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3種色型仿刺參線粒體和核糖體序列片段遺傳結(jié)構(gòu)比較研究

發(fā)布時(shí)間:2021-05-25 13:29
  仿刺參作為我國重要的海水養(yǎng)殖物種,良種選育是目前研究的重點(diǎn),其中體色是重要的考慮因素之一。為了比較3種不同體色仿刺參的遺傳結(jié)構(gòu),采用PCR擴(kuò)增與測(cè)序技術(shù)對(duì)我國3種體色(青色、白色和紫色)仿刺參線粒體16S rRNA和COⅠ與核糖體18S rRNA-ITS-28S rRNA序列片段進(jìn)行分析,揭示其遺傳結(jié)構(gòu)差異及系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系。結(jié)果表明,16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列長(zhǎng)度分別為812~830 bp、877~915 bp、1 536~1 572 bp。16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列在青色、紫色和白色仿刺參中分別檢測(cè)到單倍型個(gè)數(shù)分別為4/5/5、5/3/4和4/4/3,COⅠ序列多態(tài)性位點(diǎn)數(shù)目所比例最大,16S rRNA序列最小。3種色型仿刺參16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列遺傳距離數(shù)值均比較小,范圍分別為0~0.014 7、0~0.021 2和0~0.010 3,沒有達(dá)到種的分化水平。以紫海膽為外群,基于COⅠ序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,結(jié)果表明白刺參單獨(dú)聚為一支,但是紫色和青色... 

【文章來源】:山東大學(xué)學(xué)報(bào)(理學(xué)版). 2020,55(11)北大核心CSCD

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
0 引言
1 實(shí)驗(yàn)材料與方法
    1.1 樣本采集及處理
    1.2 DNA提取、PCR擴(kuò)增及測(cè)序
    1.3 數(shù)據(jù)處理
2 結(jié)果與分析
    2.1 3種色型仿刺參16S rRNA、COⅠ和18S rRNA-ITS-28S rRNA序列特征分析
    2.2 3種色型仿刺參群體遺傳多樣性分析
    2.3 遺傳距離分析
    2.4 系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
3 討 論


【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]光照對(duì)白刺參、青刺參和紫刺參生長(zhǎng)、消化及免疫的影響[J]. 李靜,劉佳亮,曹學(xué)彬,王福辰,李君華,鄭龍華,郭治誠,孫路平,劉石林.  大連海洋大學(xué)學(xué)報(bào). 2020(02)
[2]基于多個(gè)線粒體序列的中韓俄沿海不同地理群體刺參的遺傳多樣性及種群結(jié)構(gòu)分析[J]. 王錦錦,廖梅杰,李彬,王印庚,榮小軍,張正,葛建龍.  漁業(yè)科學(xué)進(jìn)展. 2020(01)
[3]仿刺參線粒體全基因組序列結(jié)構(gòu)及比較研究[J]. 李云峰,李夢(mèng)遙,王健,高祥剛,赫崇波,周遵春,楊愛馥.  水產(chǎn)科學(xué). 2012(08)
[4]4種海參16S rRNA和COI基因片段序列比較及系統(tǒng)學(xué)研究[J]. 陳麗梅,李琪,李赟.  中國水產(chǎn)科學(xué). 2008(06)

博士論文
[1]不同色型仿刺參Apostichopus japonicus(Selenka)環(huán)境適應(yīng)性與營養(yǎng)需求的比較研究[D]. 柏雨岑.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2016
[2]基于高通量測(cè)序的刺參白化發(fā)生和子代體色分離研究[D]. 馬得友.中國科學(xué)院研究生院(海洋研究所) 2013



本文編號(hào):3205422

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