3種色型仿刺參線粒體和核糖體序列片段遺傳結(jié)構(gòu)比較研究
發(fā)布時間:2021-05-25 13:29
仿刺參作為我國重要的海水養(yǎng)殖物種,良種選育是目前研究的重點(diǎn),其中體色是重要的考慮因素之一。為了比較3種不同體色仿刺參的遺傳結(jié)構(gòu),采用PCR擴(kuò)增與測序技術(shù)對我國3種體色(青色、白色和紫色)仿刺參線粒體16S rRNA和COⅠ與核糖體18S rRNA-ITS-28S rRNA序列片段進(jìn)行分析,揭示其遺傳結(jié)構(gòu)差異及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明,16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列長度分別為812~830 bp、877~915 bp、1 536~1 572 bp。16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列在青色、紫色和白色仿刺參中分別檢測到單倍型個數(shù)分別為4/5/5、5/3/4和4/4/3,COⅠ序列多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)目所比例最大,16S rRNA序列最小。3種色型仿刺參16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列遺傳距離數(shù)值均比較小,范圍分別為0~0.014 7、0~0.021 2和0~0.010 3,沒有達(dá)到種的分化水平。以紫海膽為外群,基于COⅠ序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果表明白刺參單獨(dú)聚為一支,但是紫色和青色...
【文章來源】:山東大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2020,55(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 實驗材料與方法
1.1 樣本采集及處理
1.2 DNA提取、PCR擴(kuò)增及測序
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 3種色型仿刺參16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列特征分析
2.2 3種色型仿刺參群體遺傳多樣性分析
2.3 遺傳距離分析
2.4 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]光照對白刺參、青刺參和紫刺參生長、消化及免疫的影響[J]. 李靜,劉佳亮,曹學(xué)彬,王福辰,李君華,鄭龍華,郭治誠,孫路平,劉石林. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2020(02)
[2]基于多個線粒體序列的中韓俄沿海不同地理群體刺參的遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu)分析[J]. 王錦錦,廖梅杰,李彬,王印庚,榮小軍,張正,葛建龍. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2020(01)
[3]仿刺參線粒體全基因組序列結(jié)構(gòu)及比較研究[J]. 李云峰,李夢遙,王健,高祥剛,赫崇波,周遵春,楊愛馥. 水產(chǎn)科學(xué). 2012(08)
[4]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)
博士論文
[1]不同色型仿刺參Apostichopus japonicus(Selenka)環(huán)境適應(yīng)性與營養(yǎng)需求的比較研究[D]. 柏雨岑.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]基于高通量測序的刺參白化發(fā)生和子代體色分離研究[D]. 馬得友.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2013
本文編號:3205422
【文章來源】:山東大學(xué)學(xué)報(理學(xué)版). 2020,55(11)北大核心CSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
0 引言
1 實驗材料與方法
1.1 樣本采集及處理
1.2 DNA提取、PCR擴(kuò)增及測序
1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
2.1 3種色型仿刺參16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列特征分析
2.2 3種色型仿刺參群體遺傳多樣性分析
2.3 遺傳距離分析
2.4 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
3 討 論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]光照對白刺參、青刺參和紫刺參生長、消化及免疫的影響[J]. 李靜,劉佳亮,曹學(xué)彬,王福辰,李君華,鄭龍華,郭治誠,孫路平,劉石林. 大連海洋大學(xué)學(xué)報. 2020(02)
[2]基于多個線粒體序列的中韓俄沿海不同地理群體刺參的遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu)分析[J]. 王錦錦,廖梅杰,李彬,王印庚,榮小軍,張正,葛建龍. 漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2020(01)
[3]仿刺參線粒體全基因組序列結(jié)構(gòu)及比較研究[J]. 李云峰,李夢遙,王健,高祥剛,赫崇波,周遵春,楊愛馥. 水產(chǎn)科學(xué). 2012(08)
[4]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟. 中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)
博士論文
[1]不同色型仿刺參Apostichopus japonicus(Selenka)環(huán)境適應(yīng)性與營養(yǎng)需求的比較研究[D]. 柏雨岑.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]基于高通量測序的刺參白化發(fā)生和子代體色分離研究[D]. 馬得友.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2013
本文編號:3205422
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