(jù)，總長度分別為4,180,811,139bp和4,158,044,544bp。經(jīng)過組裝，... 

【文章來源】：西北農(nóng)林科技大學(xué)陜西省 211工程院校 985工程院校 教育部直屬院校

【文章頁數(shù)】：66 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1.1 大鯢研究進(jìn)展
        1.1.1 大鯢功能基因研究進(jìn)展
        1.1.2 大鯢遺傳多樣性研究進(jìn)展
    1.2 第二代測(cè)序技術(shù)研究進(jìn)展
        1.2.1 RNA-seq 技術(shù)簡(jiǎn)介
        1.2.2 RNA-seq 技術(shù)應(yīng)用
    1.3 EST-SSR 分子標(biāo)記研究進(jìn)展
    1.4 研究的目的與意義
第二章 大鯢皮膚和脾臟轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及轉(zhuǎn)錄本分析
    2.1 引言
    2.2 材料方法
        2.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        2.2.2 主要實(shí)驗(yàn)設(shè)備
        2.2.3 主要生物信息分析軟件
        2.2.4 實(shí)驗(yàn)方法
    2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        2.3.1 序列組裝拼接
        2.3.2 大鯢脾臟和皮膚轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫分析
        2.3.3 EST-SSR 分子標(biāo)記的篩選及分析
    2.4 討論
        2.4.1 大鯢脾臟和皮膚轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及序列拼接
        2.4.2 大鯢脾臟和皮膚基因功能分布及免疫基因組成特點(diǎn)
        2.4.3 EST-SSR 出現(xiàn)頻率和分布特點(diǎn)
    2.5 小結(jié)
第三章 大鯢免疫基因篩選鑒定及表達(dá)分析
    3.1 引言
    3.2 材料方法
        3.2.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
        3.2.2 主要實(shí)驗(yàn)設(shè)備
        3.2.3 實(shí)驗(yàn)方法
    3.3 結(jié)果
        3.3.1 組織特異性表達(dá)分析及免疫基因的篩選
        3.3.3 大鯢皮膚和脾臟主要免疫基因表達(dá)模式分析
        3.3.4 大鯢皮膚和脾臟主要免疫基因細(xì)胞定位
    3.4 討論
        3.4.1 組織差異表達(dá)分析及免疫基因的篩選
        3.4.3 大鯢皮膚和脾臟主要免疫基因表達(dá)模式分析
    3.5 小結(jié)
第四章 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
    結(jié)論
    創(chuàng)新點(diǎn)
    進(jìn)一步研究?jī)?nèi)容
參考文獻(xiàn)
附錄
致謝
作者簡(jiǎn)介


【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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本文編號(hào)：3205537